|
22TU
Human 80S ribosome in complex with DHX29
提交 2026-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:83-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
28LN
XBP1u-stalled RPL4 RNC in complex with NAC
提交 2026-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:86-meric
|
链 Ba
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.70 Å
|
|
4UG0
STRUCTURE OF THE HUMAN 80S RIBOSOME
提交 2015-03-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:89-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 239
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
4V6X
Structure of the human 80S ribosome
提交 2013-02-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 84
PDB 声明:89-meric
|
链 Ca
1–148(148 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 3 seconds using two pieces of filter paper, then plunge into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 5.00 Å
|
|
5AJ0
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (POST state).
提交 2015-02-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Aa
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 326
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM HEPES-KOH, PH 7.5, 100 MM KCL, 1.5 MM MGCL2, 0.5 MM SPERMIDINE, 0.04 MM SPERMINE, 1 MM DTT;pH 7.5;20 MM HEPES-KOH, PH 7.5, 100 MM KCL, 1.5 MM MGCL2, 0.5 MM SPERMIDINE, 0.04 MM SPERMINE, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 93, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK II, METHOD- BLOT FOR 2-4 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5LKS
Structure-function insights reveal the human ribosome as a cancer target for antibiotics
提交 2016-07-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:80-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
MG MAGNESIUM ION × 224
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
5T2C
CryoEM structure of the human ribosome at 3.6 Angstrom resolution
提交 2016-08-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:81-meric
|
链 U
1–148(148 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
6IP5
Cryo-EM structure of the CMV-stalled human 80S ribosome (Structure ii)
提交 2018-11-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:84-meric
|
链 2U
1–148(148 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6IP6
Cryo-EM structure of the CMV-stalled human 80S ribosome with HCV IRES (Structure iii)
提交 2018-11-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 2U
1–148(148 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å
|
|
6IP8
Cryo-EM structure of the HCV IRES dependently initiated CMV-stalled 80S ribosome (Structure iv)
提交 2018-11-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:84-meric
|
链 2U
1–148(148 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6LQM
Cryo-EM structure of a pre-60S ribosomal subunit - state C
提交 2020-01-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 45
PDB 声明:48-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 251
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å
|
|
6LSR
Cryo-EM structure of a pre-60S ribosomal subunit - state B
提交 2020-01-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 45
PDB 声明:48-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 246
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å
|
|
6LSS
Cryo-EM structure of a pre-60S ribosomal subunit - state preA
提交 2020-01-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 45
PDB 声明:48-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 250
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å
|
|
6LU8
Cryo-EM structure of a human pre-60S ribosomal subunit - state A
提交 2020-01-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 247
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å
|
|
6OLE
Human ribosome nascent chain complex (CDH1-RNC) stalled by a drug-like molecule with AP and PE tRNAs
提交 2019-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 b
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 31
ZN ZINC ION × 6
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6OLF
Human ribosome nascent chain complex (CDH1-RNC) stalled by a drug-like molecule with AA and PE tRNAs
提交 2019-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 b
2–148(147 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 31
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6OLG
Human ribosome nascent chain complex stalled by a drug-like small molecule (CDH1_RNC with PP tRNA)
提交 2019-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 Aa
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 326
ZN ZINC ION × 5
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
6OLI
Structure of human ribosome nascent chain complex selectively stalled by a drug-like small molecule (USO1-RNC)
提交 2019-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 b
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 31
ZN ZINC ION × 6
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
6OLZ
Human ribosome nascent chain complex (PCSK9-RNC) stalled by a drug-like molecule with PP tRNA
提交 2019-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:82-meric
|
链 Aa
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 326
ZN ZINC ION × 5
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6OM0
Human ribosome nascent chain complex (PCSK9-RNC) stalled by a drug-like molecule with AP and PE tRNAs
提交 2019-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 b
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 31
ZN ZINC ION × 6
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6OM7
Human ribosome nascent chain complex (PCSK9-RNC) stalled by a drug-like small molecule with AA and PE tRNAs
提交 2019-04-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 b
2–148(147 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 31
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
6QZP
High-resolution cryo-EM structure of the human 80S ribosome
提交 2019-03-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:81-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 438
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
ZN ZINC ION × 8
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6W6L
Cryo-EM structure of the human ribosome-TMCO1 translocon
提交 2020-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 49
PDB 声明:54-meric
|
链 b
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 28
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Two filter papers were added to each arm, 2.5 microliters of sample were added to the grids, and 0.5 seconds of drain time was allowed before vitrification.
