4egg

Computationally Designed Self-assembling tetrahedron protein, T310

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative acetyltransferase SACOL2570

Staphylococcus aureus subsp. aureus

UniProt Q5HCZ5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 12 GLYCEROL × 16 water × 12 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATRF2_STAAC
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–199; UniProt 1–199 作者链 B; PDB构建体 1–199; UniProt 1–199 作者链 C; PDB构建体 1–199; UniProt 1–199 作者链 D; PDB构建体 1–199; UniProt 1–199 作者链 E; PDB构建体 1–199; UniProt 1–199 作者链 F; PDB构建体 1–199; UniProt 1–199

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4egg
沉积日期 deposition_date2012-03-30
结构标题 titleComputationally Designed Self-assembling tetrahedron protein, T310
关键词 keywordsself assembling tetrahedron design, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4egg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4egg__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4egg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)39.71 Å
Rg(电子密度)38.84 Å
总 Rg39.25 Å
原子数17552
残基数2254
排除体积312320 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4egg__assembly_1__model_1 dodecameric (12) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id4eggA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hexapeptide repeat proteins
结构域编号 domain_id4eggB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hexapeptide repeat proteins
结构域编号 domain_id4eggC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hexapeptide repeat proteins
结构域编号 domain_id4eggD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hexapeptide repeat proteins
结构域编号 domain_id4eggE00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hexapeptide repeat proteins
结构域编号 domain_id4eggF00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hexapeptide repeat proteins
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7. 引用文献 (1)