SAXSdb — 4aze

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1A

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1A × 1 5-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-2-(phenylamino)-4H-imidazol-4-one × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1A × 1 5-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-2-(phenylamino)-4H-imidazol-4-one × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1A × 1 5-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-2-(phenylamino)-4H-imidazol-4-one × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DYR1A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 25–382； UniProt 128–485 作者链 B； PDB构建体 25–382； UniProt 128–485 作者链 C； PDB构建体 25–382； UniProt 128–485

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4aze
沉积日期 deposition_date	2012-06-25
结构标题 title	Human DYRK1A in complex with Leucettine L41
关键词 keywords	TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4aze__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4aze__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4aze__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.93 Å
Rg（电子密度）	21.75 Å
总 Rg	22.58 Å
原子数	2861
残基数	348
排除体积	51129 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4aze__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4aze__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4aze__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1A
分子量 formula_weight	44633.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.12.1, 2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	8613

MHHHHHHSSGVDLGTENLYFQSMSSHKKERKVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKKTADE

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1A
分子量 formula_weight	440.4 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.12.1, 2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G

XSXX

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	5-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-2-(phenylamino)-4H-imidazol-4-one
分子量 formula_weight	307.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4azeb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	4azeA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	4azeA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	4azeB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	4azeB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	4azeC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	4azeC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

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晶胞边长 a length_a	111.649 Å
晶胞边长 b length_b	111.649 Å
晶胞边长 c length_c	301.725 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	18

空间群 space_group	P 31 1 2
空间群编号 int_tables_number	151
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.150 Å
最低分辨率 resolution_low	100.570 Å
R 因子 r_factor	0.2190
R_work r_work	0.2175
R_free r_free	0.2483

Human DYRK1A in complex with Leucettine L41

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4aze__assembly_2__model_1

4aze__assembly_2__model_1 | I(q)

4aze__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Human DYRK1A in complex with Leucettine L41

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION-REGULATED KINASE 1A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4aze__assembly_2__model_1

4aze__assembly_2__model_1 | I(q)

4aze__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)