SAXSdb — 4b8l

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AURORA KINASE B-A

XENOPUS LAEVIS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	INNER CENTROMERE PROTEIN A × 1 （O13024） 9-{5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-9H-purin-6-amine × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AUKBA_XENLA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–285； UniProt 78–361

INNER CENTROMERE PROTEIN A

XENOPUS LAEVIS

UniProt O13024

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	AURORA KINASE B-A × 1 （Q6DE08） 9-{5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-9H-purin-6-amine × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	INCEA_XENLA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–44； UniProt 797–840

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4b8l
沉积日期 deposition_date	2012-08-28
结构标题 title	Aurora B kinase P353G mutant
关键词 keywords	CELL CYCLE, CANCER; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4b8l__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4b8l__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4b8l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	21.19 Å
Rg（电子密度）	20.25 Å
总 Rg	21.08 Å
原子数	2452
残基数	291
排除体积	43726 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4b8l__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	AURORA KINASE B-A
分子量 formula_weight	33604.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2466

ATALAEMPKRKFTIDDFDIGRPLGKGKFGNVYLAREKQNKFIMALKVLFKSQLEKEGVEHQLRREIEIQSHLRHPNILRMYNYFHDRKRIYLMLEFAPRGELYKELQKHGRFDEQRSATFMEELADALHYCHERKVIHRDIKPENLLMGYKGELKIADFGWSVHAPSLRRRTMCGTLDYLPPEMIEGKTHDEKVDLWCAGVLCYEFLVGMPPFDSPSHTETHRRIVNVDLKFPPFLSDGSKDLISKLLRYHPPQRLPLKGVMEHPWVKANSRRVLPGVYQSTQSKD

来源 Source

来源生物 organism	XENOPUS LAEVIS
通用名 common_name	AFRICAN CLAWED FROG
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	INNER CENTROMERE PROTEIN A
分子量 formula_weight	5073.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

PIPAWASGNLLTQAIRQQYYKPIDVDRMYGTIDSPKLEELFNKS

来源 Source

来源生物 organism	XENOPUS LAEVIS
通用名 common_name	AFRICAN CLAWED FROG
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	9-{5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-9H-purin-6-amine
分子量 formula_weight	506.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4b8la_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	4b8lA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	4b8lA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	4b8lD00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2990 —

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晶胞边长 a length_a	60.896 Å
晶胞边长 b length_b	66.314 Å
晶胞边长 c length_c	89.562 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2396
R_work r_work	0.2368
R_free r_free	0.2967

Aurora B kinase P353G mutant

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AURORA KINASE B-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

INNER CENTROMERE PROTEIN A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4b8l__assembly_1__model_1

4b8l__assembly_1__model_1 | I(q)

4b8l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Aurora B kinase P353G mutant

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AURORA KINASE B-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

INNER CENTROMERE PROTEIN A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4b8l__assembly_1__model_1

4b8l__assembly_1__model_1 | I(q)

4b8l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)