|
分辨率 3.84 Å
|
|
6XA1
Structure of a drug-like compound stalled human translation termination complex
提交 2020-06-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:83-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 190
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
ZN ZINC ION × 8
K POTASSIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
6Y0G
Structure of human ribosome in classical-PRE state
提交 2020-02-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 72
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6Y2L
Structure of human ribosome in POST state
提交 2020-02-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 74
PDB 声明:80-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 193
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6Y57
Structure of human ribosome in hybrid-PRE state
提交 2020-02-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:82-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 160
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
6Y6X
Tetracenomycin X bound to the human ribosome
提交 2020-02-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 43
PDB 声明:46-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 229
OCW Tetracenomycin X × 1
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
6Z6L
Cryo-EM structure of human CCDC124 bound to 80S ribosomes
提交 2020-05-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:83-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6Z6M
Cryo-EM structure of human 80S ribosomes bound to EBP1, eEF2 and SERBP1
提交 2020-05-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6Z6N
Cryo-EM structure of human EBP1-80S ribosomes (focus on EBP1)
提交 2020-05-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6ZM7
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human CCDC124-80S-EBP1 ribosome complex
提交 2020-07-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
6ZME
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human CCDC124-80S-eERF1 ribosome complex
提交 2020-07-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 83
PDB 声明:88-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6ZMI
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human LYAR-80S ribosome complex
提交 2020-07-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
6ZMO
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human LYAR-80S-eEF1a ribosome complex
提交 2020-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
7BHP
Cryo-EM structure of the human Ebp1 - 80S ribosome
提交 2021-01-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 41
PDB 声明:45-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 41
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7F5S
human delta-METTL18 60S ribosome
提交 2021-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 42
PDB 声明:45-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 279
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å
|
|
7OW7
EIF6-bound large subunit of the human ribosome
提交 2021-06-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 40
PDB 声明:43-meric
|
链 U
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 223
ZN ZINC ION × 5
K POTASSIUM ION × 153
NA SODIUM ION × 4
BR BROMIDE ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
7QVP
Human collided disome (di-ribosome) stalled on XBP1 mRNA
提交 2022-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 148
PDB 声明:162-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
链 Ma
1–148(148 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
7XNY
High resolution cry-EM structure of the human 80S ribosome from SNORD127+/- Kasumi-1 cells
提交 2022-04-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:79-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 421
K POTASSIUM ION × 12
ZN ZINC ION × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å
|
|
8A3D
Human mature large subunit of the ribosome with eIF6 and homoharringtonine bound
提交 2022-06-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 42
PDB 声明:45-meric
|
链 U
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 229
K POTASSIUM ION × 155
NA SODIUM ION × 2
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
SPM SPERMINE × 1
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;30 seconds 'wait' time
|
分辨率 1.67 Å
|
|
8FKP
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State A1)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 44
PDB 声明:47-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 54
ZN ZINC ION × 2
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.
