4cqm

Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8

HOMO SAPIENS

UniProt Q92506

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4 × 2 (Q8N4T8) NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 GLYCEROL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 3 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4 × 2 (Q8N4T8) NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 GLYCEROL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 4 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4 × 2 (Q8N4T8) NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 GLYCEROL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACETATE ION × 2 water × 4 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4 × 2 (Q8N4T8) NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 GLYCEROL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACETATE ION × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DHB8_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1, 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261 作者链 E; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261 作者链 H; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261 作者链 I; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261 作者链 L; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261 作者链 M; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261 作者链 P; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261 作者链 D; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261

CARBONYL REDUCTASE FAMILY MEMBER 4

HOMO SAPIENS

UniProt Q8N4T8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8 × 2 (Q92506) NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 GLYCEROL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 3 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8 × 1 (Q92506) ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8 × 1 (Q92506) NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 GLYCEROL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 4 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8 × 2 (Q92506) NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 GLYCEROL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACETATE ION × 2 water × 4 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 ESTRADIOL 17-BETA-DEHYDROGENASE 8 × 2 (Q92506) NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 GLYCEROL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACETATE ION × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CBR4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 8–244; UniProt 1–237 作者链 C; PDB构建体 8–244; UniProt 1–237 作者链 F; PDB构建体 8–244; UniProt 1–237 作者链 G; PDB构建体 8–244; UniProt 1–237 作者链 J; PDB构建体 8–244; UniProt 1–237 作者链 K; PDB构建体 8–244; UniProt 1–237 作者链 N; PDB构建体 8–244; UniProt 1–237 作者链 O; PDB构建体 8–244; UniProt 1–237

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4cqm
沉积日期 deposition_date2014-02-19
结构标题 titleCrystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP
关键词 keywords;OXIDOREDUCTASE, KAR, KETOACYL REDUCTASE, 3-KETOACYL-ACP REDUCTASE, KE6, HSD8, 17-BETA HYDROXYSTEROID DEHYDROGENASE, HSD17B8, 3R-HYDROXYACYL-COA DEHYDROGENASE, CBR4, CARBOBYL REDUCTASE TYPE4, NAD, NADH, NADP, NADPH, HETERO TETRAMER ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4cqm__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4cqm__assembly_3__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4cqm__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)28.85 Å
Rg(电子密度)27.45 Å
总 Rg28.21 Å
原子数7141
残基数964
排除体积126250 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4cqm__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4cqm__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 4cqm__assembly_3__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 4cqm__assembly_4__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

结构域编号 domain_idd4cqma_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmb1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4cqmc_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmd_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqme_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmf1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmf2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4cqmg_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmh_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmi_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmj1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmj2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4cqmk_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqml_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmm_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmn1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmn2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4cqmo_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4cqmp_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id4cqmA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmE00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmF00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmG00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmH00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmI00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmJ00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmK00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmL00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmM00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmN00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmO00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
结构域编号 domain_id4cqmP00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
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7. 引用文献 (1)