Mus musculus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*TP*CP*AP*GP*CP*GP*CP*AP*TP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*AP*TP*GP*(5HU)P*GP*CP*TP*GP*A)-3') ; × 1 1,2-ETHANEDIOL × 3 NICKEL (II) ION × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | MBD4_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–146； UniProt 411–554 |
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| 条目编号 entry_id | 4ew0 |
| 沉积日期 deposition_date | 2012-04-26 |
| 结构标题 title | mouse MBD4 glycosylase domain in complex with a G:5hmU (5-hydroxymethyluracil) mismatch |
| 关键词 keywords | ;5-hydroxymethyluracil, deamination, 5-methylcytosine, active DNA demethylation, Helix-hairpin-Helix, DNA glycosylase, HYDROLASE-DNA complex ;; HYDROLASE/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.03 Å |
| Rg（电子密度） | 16.88 Å |
| 总 Rg | 17.77 Å |
| 原子数 | 1647 |
| 残基数 | 164 |
| 排除体积 | 28052 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4ew0A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 340 — Endonuclease III; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Hypothetical protein; domain 2 |