|
分辨率 2.85 Å
|
|
8FKQ
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State A2)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 40
PDB 声明:43-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 51
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.76 Å
|
|
8FKR
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State B1)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:51-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 54
ZN ZINC ION × 2
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.89 Å
|
|
8FKS
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State B2)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 44
PDB 声明:47-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 61
ZN ZINC ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.88 Å
|
|
8FKT
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State C1)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:53-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 64
ZN ZINC ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.81 Å
|
|
8FKU
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State C2)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 58
ZN ZINC ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.82 Å
|
|
8FKV
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State D1)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 53
PDB 声明:56-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 65
ZN ZINC ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.47 Å
|
|
8FKW
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State D2)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:53-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 59
ZN ZINC ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.50 Å
|
|
8FKX
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State E)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:53-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 61
ZN ZINC ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.59 Å
|
|
8FKY
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State F)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 56
PDB 声明:59-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 70
ZN ZINC ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.67 Å
|
|
8FKZ
Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State G)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:51-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 64
ZN ZINC ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 3.04 Å
|
|
8FL2
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I1)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 61
PDB 声明:65-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 100
ZN ZINC ION × 5
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.67 Å
|
|
8FL3
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I2)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 60
PDB 声明:63-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 100
ZN ZINC ION × 5
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.53 Å
|
|
8FL4
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I3)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 59
PDB 声明:62-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 99
ZN ZINC ION × 5
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.89 Å
|
|
8FL6
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State J1)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:56-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 88
ZN ZINC ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.62 Å
|
|
8FL7
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State J2)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 51
PDB 声明:54-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 88
ZN ZINC ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.55 Å
|
|
8FL9
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State J3)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 88
ZN ZINC ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.75 Å
|
|
8FLA
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State K1)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:56-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 88
ZN ZINC ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.63 Å
|
|
8FLB
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State K2)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 51
PDB 声明:54-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 88
ZN ZINC ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.55 Å
|
|
8FLC
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State K3)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 88
ZN ZINC ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
|
分辨率 2.76 Å
|
|
8FLD
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State L1)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:54-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 87
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.
|
分辨率 2.58 Å
|
|
8FLE
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State L2)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 49
PDB 声明:52-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 87
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.
|
分辨率 2.48 Å
|
|
8FLF
Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State L3)
提交 2022-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 45
PDB 声明:48-meric
|
链 LK
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 87
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.
|
分辨率 2.65 Å
|
|
8G5Y
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (IC state)
提交 2023-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:83-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SPD SPERMIDINE × 13
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 11
K POTASSIUM ION × 77
MG MAGNESIUM ION × 524
ANM ANISOMYCIN × 1
3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 8
MET METHIONINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.29 Å
|
|
8G5Z
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (GA state)
提交 2023-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:87-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SPD SPERMIDINE × 10
K POTASSIUM ION × 45
MG MAGNESIUM ION × 433
ANM ANISOMYCIN × 1
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 8
3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 8
PHE PHENYLALANINE × 1
MET METHIONINE × 1
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1
ZIY plitidepsin × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.64 Å
|
|
8G60
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (CR state)
提交 2023-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SPD SPERMIDINE × 8
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 10
MG MAGNESIUM ION × 461
ANM ANISOMYCIN × 1
3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1
K POTASSIUM ION × 10
ZN ZINC ION × 7
PHE PHENYLALANINE × 1
MET METHIONINE × 1
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1
ZIY plitidepsin × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.54 Å
|
|
8G61
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (AC state)
提交 2023-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:84-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 4
K POTASSIUM ION × 16
MG MAGNESIUM ION × 326
ANM ANISOMYCIN × 1
SPD SPERMIDINE × 5
3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 8
MET METHIONINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å
