4cql

Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4 × 2 （Q8N4T8） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4 × 2 （Q8N4T8） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 4	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4 × 2 （Q8N4T8） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 4	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4 × 2 （Q8N4T8） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DHB8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261 作者链 D； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261 作者链 E； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261 作者链 H； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261 作者链 I； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261 作者链 L； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261 作者链 M； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261 作者链 P； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261

CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4

HOMO SAPIENS

UniProt Q8N4T8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8 × 2 （Q92506） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8 × 2 （Q92506） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 4	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8 × 2 （Q92506） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 4	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8 × 2 （Q92506） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CBR4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 8–244； UniProt 1–237 作者链 C； PDB构建体 8–244； UniProt 1–237 作者链 F； PDB构建体 8–244； UniProt 1–237 作者链 G； PDB构建体 8–244； UniProt 1–237 作者链 J； PDB构建体 8–244； UniProt 1–237 作者链 K； PDB构建体 8–244； UniProt 1–237 作者链 N； PDB构建体 8–244； UniProt 1–237 作者链 O； PDB构建体 8–244； UniProt 1–237

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4cql
沉积日期 deposition_date	2014-02-19
结构标题 title	Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD
关键词 keywords	;OXIDOREDUCTASE, KAR, 3-KETOACYL-ACP REDUCTASE, HSD8, 17-BETA HYDROXYSTEROID DEHYDROGENASE, HSD17B8, 3R- HYDROXYACYL-COA DEHYDROGENASE, CARBOBYL REDUCTASE TYPE4, NADH, NADP, NADPH, HETERO TETRAMER ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4cql__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4cql__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4cql__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.55 Å
Rg（电子密度）	27.12 Å
总 Rg	27.91 Å
原子数	6606
残基数	929
排除体积	116570 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4cql__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4cql__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4cql__assembly_3__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`4cql__assembly_4__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8
分子量 formula_weight	26999.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.1.1.100, 1.1.1.62, 1.1.1.239
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D,E,H,I,L,M,P
原子数 atom_count	26833

MASQLQNRLRSALALVTGAGSGIGRAVSVRLAGEGATVAACDLDRAAAQETVRLLGGPGSKEGPPRGNHAAFQADVSEARAARCLLEQVQACFSRPPSVVVSCAGITQDEFLLHMSEDDWDKVIAVNLKGTFLVTQAAAQALVSNGCRGSIINISSIVGKVGNVGQTNYAASKAGVIGLTQTAARELGRHGIRCNSVLPGFIATPMTQKVPQKVVDKITEMIPMGHLGDPEDVADVVAFLASEDSGYITGTSVEVTGGLFM

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4
分子量 formula_weight	26298.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.1.1.100
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C,F,G,J,K,N,O

MHHHHHHMDKVCAVFGGSRGIGRAVAQLMARKGYRLAVIARNLEGAKAAAGDLGGDHLAFSCDVAKEHDVQNTFEELEKHLGRVNFLVNAAGINRDGLLVRTKTEDMVSQLHTNLLGSMLTCKAAMRTMIQQQGGSIVNVGSIVGLKGNSGQSVYSASKGGLVGFSRALAKEVARKKIRVNVVAPGFVHTDMTKDLKEEHLKKNIPLGRFGETIEVAHAVVFLLESPYITGHVLVVDGGLQLIL

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	663.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	218

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

结构域编号 domain_id	d4cqla_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqlb1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqlb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4cqlc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqld_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqle_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqlf1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqlf2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4cqlg_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqlh_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqli_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqlj1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqlj2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4cqlk_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqll_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqlm_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqln1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqln2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4cqlo_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4cqlp_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamily	c.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family family	c.2.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	4cqlA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlM00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlN00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlO00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

结构域编号 domain_id	4cqlP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain

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晶胞边长 a length_a	87.150 Å
晶胞边长 b length_b	237.110 Å
晶胞边长 c length_c	87.350 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	94.52 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.850 Å
最低分辨率 resolution_low	49.776 Å
R 因子 r_factor	0.1850
R_work r_work	0.1826
R_free r_free	0.2358

Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4cql__assembly_1__model_1

4cql__assembly_1__model_1 | I(q)

4cql__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4cql__assembly_1__model_1

4cql__assembly_1__model_1 | I(q)

4cql__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

CATH v4.4 (16 domains)

7. 引用文献 (1)