Mus musculus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*GP*TP*CP*AP*CP*TP*AP*CP*(5CM)P*GP*GP*AP*CP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*GP*TP*CP*(5CM)P*GP*GP*TP*AP*GP*TP*GP*AP*CP*T)-3') ; × 1 ACETATE ION × 6 1,2-ETHANEDIOL × 3 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | MBD4_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–69； UniProt 69–136 |
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| 条目编号 entry_id | 3vxx |
| 沉积日期 deposition_date | 2012-09-21 |
| 结构标题 title | Crystal structure of methyl CpG binding domain of MBD4 in complex with the 5mCG/5mCG sequence |
| 关键词 keywords | methyl CpG binding domain, protein-DNA complex, versatile base recognition, HYDROLASE-DNA complex; HYDROLASE/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.74 Å |
| Rg（电子密度） | 20.59 Å |
| 总 Rg | 21.08 Å |
| 原子数 | 1117 |
| 残基数 | 89 |
| 排除体积 | 18230 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 3vxxA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 890 — Methyl-cpg-binding Protein 2; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Methyl-cpg-binding Protein 2; Chain A |