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4b9q

Open conformation of ATP-bound Hsp70 homolog DnaK

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 190.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CHAPERONE PROTEIN DNAK

ESCHERICHIA COLI

UniProt P0A6Y8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–605 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.6；291 K；28% PEG4000, 5% GLYCEROL, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 0.085 M SODIUM CITRATE PH 5.6, 5 MM ATP, 10 MM MGCL2, 291 K 分辨率 2.40 Å R-free 0.239
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–605 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.6；291 K；28% PEG4000, 5% GLYCEROL, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 0.085 M SODIUM CITRATE PH 5.6, 5 MM ATP, 10 MM MGCL2, 291 K 分辨率 2.40 Å R-free 0.239
3 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–605 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.6；291 K；28% PEG4000, 5% GLYCEROL, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 0.085 M SODIUM CITRATE PH 5.6, 5 MM ATP, 10 MM MGCL2, 291 K 分辨率 2.40 Å R-free 0.239
4 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–605 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.6；291 K；28% PEG4000, 5% GLYCEROL, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 0.085 M SODIUM CITRATE PH 5.6, 5 MM ATP, 10 MM MGCL2, 291 K 分辨率 2.40 Å R-free 0.239

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4B9Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1BPR NMR STRUCTURE OF THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1998-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 379–560（182 aa） 片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM INORGANIC PHOSPHATE；压力 1
NMR样品组成 H2O AND D2O
分辨率未提供
1DG4 NMR STRUCTURE OF THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN THE APO FORM 提交 1999-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 393–507（115 aa） 片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM NA PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM NA PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM NA PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM NA PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR样品组成 1MM U15N; 10MM PHOSPHATE BUFFER NA
NMR样品组成 1MM U15N,13C; 10MM PHOSPHATE BUFFER NA
NMR样品组成 1MM U15N,13C; 10MM PHOSPHATE BUFFER NA
NMR样品组成 1MM 10% 13C; 10MM PHOSPHATE BUFFER NA
分辨率未提供
1DKX THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 1 SELENOMETHIONYL CRYSTALS 提交 1996-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 388–606（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.288
1DKX THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 1 SELENOMETHIONYL CRYSTALS 提交 1996-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 388–606（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.288
1DKY THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 2 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 388–606（219 aa） 片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN
链 B 388–606（219 aa） 片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.309
1DKY THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 2 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 388–606（219 aa） 片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN
链 B 388–606（219 aa） 片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.309
1DKY THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 2 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 388–606（219 aa） 片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN
链 B 388–606（219 aa） 片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.309
1DKZ THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 1 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 388–606（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.274
1DKZ THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK IN COMPLEX WITH A SUBSTRATE PEPTIDE, DETERMINED FROM TYPE 1 NATIVE CRYSTALS 提交 1996-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 388–606（219 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.274
1Q5L NMR structure of the substrate binding domain of DnaK bound to the peptide NRLLLTG 提交 2003-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 392–506（115 aa） 片段：substrate binding domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM sodium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成 0.66 mM DnaK(393-507); 3.3 mM NRLLLTG; 10 mM sodium phosphate buffer, pH 7.4 | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2BPR NMR STRUCTURE OF THE SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK, 25 STRUCTURES 提交 1998-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 379–560（182 aa） 片段：SUBSTRATE BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM INORGANIC PHOSPHATE；压力 1
NMR样品组成 H2O AND D2O
分辨率未提供
2KHO NMR-RDC / XRAY structure of E. coli HSP70 (DNAK) chaperone (1-605) complexed with ADP and substrate 提交 2009-04-10 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–605（605 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 AMBIENT
NMR样品组成 0.2 MM [U-100% 13C U-100% 15N U-80% 2H] HSP70, 10 MM POTASSIUM CHLORIDE, 25 MM TRIS, 10 MM DTT, 5 MM MGCL2, 5 MM ADP, 10 MM POTASSIUM PHOSPHATE, 0.2 MM SODIUM AZIDE, 2 MM NRLLLTG, 90% H2O/ 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3DPO Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a short pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide 提交 2008-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
链 B 389–607（219 aa） 片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3DPO Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a short pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide 提交 2008-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3DPO Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a short pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide 提交 2008-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3DPP Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form A) 提交 2008-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.316
3DPP Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form A) 提交 2008-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.316
3DPQ Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form B) 提交 2008-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 389–601（213 aa） 片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.319
3DPQ Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form B) 提交 2008-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 389–601（213 aa） 片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.319
3DPQ Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form B) 提交 2008-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–601（213 aa） 片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.319
3DPQ Crystal structure of the substrate binding domain of E. coli DnaK in complex with a long pyrrhocoricin-derived inhibitor peptide (form B) 提交 2008-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–601（213 aa） 片段：Substrate binding domain (UNP residues 389 to 607)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 100 mM citric acid , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.319
3QNJ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the antimicrobial peptide oncocin 提交 2011-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.28 Å R-free 0.284
3QNJ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the antimicrobial peptide oncocin 提交 2011-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.28 Å R-free 0.284
3QNJ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the antimicrobial peptide oncocin 提交 2011-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.28 Å R-free 0.284
4E81 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with a short apidaecin peptide 提交 2012-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；2.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.259
4E81 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with a short apidaecin peptide 提交 2012-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；2.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.259
4EZN Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.238
4EZN Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.238
4EZN Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.238
4EZO Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-39 (residues 1 to 15) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.240
