SAXSdb — 4a1x

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NONSTRUCTURAL PROTEIN 4A, SERINE PROTEASE NS3

HEPATITIS C VIRUS SUBTYPE 1B

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CP5-46-A PEPTIDE × 1 ZINC ION × 1 CHLORIDE ION × 7 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	CP5-46-A PEPTIDE × 1 ZINC ION × 1 CHLORIDE ION × 6 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_HCVJA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–13； UniProt 1678–1690 作者链 A； PDB构建体 17–195； UniProt 1028–1206 作者链 B； PDB构建体 17–195； UniProt 1028–1206

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4a1x
沉积日期 deposition_date	2011-09-20
结构标题 title	Co-Complex structure of NS3-4A protease with the inhibitory peptide CP5-46-A (Synchrotron data)
关键词 keywords	HYDROLASE-PEPTIDE COMPLEX, UNMODIFIED INHIBITORY PEPTIDES; HYDROLASE/PEPTIDE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4a1x__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4a1x__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4a1x__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	17.18 Å
Rg（电子密度）	15.97 Å
总 Rg	17.19 Å
原子数	1535
残基数	208
排除体积	27372 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4a1x__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4a1x__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NONSTRUCTURAL PROTEIN 4A, SERINE PROTEASE NS3
分子量 formula_weight	21385.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.98, 3.6.1.15, 3.6.4.13
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3397

GSVVIVGRIILSGKGGPITAYSQQTRGLLGCIITSLTGRDRNQVEGEVQVVSTATQSFLATCVNGVCWTVYHGAGSKTLAGPKGPITQMYTNVDQDLVGWQAPPGARSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPVSYLKGSSGGPLLCPSGHAVGIFRAAVCTRGVAKAVDFVPVESMETTMRGSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	HEPATITIS C VIRUS SUBTYPE 1B
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	31647
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CP5-46-A PEPTIDE
分子量 formula_weight	2304.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

GELGRLVYLLDGPGYDPIHCD

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	13

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	193

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4a1xA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	4a1xA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	4a1xB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	4a1xB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

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晶胞边长 a length_a	93.320 Å
晶胞边长 b length_b	93.320 Å
晶胞边长 c length_c	82.400 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 61
空间群编号 int_tables_number	169
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	80.820 Å
R 因子 r_factor	0.1841
R_work r_work	0.1824
R_free r_free	0.1824

Co-Complex structure of NS3-4A protease with the inhibitory peptide CP5-46-A (Synchrotron data)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NONSTRUCTURAL PROTEIN 4A, SERINE PROTEASE NS3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4a1x__assembly_2__model_1

4a1x__assembly_2__model_1 | I(q)

4a1x__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Co-Complex structure of NS3-4A protease with the inhibitory peptide CP5-46-A (Synchrotron data)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NONSTRUCTURAL PROTEIN 4A, SERINE PROTEASE NS3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4a1x__assembly_2__model_1

4a1x__assembly_2__model_1 | I(q)

4a1x__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)