INVASIN IPAD
SHIGELLA FLEXNERI 5A STR. M90T
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | IPAD_SHIFL |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 D； PDB构建体 1–208； UniProt 125–332 |
4d3e
Tetramer of IpaD, modified from 2J0O, fitted into negative stain electron microscopy reconstruction of the wild type tip complex from the type III secretion system of Shigella flexneri
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 4d3e |
| 沉积日期 deposition_date | 2014-10-21 |
| 结构标题 title | Tetramer of IpaD, modified from 2J0O, fitted into negative stain electron microscopy reconstruction of the wild type tip complex from the type III secretion system of Shigella flexneri |
| 关键词 keywords | CELL INVASION, TIP COMPLEX, TYPE III SECRETION SYSTEM, SHIGELLA FLEXNERI, WILD TYPE, IPAD; CELL INVASION |
| 实验方法 method | ELECTRON MICROSCOPY |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
4d3e__assembly_1__model_4
Assembly 1 · Model 4 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
4d3e__assembly_1__model_4 | I(q)
4d3e__assembly_1__model_4 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 25.19 Å |
| Rg（电子密度） | 25.31 Å |
| 总 Rg | 25.49 Å |
| 原子数 | 1621 |
| 残基数 | 208 |
| 排除体积 | 28716 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 4d3e__assembly_1__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 4d3e__assembly_1__model_2 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 4d3e__assembly_1__model_3 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 4d3e__assembly_1__model_4 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains
SCOP 2.08 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | d4d3ed_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.250 — IpaD-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.250.1 — IpaD-like |
| 家族 Family family | a.250.1.0 — automated matches |
CATH v4.4 (1 domains)
| 结构域编号 domain_id | 4d3eD00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1710 — IpaD-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — IpaD-like |