SAXSdb — 4bsh

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMAGGLUTININ

INFLUENZA VIRUS (A/TURKEY/ITALY/214845/2002(H7N3))

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	同源多聚体	蛋白 6 其他聚合物 6	N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-6)-beta-D-galactopyranose × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SULFATE ION × 42 water × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6GYW3_9INFA
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–321； UniProt 19–339 作者链 B； PDB构建体 1–177； UniProt 340–516

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4bsh
沉积日期 deposition_date	2013-06-10
结构标题 title	H7N3 Avian Influenza Virus Haemagglutinin in Complex with Human Receptor Analogue 6'-SLN
关键词 keywords	;VIRAL PROTEIN, H7N3, H7N9, H5N1, FOWL PLAGUE VIRUS, GLYCOPROTEIN, GLYCOSYLATION, VIRUS RECEPTOR, BIRD FLU, SIALYLLACTOSAMINE, 3SLN, 6SLN, LSTC, PANDEMIC ;; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4bsh__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4bsh__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4bsh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.27 Å
Rg（电子密度）	40.83 Å
总 Rg	40.94 Å
原子数	11865
残基数	1458
排除体积	206460 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4bsh__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HEMAGGLUTININ
分子量 formula_weight	35087.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4087

DKICLGHHAVSNGTKVNTLTERGVEVVNATETVERTNVPRICSKGKRTVDLGQCGLLGTITGPPQCDQFLEFSADLIIERREGSDVCYPGKFVNEEALRQILRESGGIDKETMGFTYSGIRTNGATSACRRSGSSFYAEMKWLLSNTDNAAFPQMTKSYKNTRKDPALIIWGIHHSGSTTEQTKLYGSGNKLITVGSSNYQQSFVPSPGARPQVNGQSGRIDFHWLMLNPNDTVTFSFNGAFIAPDRASFLRGKSMGIQSSVQVDANCEGDCYHSGGTIISNLPFQNINSRAVGKCPRYVKQESLMLATGMKNVPEIPKGR

来源 Source

来源生物 organism	INFLUENZA VIRUS (A/TURKEY/ITALY/214845/2002(H7N3))
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	265120
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	HEMAGGLUTININ
分子量 formula_weight	20474.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GLFGAIAGFIENGWEGLIDGWYGFRHQNAQGEGTAADYKSTQSAIDQITGKLNRLIEKTNQQFELIDNEFTEVEKQIGNVINWTRDSMTEVWSYNAELLVAMENQHTIDLADSEMNKLYERVKRQLRENAEEDGTGCFEIFHKCDDDCMASIRNNTYDHSRYREEAMQNRIQIDPVK

来源 Source

来源生物 organism	INFLUENZA A VIRUS (A/TURKEY/ITALY/214845/2002(H7N3))
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	265120
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-6)-beta-D-galactopyranose
分子量 formula_weight	471.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	132

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d4bsha_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.19 — Viral protein domain
超家族 Superfamily superfamily	b.19.1 — Viral protein domain
家族 Family family	b.19.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4bshb_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamily	h.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family family	h.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	4bshA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	77 — Hemagglutinin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hemagglutinin Chain A, Domain 2

结构域编号 domain_id	4bshA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	209 — Hemagglutinin (Ha1 Chain); Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Haemagglutinin, alpha/beta domain, HA1 chain

结构域编号 domain_id	4bshB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

▶

晶胞边长 a length_a	115.897 Å
晶胞边长 b length_b	115.897 Å
晶胞边长 c length_c	297.497 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	18

空间群 space_group	H 3 2
空间群编号 int_tables_number	155
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.250 Å
最低分辨率 resolution_low	59.830 Å
R 因子 r_factor	0.2304
R_work r_work	0.2290
R_free r_free	0.2576

H7N3 Avian Influenza Virus Haemagglutinin in Complex with Human Receptor Analogue 6'-SLN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMAGGLUTININ

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4bsh__assembly_1__model_1

4bsh__assembly_1__model_1 | I(q)

4bsh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

H7N3 Avian Influenza Virus Haemagglutinin in Complex with Human Receptor Analogue 6'-SLN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEMAGGLUTININ

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4bsh__assembly_1__model_1

4bsh__assembly_1__model_1 | I(q)

4bsh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)