3vjb

Crystal structure of the human squalene synthase

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Squalene synthase

Homo sapiens

UniProt P37268

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FDFT_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–343; UniProt 31–370 作者链 B; PDB构建体 4–343; UniProt 31–370 作者链 C; PDB构建体 4–343; UniProt 31–370 作者链 D; PDB构建体 4–343; UniProt 31–370 作者链 E; PDB构建体 4–343; UniProt 31–370 作者链 F; PDB构建体 4–343; UniProt 31–370

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3vjb
沉积日期 deposition_date2011-10-14
结构标题 titleCrystal structure of the human squalene synthase
关键词 keywordsFarnesyl-diphosphate farnesyltransferase, Head-to-head synthases, Cholesterol biosynthesis, Oxidoreductase, Transferase; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3vjb__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3vjb__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3vjb__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)33.09 Å
Rg(电子密度)32.18 Å
总 Rg32.67 Å
原子数7956
残基数983
排除体积141980 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3vjb__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3vjb__assembly_2__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd3vjba_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.2 — Squalene synthase
结构域编号 domain_idd3vjbb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.2 — Squalene synthase
结构域编号 domain_idd3vjbc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.2 — Squalene synthase
结构域编号 domain_idd3vjbd_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.2 — Squalene synthase
结构域编号 domain_idd3vjbe_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.2 — Squalene synthase
结构域编号 domain_idd3vjbf_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.128 — Terpenoid synthases
超家族 Superfamily superfamilya.128.1 — Terpenoid synthases
家族 Family familya.128.1.2 — Squalene synthase

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id3vjbA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase
结构域编号 domain_id3vjbB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase
结构域编号 domain_id3vjbC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase
结构域编号 domain_id3vjbD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase
结构域编号 domain_id3vjbE00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase
结构域编号 domain_id3vjbF00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology600 — Farnesyl Diphosphate Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Farnesyl Diphosphate Synthase

7. 引用文献 (1)