Thermus thermophilus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 1 （Q5SIT5） CALCIUM ION × 5 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 1 （Q5SIT5） SODIUM ION × 3 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | VATE_THET8 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–187； UniProt 2–188 作者链 Y； PDB构建体 1–187； UniProt 2–188 |
Thermus thermophilus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | V-type ATP synthase subunit E × 1 （P74901） CALCIUM ION × 5 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | V-type ATP synthase subunit E × 1 （P74901） SODIUM ION × 3 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q5SIT5_THET8 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 2–105； UniProt 17–120 作者链 X； PDB构建体 2–105； UniProt 17–120 |
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| 条目编号 entry_id | 3v6i |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-12-19 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the peripheral stalk of Thermus thermophilus H+-ATPase/synthase at 2.25 A resolution |
| 关键词 keywords | peripheral stator stalk, right handed coiled-coil, ATPase/synthase, ATP Binding, Membrane, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 46.29 Å |
| Rg（电子密度） | 48.57 Å |
| 总 Rg | 48.58 Å |
| 原子数 | 2036 |
| 残基数 | 288 |
| 排除体积 | 36747 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 3v6iA01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 620 — F1F0 ATP synthase subunit B, membrane domain |
| 结构域编号 domain_id | 3v6iA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 2320 — hypothetical protein PF0899 fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — ATP synthase, E subunit, C-terminal |
| 结构域编号 domain_id | 3v6iB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 2950 — |
| 结构域编号 domain_id | 3v6iX00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 2950 — |
| 结构域编号 domain_id | 3v6iY01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 620 — F1F0 ATP synthase subunit B, membrane domain |
| 结构域编号 domain_id | 3v6iY02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 2320 — hypothetical protein PF0899 fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — ATP synthase, E subunit, C-terminal |