|
|
8G6J
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (GA state 2)
提交 2023-02-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SPD SPERMIDINE × 10
K POTASSIUM ION × 34
MG MAGNESIUM ION × 337
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 8
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
ZN ZINC ION × 8
PHE PHENYLALANINE × 1
MET METHIONINE × 1
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1
YRB (3R,6R,9S,12S,15S,18S,20R,24aR)-6-[(2S)-butan-2-yl]-3,12-bis[(1R)-1-hydroxy-2-methylpropyl]-8,9,11,17,18-pentamethyl-15-[(2S)-2-methylbutyl]hexadecahydropyrido[1,2-a][1,4,7,10,13,16,19]heptaazacyclohenicosine-1,4,7,10,13,16,19(21H)-heptone × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
8GLP
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (Consensus LSU focused refined structure)
提交 2023-03-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:81-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
SPD SPERMIDINE × 15
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 9
K POTASSIUM ION × 152
MG MAGNESIUM ION × 671
ANM ANISOMYCIN × 1
3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
ZN ZINC ION × 8
MET METHIONINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.67 Å
|
|
8IDT
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State G
提交 2023-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:51-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
K POTASSIUM ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
8IDY
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State F
提交 2023-02-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 51
PDB 声明:54-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8IE3
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State E
提交 2023-02-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 45
PDB 声明:48-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8IFD
Dibekacin-added human 80S ribosome
提交 2023-02-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:80-meric
|
链 2U
1–148(148 aa)
|
未记录
|
84D Dibekacin × 24
MG MAGNESIUM ION × 397
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å
|
|
8IFE
Arbekacin-added human 80S ribosome
提交 2023-02-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:80-meric
|
链 2U
1–148(148 aa)
|
未记录
|
84G Arbekacin × 23
MG MAGNESIUM ION × 410
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å
|
|
8INE
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State G'
提交 2023-03-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 54
PDB 声明:58-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8INF
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State F'
提交 2023-03-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 57
PDB 声明:61-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8INK
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State D
提交 2023-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:53-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8IPD
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State C
提交 2023-03-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 49
PDB 声明:52-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8IPX
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State C'
提交 2023-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 54
PDB 声明:58-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å
|
|
8IPY
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State D'
提交 2023-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 55
PDB 声明:59-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8IR1
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State A
提交 2023-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:53-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8IR3
human nuclear pre-60S ribosomal particle - State B'
提交 2023-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 55
PDB 声明:59-meric
|
链 L
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
8JDJ
Structure of the Human cytoplasmic Ribosome with human tRNA Asp(Q34) and mRNA(GAU)
提交 2023-05-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 73
PDB 声明:80-meric
|
链 f
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 539
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;The Buffer pH was adjusted to 7.4 using KOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å
|
|
8JDK
Structure of the Human cytoplasmic Ribosome with human tRNA Asp(ManQ34) and mRNA(GAU)
提交 2023-05-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 73
PDB 声明:80-meric
|
链 f
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 539
MAN alpha-D-mannopyranose × 2
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;The Buffer pH was adjusted to 7.4 using KOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.26 Å
|
|
8JDL
Structure of the Human cytoplasmic Ribosome with human tRNA Tyr(GalQ34) and mRNA(UAU) (non-rotated state)
提交 2023-05-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 73
PDB 声明:79-meric
|
链 f
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 539
GAL beta-D-galactopyranose × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;The Buffer pH was adjusted to 7.4 using KOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å
|
|
8JDM
Structure of the Human cytoplasmic Ribosome with human tRNA Tyr(GalQ34) and mRNA(UAU) (rotated state)
提交 2023-05-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 73
PDB 声明:80-meric
|
链 f
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GAL beta-D-galactopyranose × 2
MG MAGNESIUM ION × 520
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;The Buffer pH was adjusted to 7.4 using KOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å
|
|
8K2C
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with Tigecycline
提交 2023-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 259
T1C TIGECYCLINE × 9
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
8OHD
60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 3 (native)
提交 2023-03-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 220
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8OJ0
60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 2 (native)
提交 2023-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:53-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 220
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8OJ5
60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 3 (in-vitro reconstitution)
提交 2023-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 46
PDB 声明:49-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 220
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8OJ8
60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 1 (native)
提交 2023-03-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 220
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8QFD
UFL1 E3 ligase bound 60S ribosome
提交 2023-09-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 42
PDB 声明:45-meric
|
链 a
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 161
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;25 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
8QOI
Structure of the human 80S ribosome at 1.9 A resolution - the molecular role of chemical modifications and ions in RNA
提交 2023-09-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:79-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 292
K POTASSIUM ION × 108
SPD SPERMIDINE × 2
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6;Titan Krios sample is prepared with Sodium cacodylate buffer.