4EZO Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-39 (residues 1 to 15) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.240
4EZO Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-39 (residues 1 to 15) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.240
4EZP Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with A3-APO(residues 1 to 20) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.65 Å R-free 0.242
4EZP Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with A3-APO(residues 1 to 20) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.65 Å R-free 0.242
4EZP Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with A3-APO(residues 1 to 20) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.65 Å R-free 0.242
4EZP Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with A3-APO(residues 1 to 20) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.65 Å R-free 0.242
4EZQ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of pyrrhocoricin (residues 12 to 20) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.00 Å R-free 0.321
4EZQ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of pyrrhocoricin (residues 12 to 20) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.00 Å R-free 0.321
4EZQ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of pyrrhocoricin (residues 12 to 20) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.00 Å R-free 0.321
4EZQ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of pyrrhocoricin (residues 12 to 20) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.00 Å R-free 0.321
4EZR Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of drosocin (residues 12 to 19) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.290
4EZR Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of drosocin (residues 12 to 19) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.290
4EZR Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of drosocin (residues 12 to 19) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.290
4EZR Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the C-terminal part of drosocin (residues 12 to 19) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.290
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZS Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with metchnikowin (residues 20 to 26) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.2 M ammonium sulfate 0.1 M tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
4EZT Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with heliocin (residues 14 to 21) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M imidazole pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.00 Å R-free 0.271
4EZT Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with heliocin (residues 14 to 21) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M imidazole pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.00 Å R-free 0.271
4EZT Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with heliocin (residues 14 to 21) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M imidazole pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.00 Å R-free 0.271
4EZT Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with heliocin (residues 14 to 21) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；3.2 M ammonium sulfate, 0.1 M imidazole pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.00 Å R-free 0.271
4EZU Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group I222 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.276
4EZU Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group I222 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.276
4EZU Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group I222 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.276
4EZU Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group I222 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.276
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZV Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with PR-bombesin in space group P21212 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；2.8 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.259
4EZW Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLLLTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4EZW Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLLLTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4EZW Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLLLTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4EZW Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLLLTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4EZX Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLMLTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.70 Å R-free 0.209
4EZX Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLMLTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.70 Å R-free 0.209
4EZX Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLMLTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.70 Å R-free 0.209
4EZX Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLMLTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.70 Å R-free 0.209
4EZY Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLILTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；3.1 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.85 Å R-free 0.280
4EZY Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLILTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；3.1 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.85 Å R-free 0.280
4EZY Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLILTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；3.1 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.85 Å R-free 0.280
4EZY Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide NRLILTG 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；3.1 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.85 Å R-free 0.280
4EZZ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide ELPLVKI 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.05 Å R-free 0.308
4EZZ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide ELPLVKI 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.05 Å R-free 0.308
4EZZ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide ELPLVKI 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.05 Å R-free 0.308
4EZZ Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with the designer peptide ELPLVKI 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；3.0 M ammonium sulfate, 0.1 M bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.05 Å R-free 0.308
4F00 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with an apidaecin fragment from the bumblebee (residues 3 to 11) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M sodium malonate 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.95 Å R-free 0.242
4F00 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with an apidaecin fragment from the bumblebee (residues 3 to 11) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M sodium malonate 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.95 Å R-free 0.242
4F00 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with an apidaecin fragment from the bumblebee (residues 3 to 11) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M sodium malonate 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.95 Å R-free 0.242
4F00 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with an apidaecin fragment from the bumblebee (residues 3 to 11) 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；2.4 M sodium malonate 0.1 M citric acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.95 Å R-free 0.242
4F01 Crystal structure of an artificial dimeric DnaK complex 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；292 K；2.9 M ammonium sulfate 0.1 M MES pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.40 Å R-free 0.213
4F01 Crystal structure of an artificial dimeric DnaK complex 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；292 K；2.9 M ammonium sulfate 0.1 M MES pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.40 Å R-free 0.213
4F01 Crystal structure of an artificial dimeric DnaK complex 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；292 K；2.9 M ammonium sulfate 0.1 M MES pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.40 Å R-free 0.213
4HY9 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin_LYZZ (residues 1 to 11) 提交 2012-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.55 Å R-free 0.241
