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4e2e

Crystal structure of a tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, gamma polypeptide (YWHAG) from Homo sapiens at 2.25 A resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 66.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3 protein gamma

Homo sapiens

UniProt P61981

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–247 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；1.00M LiCl, 20.00% PEG-6000, 0.1M HEPES pH 7.0, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.25 Å R-free 0.229
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–247 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；1.00M LiCl, 20.00% PEG-6000, 0.1M HEPES pH 7.0, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K 分辨率 2.25 Å R-free 0.229

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4E2E Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2B05 Crystal Structure of 14-3-3 gamma in complex with a phosphoserine peptide 提交 2005-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–246（246 aa）
链 D 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.55 Å R-free 0.302
2B05 Crystal Structure of 14-3-3 gamma in complex with a phosphoserine peptide 提交 2005-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–246（246 aa）
链 C 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.55 Å R-free 0.302
2B05 Crystal Structure of 14-3-3 gamma in complex with a phosphoserine peptide 提交 2005-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–246（246 aa）
链 F 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.55 Å R-free 0.302
2B05 Crystal Structure of 14-3-3 gamma in complex with a phosphoserine peptide 提交 2005-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 A 1–246（246 aa）
链 B 1–246（246 aa）
链 C 1–246（246 aa）
链 D 1–246（246 aa）
链 E 1–246（246 aa）
链 F 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；PEG 3350, magnesium chloride, Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.55 Å R-free 0.302
3UZD Crystal structure of 14-3-3 GAMMA 提交 2011-12-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–247（247 aa）
未记录 NO3 NITRATE ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.3M Mg (OAc)2, 20% PEG3350, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.86 Å R-free 0.230
3UZD Crystal structure of 14-3-3 GAMMA 提交 2011-12-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–247（247 aa）
未记录 NO3 NITRATE ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.3M Mg (OAc)2, 20% PEG3350, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.86 Å R-free 0.230
3UZD Crystal structure of 14-3-3 GAMMA 提交 2011-12-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–247（247 aa）
未记录 NO3 NITRATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.3M Mg (OAc)2, 20% PEG3350, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.86 Å R-free 0.230
4J6S 14-3-3gamma complexed with the N-terminal sequence of tyrosine hydroxylase (residues 1-43) 提交 2013-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–247（247 aa）
链 B 1–247（247 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；283 K；30% PEG 2000 MME, 0.1M Potassium Thiocyanate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 283.0K
分辨率 3.08 Å R-free 0.254
4J6S 14-3-3gamma complexed with the N-terminal sequence of tyrosine hydroxylase (residues 1-43) 提交 2013-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–247（247 aa）
链 D 1–247（247 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；283 K；30% PEG 2000 MME, 0.1M Potassium Thiocyanate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 283.0K
分辨率 3.08 Å R-free 0.254
4O46 14-3-3-gamma in complex with influenza NS1 C-terminal tail phosphorylated at S228 提交 2013-12-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–247（247 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K；20% PEG3350, 0.2 M magnesium nitrate, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
4O46 14-3-3-gamma in complex with influenza NS1 C-terminal tail phosphorylated at S228 提交 2013-12-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–247（247 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K；20% PEG3350, 0.2 M magnesium nitrate, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
4O46 14-3-3-gamma in complex with influenza NS1 C-terminal tail phosphorylated at S228 提交 2013-12-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–247（247 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K；20% PEG3350, 0.2 M magnesium nitrate, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
4O46 14-3-3-gamma in complex with influenza NS1 C-terminal tail phosphorylated at S228 提交 2013-12-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–247（247 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K；20% PEG3350, 0.2 M magnesium nitrate, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
4O46 14-3-3-gamma in complex with influenza NS1 C-terminal tail phosphorylated at S228 提交 2013-12-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–247（247 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K；20% PEG3350, 0.2 M magnesium nitrate, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
4O46 14-3-3-gamma in complex with influenza NS1 C-terminal tail phosphorylated at S228 提交 2013-12-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K；20% PEG3350, 0.2 M magnesium nitrate, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
5D3E Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CFTR R-domain peptide pS768-pS795 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–238（238 aa）
链 B 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, NaCl, DTT, (NH4)2SO4, Poly(acrylic acid sodium salt 2100
分辨率 2.75 Å R-free 0.244
5D3E Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CFTR R-domain peptide pS768-pS795 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–238（238 aa）
链 F 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, NaCl, DTT, (NH4)2SO4, Poly(acrylic acid sodium salt 2100
分辨率 2.75 Å R-free 0.244
5D3E Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CFTR R-domain peptide pS768-pS795 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1–238（238 aa）
链 J 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, NaCl, DTT, (NH4)2SO4, Poly(acrylic acid sodium salt 2100
分辨率 2.75 Å R-free 0.244
6A5S Structure of 14-3-3 gamma in complex with TFEB 14-3-3 binding motif 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–247（247 aa）
链 B 1–247（247 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.3；289 K；0.1 M Tris-HCl, 0.2 M calcium acetate, and 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
6A5S Structure of 14-3-3 gamma in complex with TFEB 14-3-3 binding motif 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–247（247 aa）
链 G 1–247（247 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.3；289 K；0.1 M Tris-HCl, 0.2 M calcium acetate, and 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
6BYJ Structure of human 14-3-3 gamma bound to O-GlcNAc peptide 提交 2017-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–241（240 aa）
链 D 2–241（240 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；29% PEG 4000, 200 mM sodium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
6BYJ Structure of human 14-3-3 gamma bound to O-GlcNAc peptide 提交 2017-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–241（240 aa）
链 C 2–241（240 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；29% PEG 4000, 200 mM sodium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
6BYJ Structure of human 14-3-3 gamma bound to O-GlcNAc peptide 提交 2017-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–241（240 aa）
链 F 2–241（240 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；29% PEG 4000, 200 mM sodium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
6BYL Structure of 14-3-3 gamma bound to O-GlcNAcylated thr peptide 提交 2017-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–241（240 aa）
链 D 2–241（240 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；29% PEG 4000, 200 mM sodium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.285
6BYL Structure of 14-3-3 gamma bound to O-GlcNAcylated thr peptide 提交 2017-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–241（240 aa）
链 C 2–241（240 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；29% PEG 4000, 200 mM sodium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.285