CryoARM 300 sample is prepared with Hepes buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å
|
|
8QYX
Human 60S ribosomal subunit
提交 2023-10-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 41
PDB 声明:44-meric
|
链 U1
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 186
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 7
K POTASSIUM ION × 46
ZN ZINC ION × 5
SPD SPERMIDINE × 7
SPM SPERMINE × 5
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.78 Å
|
|
8RL2
Human pre-60S - State 5
提交 2024-01-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 49
PDB 声明:52-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å
|
|
8UKB
In situ HHT and CHX treated human hibernating state without E-tRNA 80S ribosome
提交 2023-10-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:84-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 255
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
WV3 4-{(2R)-2-[(1R,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å
|
|
8XSX
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with Tigecycline, E-tRNA, SERBP1 and eEF2
提交 2024-01-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 259
T1C TIGECYCLINE × 7
ZN ZINC ION × 8
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
8XSY
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with Tigecycline, e-tRNA and CCDC124 (40S head Swivelled)
提交 2024-01-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 255
T1C TIGECYCLINE × 8
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8XSZ
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with Tigecycline, E-tRNA and P-tRNA
提交 2024-01-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 248
T1C TIGECYCLINE × 5
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8Y0W
dormant ribosome with eIF5A, eEF2 and SERBP1
提交 2024-01-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:81-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 226
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50mM HEPES, pH7.5, 100mM KOAc, 5mM Mg(OAc)2, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8Y0X
Dormant ribosome with SERBP1
提交 2024-01-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:80-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 255
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;50mM HEPES, pH7.4, 100mM KoAc, 5mM Mg(OAc)2, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8YOO
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with 100 um Tigecycline
提交 2024-03-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:81-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 257
T1C TIGECYCLINE × 6
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å
|
|
8YOP
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with 4 um Tigecycline
提交 2024-03-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:82-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 255
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
9B0P
In situ human Hibernating class1 80S ribosome
提交 2024-03-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 255
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å
|
|
9B0Q
In situ human top-back di-ribosome structure (Composite map)
提交 2024-03-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 160
PDB 声明:172-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
链 la
2–148(147 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 12
MG MAGNESIUM ION × 510
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9B0S
In situ human top-top di-ribosome structure (Composite map)
提交 2024-03-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 158
PDB 声明:171-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
链 la
2–148(147 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 12
MG MAGNESIUM ION × 510
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
9C3H
Structure of the CNOT3-bound human 80S ribosome with tRNA-ARG in the P-site.
提交 2024-06-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:83-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 326
K POTASSIUM ION × 94
B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å
|
|
9FQZ
CRYO-EM STRUCTURE OF HCT15 POLYSOMES BOUND TO EEF2, EBP1, AND SERBP1
提交 2024-06-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 271
K POTASSIUM ION × 104
ZN ZINC ION × 8
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 7
HYG HYGROMYCIN B × 1
SPD SPERMIDINE × 8
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ANM ANISOMYCIN × 1
NA SODIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å
|
|
9G8M
human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex
提交 2024-07-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 87
PDB 声明:92-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 232
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9GMO
eIF6-bound pre-60S large ribosomal subunit incorporating mutant uL16
提交 2024-08-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 43
PDB 声明:46-meric
|
链 U
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 227
K POTASSIUM ION × 155
NA SODIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.59 Å
|
|
9GUL
Structure of FLuc-XBP1u+ stalled human 60S ribosome nascent chain complex
提交 2024-09-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 42
PDB 声明:46-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 284
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
9GY4
60S ribosomal subunit in complex with E3-UFM1 ligase and RQC machinery components NEMF and LTN1 (Composite map)
提交 2024-10-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 51
PDB 声明:55-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
9I14
CRYO-EM STRUCTURE OF HCT15 POLYSOMES IN HYBRID-PRE STATE
提交 2025-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:82-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 40
MG MAGNESIUM ION × 267
NA SODIUM ION × 23
SPD SPERMIDINE × 1
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1
ZN ZINC ION × 7
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.34 Å
|
|
9I2D
NMT1-NAC bound human RNC with 10 amino acid ARF1-linker
提交 2025-01-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.19 Å
|
|
9I2E
NMT1-NAC bound human ribosome (combined translational states)
提交 2025-01-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å
|
|
9KZU
Cryo-EM structure of the HCV IRES-dependently initiated CMV-stalled 80S ribosome (non-rotated state) in complexed with eIF3
提交 2024-12-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 85
PDB 声明:92-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 81
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
9KZX
Cryo-EM structure of the HCV IRES-dependently initiated CMV-stalled 80S ribosome (rotated state) in complexed with eIF3
提交 2024-12-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 85
PDB 声明:93-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 66
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9M0P
Cryo-EM structure of human 80S ribosome in complex with montanine
提交 2025-02-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 73
PDB 声明:78-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 291
ZN ZINC ION × 6
A1L8F (1S,13S,15S,16S)-16-methoxy-5,7-dioxa-12-azapentacyclo[10.6.1.02,10.04,8.013,18]nonadeca-2,4(8),9,17-tetraen-15-ol × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å
|
|
9N9J
Structure of a GRP94 folding intermediate engaged with a CCDC134- and FKBP11-bound secretory translocon
提交 2025-02-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 65
PDB 声明:70-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
ELU phosphono [(3~{R},6~{E},10~{E})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-6,10,14-trienyl] hydrogen phosphate × 1
MG MAGNESIUM ION × 226
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;HEPES buffer was adjusted to pH 7.4 with potassium hydroxide.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Three microliters of affinity-purified RTCs were applied to the grid, incubated for 60 seconds, blotted for 7 seconds, drained for 0.5 seconds, and frozen in liquid nitrogen-cooled ethane.
