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1XIP
Crystal Structure of the N-terminal Domain of Nup159
提交 2004-09-21
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
2–387(386 aa)
片段:N-terminal domain
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;292 K;PEG3350, ammonium acetate, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.50 Å
R-free 0.249
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3PBP
Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex
提交 2010-10-20
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
1425–1460(36 aa)
片段:Tail, UNP residues 1425-1460
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;298 K;PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.60 Å
R-free 0.272
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3PBP
Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex
提交 2010-10-20
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 F
1425–1460(36 aa)
片段:Tail, UNP residues 1425-1460
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;298 K;PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.60 Å
R-free 0.272
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3PBP
Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex
提交 2010-10-20
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 I
1425–1460(36 aa)
片段:Tail, UNP residues 1425-1460
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;298 K;PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.60 Å
R-free 0.272
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3PBP
Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex
提交 2010-10-20
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 L
1425–1460(36 aa)
片段:Tail, UNP residues 1425-1460
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;298 K;PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.60 Å
R-free 0.272
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3RRM
S. cerevisiae dbp5 l327v bound to nup159, gle1 h337r, ip6 and adp
提交 2011-04-29
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
2–387(386 aa)
片段:unp residues 2-387
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未记录
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ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;20% PEG 3350, 200 mM KOAc, 20 mM sarcosine, 10 mM HEPES, 100 mM NaCl, 1 mM DTT, 0.5 mM IP6, 10 mM MgCl2, 1 mM ADP, 5% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.90 Å
R-free 0.261
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3TKN
Structure of the Nup82-Nup159-Nup98 heterotrimer
提交 2011-08-28
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 B
1425–1460(36 aa)
片段:UNP residues 1425-1460
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;18.5% PEG3350, 100 mM potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
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分辨率 3.40 Å
R-free 0.285
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3TKN
Structure of the Nup82-Nup159-Nup98 heterotrimer
提交 2011-08-28
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 E
1425–1460(36 aa)
片段:UNP residues 1425-1460
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;18.5% PEG3350, 100 mM potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
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分辨率 3.40 Å
R-free 0.285
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3TKN
Structure of the Nup82-Nup159-Nup98 heterotrimer
提交 2011-08-28
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 H
1425–1460(36 aa)
片段:UNP residues 1425-1460
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;18.5% PEG3350, 100 mM potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
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分辨率 3.40 Å
R-free 0.285
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7N9F
Structure of the in situ yeast NPC
提交 2021-06-17
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构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 448
PDB 声明:448-meric
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链 w
1–1460(1460 aa)
链 x
1–1460(1460 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
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分辨率 37.00 Å
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7N9F
Structure of the in situ yeast NPC
提交 2021-06-17
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构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 56
PDB 声明:56-meric
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链 w
1–1460(1460 aa)
链 x
1–1460(1460 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
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分辨率 37.00 Å
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7N9F
Structure of the in situ yeast NPC
提交 2021-06-17
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构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 56
PDB 声明:56-meric
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链 w
1–1460(1460 aa)
链 x
1–1460(1460 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
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分辨率 37.00 Å
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