4ew4

mouse MBD4 glycosylase domain in complex with DNA containing a ribose sugar

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methyl-CpG-binding domain protein 4

Mus musculus

UniProt Q9Z2D7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*TP*CP*AP*GP*CP*GP*CP*AP*TP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*AP*TP*GP*(3DR)P*GP*CP*TP*GP*A)-3') ; × 1 NICKEL (II) ION × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 1 water × 3 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MBD4_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–146; UniProt 411–554

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4ew4
沉积日期 deposition_date2012-04-26
结构标题 titlemouse MBD4 glycosylase domain in complex with DNA containing a ribose sugar
关键词 keywordsstable intermediate, N-glycosidic bond, Helix-hairpin-Helix, DNA glycosylase, HYDROLASE-DNA complex; HYDROLASE/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4ew4__assembly_1__model_1 trimeric (3) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id4ew4A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology340 — Endonuclease III; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Hypothetical protein; domain 2
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7. 引用文献 (1)