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9O3V
Human 80S ribosome stalled on MYC nascent chain
提交 2025-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:82-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 352
K POTASSIUM ION × 165
SPD SPERMIDINE × 14
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 7
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20mM Tris, 100mM KOAc, 7.5mM MgOAc, 0.25mM Spermidine, 2mM DTT, 0.05% w/v b-OG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
9O3W
Human 80S ribosome bound to IDB-001 stalled on MYC nascent chain
提交 2025-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:82-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 170
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 7
SPD SPERMIDINE × 14
A1B75 (2R,3S,4S)-4-hydroxy-2-[(4-methoxyphenyl)methyl]pyrrolidin-3-yl {2-[(2S)-pyrrolidin-2-yl]ethyl}carbamate × 1
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
MG MAGNESIUM ION × 371
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20mM Tris, 100mM KOAc, 7.5mM MgOAc, 0.25mM Spermidine, 2mM DTT, 0.05% w/v b-OG, 50uM IDB-001
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å
|
|
9O3Y
Human 80S ribosome bound to IDB-002 stalled on FPAK-containing nascent chain
提交 2025-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:82-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 168
SPD SPERMIDINE × 14
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 7
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
MG MAGNESIUM ION × 332
A1B76 (2R,3S,4S)-4-hydroxy-2-[(4-methoxyphenyl)methyl]pyrrolidin-3-yl [(3-fluorophenyl)methyl]carbamate × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20mM Tris, 100mM KOAc, 7.5mM MgOAc, 0.25mM Spermidine, 2mM DTT, 0.05% w/v b-OG, 50uM IDB-001
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
9P6Z
In situ human P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å
|
|
9P72
In situ human P-E state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9P73
In situ human eEF2-A/P-P/E state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.66 Å
|
|
9P76
In situ human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å
|
|
9P78
In situ human Hibernating rotate 3 with E-site tRNA state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9P79
In situ human Hibernating rotate3 with Z site tRNA state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9P7A
In situ human hibernating class2 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å
|
|
9P7C
In situ human Hibernating class3 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å
|
|
9P7D
In situ human Hibernating class4 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å
|
|
9P7E
In situ human Hibernating class5 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å
|
|
9P7F
In situ HHT and CHX treated A-P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å
|
|
9P7G
In situ HHT and CHX treated A-P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å
|
|
9P7H
In situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å
|
|
9P7I
In situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å
|
|
9P7J
In situ HHT and CHX treated human P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:83-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å
|
|
9P7K
In situ human post eEF1A-A/T-P-E state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9P7L
In situ human Post-eEF1A-AT-P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å
|
|
9P7N
In situ human Post-eEF1A-A/T-P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å
|
|
9P7O
In situ human AT-P-Z state ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å
|
|
9P7W
In situ human A-P state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å
|
|
9P7X
In situ human A-P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å
|
|
9P7Y
In situ human A-P-E state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å
|
|
9P8B
In situ human eEF1A-A/T-P-E state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.48 Å
|
|
9P8C
In situ human Hibernating class1 (rotate3) without E tRNA state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å
|
|
9P8H
In situ human A/P-P/E state 80S ribosome
提交 2025-06-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å
|
|
9P8I
In situ HHT and CHX treated human P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.89 Å
|
|
9P9H
In situ human unrotated hibernating with CCDC124 state 80S ribosome
提交 2025-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:85-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å
|
|
9P9I
In situ human unrotated hibernating without CCDC124 state 80S ribosome
提交 2025-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å
|
|
9P9J
In situ human 60S ribosome
提交 2025-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 41
PDB 声明:44-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.87 Å
|
|
9P9K
In situ human 60S ribosome with EIF6
