3x29

CRYSTAL STRUCTURE of MOUSE CLAUDIN-19 IN COMPLEX with C-TERMINAL FRAGMENT OF CLOSTRIDIUM PERFRINGENS ENTEROTOXIN

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Claudin-19

Mus musculus

UniProt Q9ET38

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Heat-labile enterotoxin B chain × 1 (P01558) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Heat-labile enterotoxin B chain × 1 (P01558) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CLD19_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–185; UniProt 1–185 作者链 C; PDB构建体 1–185; UniProt 1–185

Heat-labile enterotoxin B chain

Clostridium perfringens

UniProt P01558

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Claudin-19 × 1 (Q9ET38) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Claudin-19 × 1 (Q9ET38) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELTB_CLOPF
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 3–119; UniProt 203–319 作者链 D; PDB构建体 3–119; UniProt 203–319

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3x29
沉积日期 deposition_date2014-12-13
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE of MOUSE CLAUDIN-19 IN COMPLEX with C-TERMINAL FRAGMENT OF CLOSTRIDIUM PERFRINGENS ENTEROTOXIN
关键词 keywordsTOXIN-CELL ADHESION COMPLEX, TIGHT JUNCTION, CELL ADHESION, ENTEROTOXIN, MEMBRANE PROTEIN, RECEPTOR BINDING; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3x29__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3x29__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3x29__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.64 Å
Rg(电子密度)22.64 Å
总 Rg23.33 Å
原子数2078
残基数280
排除体积37332 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3x29__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3x29__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3x29a_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.63 — Claudin-like
超家族 Superfamily superfamilyf.63.1 — Claudin-like
家族 Family familyf.63.1.1 — Claudin
结构域编号 domain_idd3x29b_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family familyb.18.1.37 — Clostridium perfringens enterotoxin (CPE), C-terminal domain
结构域编号 domain_idd3x29c_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.63 — Claudin-like
超家族 Superfamily superfamilyf.63.1 — Claudin-like
家族 Family familyf.63.1.1 — Claudin
结构域编号 domain_idd3x29d_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family familyb.18.1.37 — Clostridium perfringens enterotoxin (CPE), C-terminal domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3x29A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 —
结构域编号 domain_id3x29B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1050 —
结构域编号 domain_id3x29C00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology140 — Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 —
结构域编号 domain_id3x29D00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1050 —
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7. 引用文献 (1)