4c43

FERREDOXIN NADP REDUCTASE MUTANT WITH GLU 103 REPLACED BY TYR, TYR 104 REPLACED BY PHE, SER 109 REPLACED BY PHE AND GLY 110 REPLACED BY PRO (E103Y-Y104F-S109F-G110P)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 64.2 Å Quality: EXCELLENT

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

FERREDOXIN--NADP REDUCTASE

ANABAENA SP.

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 138–440	片段：RESIDUES 138-440 突变：YES	SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：18-20% PEG 6000,20 MM AMMONIUM SULFATE, 0.1 M MES/NAOH, PH 5.0.	分辨率 1.70 Å R-free 0.205

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4C43	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B2R FERREDOXIN-NADP+ REDUCTASE (MUTATION: E 301 A) 提交 1998-11-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）	突变：E301A	SO4 SULFATE ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0	分辨率 1.80 Å R-free 0.240
1BJK FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE MUTANT WITH ARG 264 REPLACED BY GLU (R264E) 提交 1998-06-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–440（295 aa）	突变：R264E	SO4 SULFATE ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.224
1BQE FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE MUTANT WITH THR 155 REPLACED BY GLY (T155G) 提交 1998-08-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–440（295 aa）	突变：T155G	SO4 SULFATE ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0	分辨率 2.45 Å R-free 0.240
1E62 Ferredoxin:NADP+ reductase mutant with Lys 75 replaced by Arg (K75R) 提交 2000-08-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.50	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
1E63 Ferredoxin:NADP+ Reductase Mutant with LYS 75 Replaced by SER (K75S) 提交 2000-08-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.50	分辨率 2.30 Å R-free 0.240
1E64 FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE MUTANT WITH LYS 75 REPLACED BY GLN (K75Q) 提交 2000-08-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.50	分辨率 2.30 Å R-free 0.230
1EWY ANABAENA PCC7119 FERREDOXIN:FERREDOXIN-NADP+-REDUCTASE COMPLEX 提交 2000-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 138–440（303 aa）片段：138-440	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20-24% PEG 6000,10 mM MES pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.38 Å R-free 0.293
1EWY ANABAENA PCC7119 FERREDOXIN:FERREDOXIN-NADP+-REDUCTASE COMPLEX 提交 2000-04-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 138–440（303 aa）片段：138-440	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20-24% PEG 6000,10 mM MES pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.38 Å R-free 0.293
1GJR Ferredoxin-NADP+ Reductase complexed with NADP+ by COCRYSTALLIZATION 提交 2001-08-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）片段：RESIDUES 137-440	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 2.10 Å R-free 0.270
1GO2 Structure of Ferredoxin-NADP+ Reductase with Lys 72 replaced by Glu (K72E) 提交 2001-10-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）片段：RESIDUES 137-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 1.70 Å R-free 0.250
1GR1 Structure of Ferredoxin-NADP+ Reductase with Glu 139 replaced by Lys (E139K) 提交 2001-12-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.250
1H42 FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE MUTANT WITH THR 155 REPLACED BY GLY, ALA 160 REPLACED BY THR AND LEU 263 REPLACED BY PRO (T155G-A160T-L263P) 提交 2002-09-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 2.15 Å R-free 0.231
1H85 FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE MUTANT WITH VAL 136 REPLACED BY LEU (V136L) 提交 2001-01-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–440（295 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 2.30 Å R-free 0.260
1OGI FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE MUTANT WITH THR 155 REPLACED BY GLY AND ALA 160 REPLACED BY THR (T155G-A160T) 提交 2003-05-06	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）片段：RESIDUES 138-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 1.64 Å R-free 0.221
1OGJ FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE MUTANT WITH LEU 263 REPLACED BY PRO (L263P) 提交 2003-05-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）片段：RESDIUES 138-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 1.64 Å R-free 0.228
1QGY Ferredoxin:NADP+ reductase mutant with Lys 75 replaced by Glu (K75E) 提交 1999-05-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–440（295 aa）	突变：K75E	SO4 SULFATE ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.230
1QGZ FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE MUTANT WITH LEU 78 REPLACED BY ASP (L78D) 提交 1999-05-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–440（295 aa）	突变：L78D	SO4 SULFATE ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
