SAXSdb — 4dx0

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3-like protein E

Nicotiana tabacum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	N.plumbaginifolia H+-translocating ATPase mRNA × 2 （Q42932） 4-[(4R)-4-(4-nitrophenyl)-6-oxidanylidene-3-phenyl-1,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-5-yl]benzoic acid × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	1433E_TOBAC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–243； UniProt 1–238

N.plumbaginifolia H+-translocating ATPase mRNA

Nicotiana plumbaginifolia

UniProt Q42932

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	14-3-3-like protein E × 2 （O49997） 4-[(4R)-4-(4-nitrophenyl)-6-oxidanylidene-3-phenyl-1,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-5-yl]benzoic acid × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q42932_NICPL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–31； UniProt 926–956

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4dx0
沉积日期 deposition_date	2012-02-27
结构标题 title	Structure of the 14-3-3/PMA2 complex stabilized by a pyrazole derivative
关键词 keywords	14-3-3 fold, Pyrrolidinones, PROTEIN BINDING-Hydrolase complex; PROTEIN BINDING/Hydrolase
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4dx0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4dx0__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4dx0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.97 Å
Rg（电子密度）	25.90 Å
总 Rg	26.78 Å
原子数	4206
残基数	520
排除体积	74585 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4dx0__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	14-3-3-like protein E
分子量 formula_weight	27485.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2112

GAMGSMAESTREENVYMAKLAEQAERYEEMVEFMEKVAKTVDVEELTVEERNLLSVAYKNVIGARRASWRIISSIEQKEESRGNEDHVSSIKEYRGKIEAELSKICDGILNLLESHLIPVASTAESKVFYLKMKGDYHRYLAEFKTGAERKEAAENTLLAYKSAQDIALAELAPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSSDRACNLAKQAFDDAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSD

来源 Source

来源生物 organism	Nicotiana tabacum
通用名 common_name	American tobacco,tobacco
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4097
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	N.plumbaginifolia H+-translocating ATPase mRNA
分子量 formula_weight	3597.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.3.6
突变 mutation	T955D, V956I
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

RRELHTLKGHVEAVVKLKGLDIETIQQSYDI

来源 Source

来源生物 organism	Nicotiana plumbaginifolia
通用名 common_name	leadwort-leaved tobacco
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4092
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	4-[(4R)-4-(4-nitrophenyl)-6-oxidanylidene-3-phenyl-1,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-5-yl]benzoic acid
分子量 formula_weight	440.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4dx0A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — 14-3-3 domain

▶

晶胞边长 a length_a	98.450 Å
晶胞边长 b length_b	98.450 Å
晶胞边长 c length_c	216.710 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	I 41 2 2
空间群编号 int_tables_number	98
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.400 Å
最低分辨率 resolution_low	19.830 Å
R 因子 r_factor	0.3577
R_work r_work	0.3556
R_free r_free	0.3992

Structure of the 14-3-3/PMA2 complex stabilized by a pyrazole derivative

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3-like protein E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

N.plumbaginifolia H+-translocating ATPase mRNA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4dx0__assembly_1__model_1

4dx0__assembly_1__model_1 | I(q)

4dx0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the 14-3-3/PMA2 complex stabilized by a pyrazole derivative

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3-like protein E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

N.plumbaginifolia H+-translocating ATPase mRNA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4dx0__assembly_1__model_1

4dx0__assembly_1__model_1 | I(q)

4dx0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)