4HY9 Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin_LYZZ (residues 1 to 11) 提交 2012-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.55 Å R-free 0.241
4HYB Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin_LYZI (residues 1 to 10) 提交 2012-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.70 Å R-free 0.244
4HYB Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with pyrrhocoricin_LYZI (residues 1 to 10) 提交 2012-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：UNP residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.70 Å R-free 0.244
4JN4 Allosteric opening of the polypeptide-binding site when an Hsp70 binds ATP 提交 2013-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–610（609 aa） 片段：UNP residues 2-610
链 B 2–610（609 aa） 片段：UNP residues 2-610
突变：N432M,Q433G,S434G 突变：N432M,Q433G,S434G MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；273 K；1.8-2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes-NaOH, 2-3% PEG 400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
分辨率 2.30 Å R-free 0.197
4JNE Allosteric opening of the polypeptide-binding site when an Hsp70 binds ATP 提交 2013-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–610（609 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-610
链 B 2–610（609 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-610
突变：N432M,Q433G,S434G 突变：N432M,Q433G,S434G MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；273 K；1.8-2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes-NaOH, 2-3% PEG 400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
分辨率 1.96 Å R-free 0.201
4JNF Allosteric opening of the polypeptide-binding site when an Hsp70 binds ATP 提交 2013-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 389–610（222 aa） 片段：Substrate binding domain, unp RESIDUES 389-610
突变：N432M,Q433G,S434G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.62 Å R-free 0.216
4JWC Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(1-16) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：uno residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4JWC Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(1-16) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：uno residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4JWC Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(1-16) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：uno residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：uno residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4JWD Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(15-28) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.95 Å R-free 0.217
4JWD Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with bovine Bac7(15-28) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.95 Å R-free 0.217
4JWE Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(1-21) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JWE Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(1-21) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JWE Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(1-21) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；292 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JWI Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(35-43) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.229
4JWI Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(35-43) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.229
4JWI Crystal structure of the substrate binding domain of E.coli DnaK in complex with sheep Bac7(35-43) 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
链 B 389–607（219 aa） 片段：unp residues 389-607
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；292 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.229
4R5G Crystal structure of the DnaK C-terminus with the inhibitor PET-16 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
链 B 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
未记录 3JE triphenyl(phenylethynyl)phosphonium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.8M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.45 Å R-free 0.328
4R5G Crystal structure of the DnaK C-terminus with the inhibitor PET-16 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
链 B 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
未记录 3JE triphenyl(phenylethynyl)phosphonium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；1.8M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.45 Å R-free 0.328
4R5I Crystal structure of the DnaK C-terminus with the substrate peptide NRLLLTG 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2.2M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 1.97 Å R-free 0.218
4R5J Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-A) 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
链 C 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
未记录 CA CALCIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M potassium bromide, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.36 Å R-free 0.258
4R5J Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-A) 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
链 D 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
未记录 CA CALCIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M potassium bromide, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.36 Å R-free 0.258
4R5K Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-B) 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
链 B 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M potassium bromide, 30% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 1.75 Å R-free 0.218
4R5L Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-C) 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
链 B 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2.1M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.97 Å R-free 0.243
4R5L Crystal structure of the DnaK C-terminus (Dnak-SBD-C) 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
链 D 389–607（219 aa） 片段：C-terminus of DnaK
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2.1M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.97 Å R-free 0.243
5NRO Structure of full-length DnaK with bound J-domain 提交 2017-04-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–605（605 aa）
突变：E47C, T199A, F529C ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；9% w/v PEG 8000 0.1M calcium acetate 0.1 M imidazole pH 6.5 protein at 18 mg/ml crystalization drop contained 200 nl protein + 100 nl reservoir solution
分辨率 3.25 Å R-free 0.234
5OOW Crystal structure of lobe II from the nucleotide binding domain of DnaK in complex with AMPPCP 提交 2017-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 183–383（201 aa）
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；25% PEG1500, 0.1 M MIB buffer pH 7.0
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
5OOW Crystal structure of lobe II from the nucleotide binding domain of DnaK in complex with AMPPCP 提交 2017-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 183–383（201 aa）
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；25% PEG1500, 0.1 M MIB buffer pH 7.0
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
7JMM Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RAKNIILLSR 提交 2020-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.56 Å R-free 0.327
7JN8 Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RGNTLVIVSR 提交 2020-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 3.09 Å R-free 0.319
7JN9 Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide QEHTGSQLRIAAYGP 提交 2020-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.286
7JNE Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RGSQLRIASR 提交 2020-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.54 Å R-free 0.334
7N6J Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RKQSTIALALLPLLFTPRR 提交 2021-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4 pH 7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.265
7N6K Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RALALLPLSR 提交 2021-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；2.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.55 Å R-free 0.306
7N6L Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide EANQQKPLLGLFADG 提交 2021-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.332
7N6M Crystal structure of the substrate-binding domain of E. coli DnaK in complex with the peptide RQKPLLGLSR 提交 2021-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 389–607（219 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M K3PO4
分辨率 1.82 Å R-free 0.287