提交 2025-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 42
PDB 声明:45-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å
|
|
9PA7
In situ human 80S consensus ribosome with EBP1
提交 2025-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:87-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 225
SPM SPERMINE × 8
SPD SPERMIDINE × 12
K POTASSIUM ION × 75
ZN ZINC ION × 7
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å
|
|
9PBE
In situ human 80S ribosome (composite map)
提交 2025-06-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 225
SPM SPERMINE × 8
SPD SPERMIDINE × 12
K POTASSIUM ION × 75
ZN ZINC ION × 7
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.19 Å
|
|
9PKG
In situ human P state 80S ribosome
提交 2025-07-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:83-meric
|
链 La
2–148(147 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å
|
|
9QIW
Human pre-60S - State 3
提交 2025-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:51-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å
|
|
9QLO
NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - State 1
提交 2025-03-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
G3D GUANOSINE-3'-MONOPHOSPHATE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.47 Å
|
|
9QLP
NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - State 2
提交 2025-03-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
G3D GUANOSINE-3'-MONOPHOSPHATE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å
|
|
9QLQ
NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - alternative State
提交 2025-03-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å
|
|
9RPV
Structure of the ZAK-bound human disome
提交 2025-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 154
PDB 声明:168-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
链 Ma
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 830
ZN ZINC ION × 7
ANM ANISOMYCIN × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.35 Å
|
|
9RU7
WT-HEK 80S ribosome bound to Kozak mRNA (WT-Kozak)
提交 2025-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:82-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
K POTASSIUM ION × 17
MG MAGNESIUM ION × 74
C CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2
NA SODIUM ION × 7
ZN ZINC ION × 5
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
9RU8
WT-HEK 80S ribosome bound to TISU mRNA (WT-TISU)
提交 2025-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 73
PDB 声明:80-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 3.00 Å
|
|
9RU9
RPS26dC HEK mutant 80S ribosome bound to Kozak mRNA (RPS26dC-Kozak)
提交 2025-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:82-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.97 Å
|
|
9RUA
RPS26dC HEK mutant 80S ribosome bound to TISU mRNA (RPS26dC-TISU)
提交 2025-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 73
PDB 声明:80-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9RUC
WT-HEK 80S ribosome bound to H2B mRNA (WT-H2B)
提交 2025-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 73
PDB 声明:80-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 223
K POTASSIUM ION × 51
NA SODIUM ION × 8
ZN ZINC ION × 6
HYG HYGROMYCIN B × 1
SPD SPERMIDINE × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å
|
|
9S3B
NMT1-NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker - State 1
提交 2025-07-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.38 Å
|
|
9S3C
NMT1-NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker - State 2
提交 2025-07-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å
|
|
9S3D
NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker
提交 2025-07-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:87-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.32 Å
|
|
9SPF
CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN 80S RIBOSOME WITH A/P/E-SITE TRNA AND MRNA CONTAINING N1-METHYLPSEUDOURIDINE
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:83-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
K POTASSIUM ION × 151
MG MAGNESIUM ION × 225
NA SODIUM ION × 35
SPD SPERMIDINE × 19
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 9
ZN ZINC ION × 7
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
9SPI
CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN 80S RIBOSOME WITH A/P/E-SITE TRNA AND MRNA CONTAINING URIDINE
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:83-meric
|
链 La
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 8
SPD SPERMIDINE × 18
MG MAGNESIUM ION × 195
K POTASSIUM ION × 75
ZN ZINC ION × 7
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
9SYR
Human quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatD
提交 2025-10-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:86-meric
|
链 Lr
1–148(148 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 10
COA COENZYME A × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.55 Å
|