3va4

Crystal structure of the mammalian MDC1 FHA domain complexed with CHK2 pThr68 peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mediator of DNA damage checkpoint protein 1

Mus musculus

UniProt Q5PSV9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Serine/threonine-protein kinase Chk2 × 1 (O96017) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MDC1_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 22–132; UniProt 29–139 作者链 B; PDB构建体 22–132; UniProt 29–139

Serine/threonine-protein kinase Chk2

物种未注明

UniProt O96017

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Mediator of DNA damage checkpoint protein 1 × 2 (Q5PSV9) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CHK2_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–11; UniProt 63–73

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3va4
沉积日期 deposition_date2011-12-28
结构标题 titleCrystal structure of the mammalian MDC1 FHA domain complexed with CHK2 pThr68 peptide
关键词 keywordsCELL CYCLE, FHA domain, DNA-damage, CHK2 and MDC1 dimerization; CELL CYCLE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3va4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3va4__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3va4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.29 Å
Rg(电子密度)18.40 Å
总 Rg19.38 Å
原子数1782
残基数226
排除体积31786 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3va4__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id3va4A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20
结构域编号 domain_id3va4B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20

7. 引用文献 (1)