共 52 个其他 PDB 条目、122 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DNAK_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–605； UniProt 1–605 作者链 B； PDB构建体 1–605； UniProt 1–605 作者链 C； PDB构建体 1–605； UniProt 1–605 作者链 D； PDB构建体 1–605； UniProt 1–605

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4b9q

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4b9q
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4b9q
沉积日期 deposition_date2012-09-06
结构标题 titleOpen conformation of ATP-bound Hsp70 homolog DnaK
关键词 keywordsCHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier57.70 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron58.07 Å
零角强度 I(0) i01075820000.00
分子量 molecular_weight263140.0 kDa
排除体积 excluded_volume324500 ų
包络体积 envelope_volume494030 ų
水化壳体积 shell_volume73040 ų
包络直径 envelope_diameter205.3 Å
壳层 Rg shell_rg57.25 Å
包络 Rg envelope_rg56.90 Å
形状 Rg shape_rg58.05 Å
总 Rg total_rg58.10 Å
总原子数 total_atoms18246
残基数 n_residues2332
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax190.2 Å
Rg (实空间) rg_real58.20 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.99 Å
I(0) (实空间) i0_real1.0760e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.0950e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal57.23 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1074000000.0000
解质量估计 total_estimate0.7858
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary42.3 Å
偏度 Skewness skewness0.449
峰度 Kurtosis kurtosis-0.594
角度范围 angular_range— – 0.1350 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha96350000.0000
实空间数据点数 n_real_points28
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.767; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.784; Smooth: 0.127
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

CATH v4.4 (20 domains)

结构域编号 domain_id4b9qA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4b9qA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4b9qA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id4b9qA04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology34 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id4b9qA05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id4b9qB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4b9qB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4b9qB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id4b9qB04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology34 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id4b9qB05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id4b9qC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4b9qC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4b9qC03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id4b9qC04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology34 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id4b9qC05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id4b9qD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4b9qD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id4b9qD03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id4b9qD04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology34 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id4b9qD05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1270 — Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)