Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ;(1R,3R)-5-[(2Z)-2-[(1R,3aS,7aR)-7a-methyl-1-[(2R)-6-methyl-6-oxidanyl-heptan-2-yl]-2,3,3a,5,6,7-hexahydro-1H-inden-4-ylidene]ethylidene]cyclohexane-1,3-diol ; × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | VDR_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–51； UniProt 118–164 作者链 A； PDB构建体 52–263； UniProt 216–427 |
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| 条目编号 entry_id | 3x36 |
| 沉积日期 deposition_date | 2015-01-16 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the human vitamin D receptor ligand binding domain complexed with 7,8-cis-1a,25-Dihydroxy-19-norvitamin D3 |
| 关键词 keywords | TRANSCRIPTION, HORMONE RECEPTOR; TRANSCRIPTION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.97 Å |
| Rg（电子密度） | 18.70 Å |
| 总 Rg | 19.69 Å |
| 原子数 | 2051 |
| 残基数 | 254 |
| 排除体积 | 36941 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3x36a_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.123 — Nuclear receptor ligand-binding domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.123.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain |
| 家族 Family family | a.123.1.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain |
| 结构域编号 domain_id | 3x36A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 565 — Retinoid X Receptor |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Retinoid X Receptor |