Shigella flexneri
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | CcdB × 2 （Q84B82） SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | GYRA_SHIFL |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 22–156； UniProt 363–497 作者链 B； PDB构建体 22–156； UniProt 363–497 |
Aliivibrio fischeri
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | DNA gyrase subunit A × 2 （P0AES5） SULFATE ION × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q84B82_VIBFI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–105； UniProt 1–105 作者链 D； PDB构建体 1–105； UniProt 1–105 |
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| 条目编号 entry_id | 4ely |
| 沉积日期 deposition_date | 2012-04-11 |
| 结构标题 title | CCDBVFI:GYRA14EC |
| 关键词 keywords | ALPHA+BETA, TOPOISOMERASE, TOXIN-ISOMERASE complex; TOXIN/ISOMERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 24.52 Å |
| Rg（电子密度） | 23.13 Å |
| 总 Rg | 23.95 Å |
| 原子数 | 3612 |
| 残基数 | 466 |
| 排除体积 | 64788 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4elya_ |
| 类 Class class | e — Multi-domain proteins (alpha and beta) |
| 折叠类型 Fold fold | e.11 — Type II DNA topoisomerase C-terminal domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | e.11.1 — Type II DNA topoisomerase C-terminal domain-like |
| 家族 Family family | e.11.1.1 — Type II DNA topoisomerase C-terminal domain-like |
| 结构域编号 domain_id | d4elyb_ |
| 类 Class class | e — Multi-domain proteins (alpha and beta) |
| 折叠类型 Fold fold | e.11 — Type II DNA topoisomerase C-terminal domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | e.11.1 — Type II DNA topoisomerase C-terminal domain-like |
| 家族 Family family | e.11.1.1 — Type II DNA topoisomerase C-terminal domain-like |
| 结构域编号 domain_id | d4elyc_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.6 — Cell growth inhibitor/plasmid maintenance toxic component |
| 家族 Family family | b.34.6.1 — CcdB |
| 结构域编号 domain_id | d4elyd_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.6 — Cell growth inhibitor/plasmid maintenance toxic component |
| 家族 Family family | b.34.6.1 — CcdB |
| 结构域编号 domain_id | 4elyA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 268 — Topoisomerase; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Topoisomerase, domain 3 |
| 结构域编号 domain_id | 4elyB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 268 — Topoisomerase; domain 3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Topoisomerase, domain 3 |
| 结构域编号 domain_id | 4elyC00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 110 — |
| 结构域编号 domain_id | 4elyD00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 110 — |