6BYL Structure of 14-3-3 gamma bound to O-GlcNAcylated thr peptide 提交 2017-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–241（240 aa）
链 F 2–241（240 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；29% PEG 4000, 200 mM sodium acetate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.285
6BZD Structure of 14-3-3 gamma R57E mutant bound to GlcNAcylated peptide 提交 2017-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–247（246 aa）
链 B 2–247（246 aa）
突变：R57E 突变：R57E NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；25% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% glycerol
分辨率 2.67 Å R-free 0.281
6BZD Structure of 14-3-3 gamma R57E mutant bound to GlcNAcylated peptide 提交 2017-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–247（246 aa）
链 D 2–247（246 aa）
突变：R57E 突变：R57E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；25% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% glycerol
分辨率 2.67 Å R-free 0.281
6FEL Structure of 14-3-3 gamma in complex with CaMKK2 14-3-3 binding motif Ser511 提交 2018-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
链 B 1–234（234 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；291.15 K；sodium citrate, potassium sodium tartrate, and ammonium sulfate
分辨率 2.84 Å R-free 0.280
6FEL Structure of 14-3-3 gamma in complex with CaMKK2 14-3-3 binding motif Ser511 提交 2018-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–234（234 aa）
链 D 1–234（234 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；291.15 K；sodium citrate, potassium sodium tartrate, and ammonium sulfate
分辨率 2.84 Å R-free 0.280
6GKF Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 14-3-3 binding motif Ser139 提交 2018-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
链 B 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293.15 K；PEG 4000, TRIS-HCl, sodium acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
6GKF Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 14-3-3 binding motif Ser139 提交 2018-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–234（234 aa）
链 D 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293.15 K；PEG 4000, TRIS-HCl, sodium acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
6GKF Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 14-3-3 binding motif Ser139 提交 2018-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–234（234 aa）
链 F 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293.15 K；PEG 4000, TRIS-HCl, sodium acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
6GKF Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 14-3-3 binding motif Ser139 提交 2018-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293.15 K；PEG 4000, TRIS-HCl, sodium acetate
分辨率 2.60 Å R-free 0.289
6GKG Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 14-3-3 binding motif Ser164 提交 2018-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
链 E 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293.15 K；Tris-HCl, PEG 4000, lithium sulfate
分辨率 2.85 Å R-free 0.287
6GKG Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 14-3-3 binding motif Ser164 提交 2018-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–234（234 aa）
链 F 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293.15 K；Tris-HCl, PEG 4000, lithium sulfate
分辨率 2.85 Å R-free 0.287
6GKG Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 14-3-3 binding motif Ser164 提交 2018-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–234（234 aa）
链 G 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293.15 K；Tris-HCl, PEG 4000, lithium sulfate
分辨率 2.85 Å R-free 0.287
6GKG Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 14-3-3 binding motif Ser164 提交 2018-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293.15 K；Tris-HCl, PEG 4000, lithium sulfate
分辨率 2.85 Å R-free 0.287
6S9K Structure of 14-3-3 gamma in complex with caspase-2 peptide containing 14-3-3 binding motif Ser139 and NLS 提交 2019-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
突变：none CFH 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；PEG 400, calcium chloride, HEPES, 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol
分辨率 1.60 Å R-free 0.221
6SAD Structure of 14-3-3 gamma in complex with double phosphorylated caspase-2 peptide on Ser139 and Ser164 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–234（234 aa）
链 B 1–234（234 aa）
突变：none 突变：none 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；PEG 400, magnesium chloride, HEPES, 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol
分辨率 2.75 Å R-free 0.271
6Y4K Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CaMKK2 14-3-3 binding motif Ser100 and Fusicoccin A 提交 2020-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
链 B 1–234（234 aa）
未记录 FSC FUSICOCCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；PEG400, HEPES, magnesium chloride, hexafluoropropanol
分辨率 3.00 Å R-free 0.292
6Y6B Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CaMKK2 14-3-3 binding motif Ser100 and 16-OMe-Fusicoccin H 提交 2020-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
链 B 1–234（234 aa）
未记录 OD8 (2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{S})-2-(hydroxymethyl)-6-[[(1~{S},3~{R},6~{S},7~{S},8~{R},9~{R},10~{R},11~{R},14~{S})-14-(me thoxymethyl)-3,10-dimethyl-9-oxidanyl-6-propan-2-yl-8-tricyclo[9.3.0.0^{3,7}]tetradecanyl]oxy]oxane-3,4,5-triol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；PEG400, HEPES, magnesium chloride, hexafluoropropanol
分辨率 3.08 Å R-free 0.282
6ZBT Structure of 14-3-3 gamma in complex with Nedd4-2 14-3-3 binding motif Ser342 提交 2020-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
链 B 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop CFH 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；PEG 400, magnesium chloride, HEPES, hexafluoro-2-propanol
分辨率 1.80 Å R-free 0.241
6ZBT Structure of 14-3-3 gamma in complex with Nedd4-2 14-3-3 binding motif Ser342 提交 2020-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–234（234 aa）
链 D 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop CFH 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；PEG 400, magnesium chloride, HEPES, hexafluoro-2-propanol
分辨率 1.80 Å R-free 0.241
6ZC9 Structure of 14-3-3 gamma in complex with Nedd4-2 14-3-3 binding motif Ser448 提交 2020-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
链 C 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；PEG 400, magnesium chloride, HEPES, hexafluoro-2-propanol
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
6ZC9 Structure of 14-3-3 gamma in complex with Nedd4-2 14-3-3 binding motif Ser448 提交 2020-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–234（234 aa）
链 D 1–234（234 aa）
突变：S235Stop 突变：S235Stop CFH 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；PEG 400, magnesium chloride, HEPES, hexafluoro-2-propanol
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
7A6R Structure of 14-3-3 gamma in complex with DAPK2 peptide containing the 14-3-3 binding motif 提交 2020-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
链 C 1–234（234 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290.15 K；HEPES, MgCl2, PEG400, hexafluoro-2-propanol
分辨率 2.70 Å R-free 0.275
7A6R Structure of 14-3-3 gamma in complex with DAPK2 peptide containing the 14-3-3 binding motif 提交 2020-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–234（234 aa）
链 D 1–234（234 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290.15 K；HEPES, MgCl2, PEG400, hexafluoro-2-propanol
分辨率 2.70 Å R-free 0.275
7A6Y Structure of 14-3-3 gamma in complex with DAPK2 peptide stabilized by FC-A 提交 2020-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–234（234 aa）
链 C 1–234（234 aa）
未记录 FSC FUSICOCCIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290.15 K；HEPES, MgCl2, PEG400, hexafluoro-2-propanol, FC-A
分辨率 2.50 Å R-free 0.259
7A6Y Structure of 14-3-3 gamma in complex with DAPK2 peptide stabilized by FC-A 提交 2020-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–234（234 aa）
链 D 1–234（234 aa）
未记录 FSC FUSICOCCIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290.15 K；HEPES, MgCl2, PEG400, hexafluoro-2-propanol, FC-A
分辨率 2.50 Å R-free 0.259
9CI3 Structure of the LRRK2/14-3-3 complex 提交 2024-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–247（247 aa）
链 C 1–247（247 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.96 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 1433G_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–248； UniProt 1–247

