4b0m

Complex of the Caf1AN usher domain, Caf1M chaperone and Caf1 subunit from Yersinia pestis

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F1 CAPSULE-ANCHORING PROTEIN

YERSINIA PESTIS

UniProt P26949

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 F1 CAPSULE ANTIGEN × 1 (P26948) CHAPERONE PROTEIN CAF1M × 1 (P26926) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAF1A_YERPE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–136; UniProt 23–158

F1 CAPSULE ANTIGEN

YERSINIA PESTIS

UniProt P26948

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 F1 CAPSULE-ANCHORING PROTEIN × 1 (P26949) CHAPERONE PROTEIN CAF1M × 1 (P26926) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAF1_YERPE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–149; UniProt 22–170

CHAPERONE PROTEIN CAF1M

YERSINIA PESTIS

UniProt P26926

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 F1 CAPSULE-ANCHORING PROTEIN × 1 (P26949) F1 CAPSULE ANTIGEN × 1 (P26948) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAF1M_YERPE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–235; UniProt 24–258

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4b0m
沉积日期 deposition_date2012-07-03
结构标题 titleComplex of the Caf1AN usher domain, Caf1M chaperone and Caf1 subunit from Yersinia pestis
关键词 keywordsPROTEIN TRANSPORT, CHAPERONE-USHER PATHWAY, PILI ASSEMBLY; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4b0m__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4b0m__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4b0m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)27.38 Å
Rg(电子密度)26.76 Å
总 Rg27.45 Å
原子数3666
残基数478
排除体积65452 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4b0m__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd4b0ma_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.167 — FimD N-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.167.1 — FimD N-terminal domain-like
家族 Family familyb.167.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4b0mb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamilyb.2.3 — Bacterial adhesins
家族 Family familyb.2.3.2 — Pilus subunits
结构域编号 domain_idd4b0mm1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.11 — PapD-like
家族 Family familyb.1.11.1 — Pilus chaperone
结构域编号 domain_idd4b0mm2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.7 — C2 domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.7.2 — Periplasmic chaperone C-domain
家族 Family familyb.7.2.1 — Periplasmic chaperone C-domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id4b0mA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily410 — PapC, N-terminal domain
结构域编号 domain_id4b0mB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1090 — Fimbrial-type adhesion domain
结构域编号 domain_id4b0mM01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id4b0mM02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
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7. 引用文献 (1)