1QH0 FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE MUTANT WITH LEU 76 MUTATED BY ASP AND LEU 78 MUTATED BY ASP 提交 1999-05-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–440（295 aa）	突变：L76D, L78D	SO4 SULFATE ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0	分辨率 1.93 Å R-free 0.250
1QUE X-RAY STRUCTURE OF THE FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE FROM THE CYANOBACTERIUM ANABAENA PCC 7119 AT 1.8 ANGSTROMS 提交 1996-07-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；SEE REFERENCE 1., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop	分辨率 1.80 Å R-free 0.214
1QUF X-RAY STRUCTURE OF A COMPLEX NADP+-FERREDOXIN:NADP+ REDUCTASE FROM THE CYANOBACTERIUM ANABAENA PCC 7119 AT 2.25 ANGSTROMS 提交 1996-09-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；SEE REFERENCE 1., pH 5.5	分辨率 2.25 Å R-free 0.265
1W34 FERREDOXIN-NADP REDUCTASE (MUTATION: Y 303 S) 提交 2004-07-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）片段：RESIDUES 137-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.50	分辨率 1.73 Å R-free 0.208
1W35 FERREDOXIN-NADP+ REDUCTASE (MUTATION: Y 303 W) 提交 2004-07-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）片段：RESIDUES 137-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 1.90 Å R-free 0.204
1W87 FERREDOXIN-NADP REDUCTASE (MUTATION: Y 303 W) COMPLEXED WITH NADP BY COCRYSTALLIZATION 提交 2004-09-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）片段：RESIDUES 137-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 3.00 Å R-free 0.272
1W87 FERREDOXIN-NADP REDUCTASE (MUTATION: Y 303 W) COMPLEXED WITH NADP BY COCRYSTALLIZATION 提交 2004-09-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 137–440（304 aa）片段：RESIDUES 137-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 3.00 Å R-free 0.272
2BMW Ferredoxin: NADP+ Reductase Mutant With Thr 155 Replaced By Gly, Ala 160 Replaced By Thr, Leu 263 Replaced By Pro, Arg 264 Replaced By Pro and Gly 265 Replaced by Pro (T155G-A160T-L263P-R264P-G265P) 提交 2005-03-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）片段：RESIDUES 137-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.00	分辨率 1.50 Å R-free 0.207
2BSA Ferredoxin-Nadp Reductase (Mutation: Y 303 S) complexed with NADP 提交 2005-05-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.50	分辨率 1.92 Å R-free 0.219
2VYQ FERREDOXIN:NADP REDUCTASE MUTANT WITH THR 155 REPLACED BY GLY, ALA 160 REPLACED BY THR, LEU 263 REPLACED BY PRO AND TYR 303 REPLACED BY SER (T155G-A160T-L263P-Y303S) 提交 2008-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）片段：RESIDUES 137-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；18-20 % (W/V) PEG 6000 20 MM AMMONIUM SULPHATE 0.1M MES/NAOH, PH 5.0-5.5 B-OCTYL GLYCOSIDE AT 2%(W/V)	分辨率 1.90 Å R-free 0.185
2VZL FERREDOXIN-NADP REDUCTASE (MUTATIONS: T155G, A160T, L263P AND Y303S) COMPLEXED WITH NAD BY COCRYSTALLIZATION 提交 2008-07-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–440（304 aa）片段：RESIDUES 137-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；20% PEG 6000 0.1M ACNA, PH 5.5 B-OCTYL GLYCOSIDE AT 2%(W/V) 10-60 MM NAD	分辨率 1.93 Å R-free 0.195
2X3U Ferredoxin-NADP reductase mutant with Tyr 303 replaced by Phe (Y303F) 提交 2010-01-27	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 18 % PEG 6000, 0.1 M NAAC PH 5.5, 20 MM (NH4)2SO4	分辨率 1.93 Å R-free 0.205
3ZBT Ferredoxin-NADP Reductase Mutant with SER 59 Replaced by ALA (S59A) 提交 2012-11-13	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）片段：RESIDUES 138-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 18 % PEG 6000, 0.1 M NAAC PH 5.5, 20 MM (NH4)2SO4	分辨率 1.92 Å R-free 0.238
3ZBU Ferredoxin-NADP Reductase Mutant with SER 80 Replaced by ALA (S80A) 提交 2012-11-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）片段：RESIDUES 138-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 18 % PEG 6000, 0.1 M NAAC PH 5.5, 20 MM (NH4)2SO4	分辨率 1.89 Å R-free 0.205
3ZC3 FERREDOXIN-NADP REDUCTASE (MUTATION S80A) COMPLEXED WITH NADP BY COCRYSTALLIZATION 提交 2012-11-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 18% PEG 6000, 0.1 NAAC PH 5.5, 10 MM NADP	分辨率 2.30 Å R-free 0.246
3ZC3 FERREDOXIN-NADP REDUCTASE (MUTATION S80A) COMPLEXED WITH NADP BY COCRYSTALLIZATION 提交 2012-11-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 138–440（303 aa）	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 18% PEG 6000, 0.1 NAAC PH 5.5, 10 MM NADP	分辨率 2.30 Å R-free 0.246
4BPR FERREDOXIN-NADP REDUCTASE MUTANT WITH TYR 79 REPLACED BY PHE (Y79F) 提交 2013-05-28	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 138–440（303 aa）片段：RESIDUES 138-440	突变：YES	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 18% PEG 6000, 0.1 M NAAC PH 5.5, 20 MM (NH4)2 SO4	分辨率 2.00 Å R-free 0.212