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4e2e

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4e2e
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4e2e
沉积日期 deposition_date2012-03-08
结构标题 titleCrystal structure of a tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, gamma polypeptide (YWHAG) from Homo sapiens at 2.25 A resolution
关键词 keywords;14-3-3 domain, signal transduction, cell signaling, protein binding, Structural Genomics, Joint Center for Structural Genomics, JCSG, Protein Structure Initiative, PSI-BIOLOGY, SIGNALING PROTEIN, Partnership for T-Cell Biology, TCELL ;; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.04 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.09 Å
零角强度 I(0) i013602100.00
分子量 molecular_weight26695.0 kDa
排除体积 excluded_volume32937 ų
包络体积 envelope_volume39618 ų
水化壳体积 shell_volume17781 ų
包络直径 envelope_diameter68.0 Å
壳层 Rg shell_rg24.96 Å
包络 Rg envelope_rg19.51 Å
形状 Rg shape_rg19.08 Å
总 Rg total_rg19.97 Å
总原子数 total_atoms1856
残基数 n_residues228
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax66.4 Å
Rg (实空间) rg_real20.01 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.50 Å
I(0) (实空间) i0_real1.3600e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.6590e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal20.02 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal13600000.0000
解质量估计 total_estimate0.8088
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary25.6 Å
偏度 Skewness skewness0.300
峰度 Kurtosis kurtosis-0.225
角度范围 angular_range— – 0.3950 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha2693000.0000
实空间数据点数 n_real_points71
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.838; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd4e2ea_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.7 — 14-3-3 protein
家族 Family familya.118.7.1 — 14-3-3 protein

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id4e2eA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — 14-3-3 domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)