共 31 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FENR_ANASO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–303； UniProt 138–440

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4c43
沉积日期 deposition_date	2013-08-29
结构标题 title	FERREDOXIN NADP REDUCTASE MUTANT WITH GLU 103 REPLACED BY TYR, TYR 104 REPLACED BY PHE, SER 109 REPLACED BY PHE AND GLY 110 REPLACED BY PRO (E103Y-Y104F-S109F-G110P)
关键词 keywords	OXIDOREDUCTASE, FLAVOPROTEIN; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.54 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.44 Å
零角强度 I(0) i0	20304300.00
分子量 molecular_weight	34250.0 kDa
排除体积 excluded_volume	42826 Å³
包络体积 envelope_volume	49737 Å³
水化壳体积 shell_volume	21151 Å³
包络直径 envelope_diameter	64.6 Å
壳层 Rg shell_rg	26.19 Å
包络 Rg envelope_rg	19.85 Å
形状 Rg shape_rg	19.46 Å
总 Rg total_rg	20.29 Å
总原子数 total_atoms	2412
残基数 n_residues	295
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	64.2 Å
Rg (实空间) rg_real	20.44 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.31 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.0300e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.6810e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.46 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	20300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9024
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	24.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.197
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.417
角度范围 angular_range	— – 0.3850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3489000.0000
实空间数据点数 n_real_points	70
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.912; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.999

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	FERREDOXIN--NADP REDUCTASE
分子量 formula_weight	34160.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.18.1.2
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2723

TQAKAKHADVPVNLYRPNAPFIGKVISNEPLVKEGGIGIVQHIKFDLTGGNLKYIEGQSIGIIPPGVDKNGKPEKLRLYSIASTRHGDDVDDKTISLCVRQLYFKHPEFPETVYGVCSTYLTHIEPGSEVKITGPVGKEMLLPDDPEANVIMLATGTGIAPMRTYLWRMFKDAERAANPEYQFKGFSWLVFGVPTTPNILYKEELEEIQQKYPDNFRLTYAISREQKNPQGGRMYIQDRVAEHADELWQLIKNQKTHTYICGLRGMEEGIDAALSAAAAKEGVTWSDYQKDLKKAGRWHVETY

来源 Source

来源生物 organism	ANABAENA SP.
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1167
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	785.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	305

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d4c43a1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.43 — Reductase/isomerase/elongation factor common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.43.4 — Riboflavin synthase domain-like
家族 Family family	b.43.4.2 — Ferredoxin reductase FAD-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4c43a2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.25 — Ferredoxin reductase-like, C-terminal NADP-linked domain
超家族 Superfamily superfamily	c.25.1 — Ferredoxin reductase-like, C-terminal NADP-linked domain
家族 Family family	c.25.1.1 — Reductases

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	4c43A01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	4c43A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Nucleotide-binding domain of ferredoxin-NADP reductase (FNR) module

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	87.410 Å
晶胞边长 b length_b	87.410 Å
晶胞边长 c length_c	96.448 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 65
空间群编号 int_tables_number	170
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.700 Å
最低分辨率 resolution_low	43.710 Å
R 因子 r_factor	0.1770
R_work r_work	0.1748
R_free r_free	0.2050

fit	/app/data/saxs_computation/c4/4c43/4c43.fit
pddf	/app/data/pr_computation/c4/4c43/4c43.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/c4/4c43/4c43.dat