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3HI9
The x-ray crystal structure of the first RNA recognition motif (RRM1) of the AU-rich element (ARE) binding protein HuR at 2.0 angstrom resolution
提交 2009-05-19
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构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
18–99(82 aa)
片段:RRM1 domain: UNP residues 18-99
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;0.2 M Di-ammonium citrate, 20% w/v PEG 3350, 5% Glycerol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.232
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3HI9
The x-ray crystal structure of the first RNA recognition motif (RRM1) of the AU-rich element (ARE) binding protein HuR at 2.0 angstrom resolution
提交 2009-05-19
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构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 B
18–99(82 aa)
片段:RRM1 domain: UNP residues 18-99
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;0.2 M Di-ammonium citrate, 20% w/v PEG 3350, 5% Glycerol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.232
|
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3HI9
The x-ray crystal structure of the first RNA recognition motif (RRM1) of the AU-rich element (ARE) binding protein HuR at 2.0 angstrom resolution
提交 2009-05-19
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构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 C
18–99(82 aa)
片段:RRM1 domain: UNP residues 18-99
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;0.2 M Di-ammonium citrate, 20% w/v PEG 3350, 5% Glycerol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.232
|
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3HI9
The x-ray crystal structure of the first RNA recognition motif (RRM1) of the AU-rich element (ARE) binding protein HuR at 2.0 angstrom resolution
提交 2009-05-19
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构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 D
18–99(82 aa)
片段:RRM1 domain: UNP residues 18-99
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293 K;0.2 M Di-ammonium citrate, 20% w/v PEG 3350, 5% Glycerol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.232
|
|
4ED5
Crystal structure of the two N-terminal RRM domains of HuR complexed with RNA
提交 2012-03-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:dimeric
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链 A
18–186(169 aa)
片段:RRM1/RRM2 domains, UNP RESIDUES 18-186
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未记录
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GOL GLYCEROL × 7
M2M 1-METHOXY-2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;287 K;18% PEG 5000, 0.1M HEPES, pH7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.257
|
|
4ED5
Crystal structure of the two N-terminal RRM domains of HuR complexed with RNA
提交 2012-03-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白–RNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:dimeric
|
链 B
18–186(169 aa)
片段:RRM1/RRM2 domains, UNP RESIDUES 18-186
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;287 K;18% PEG 5000, 0.1M HEPES, pH7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.257
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4EGL
Crystal structure of two tandem RNA recognition motifs of Human antigen R
提交 2012-03-31
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
18–186(169 aa)
片段:N-terminal RRM1 and RRM2 domain, UNP residues 18-186
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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SO4 SULFATE ION × 1
GOL GLYCEROL × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;287 K;1.5M Lithium sulfate monohydrate, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.294
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5SZW
NMR solution structure of the RRM1 domain of the post-transcriptional regulator HuR
提交 2016-08-15
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构建体不同
突变/修饰不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
28–126(99 aa)
片段:UNP residues 28-126
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成
1.5 mM [U-15N] HuR_RRM1, 30 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HuR_RRM1, 30 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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6G2K
Structure of HuR RRM3 in complex with RNA (UUUUUU)
提交 2018-03-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
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链 A
270–353(84 aa)
链 B
270–353(84 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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SO4 SULFATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M TRIS pH 8.5 and 2.25 M ammonium sulphate
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分辨率 2.01 Å
R-free 0.235
|
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6G2K
Structure of HuR RRM3 in complex with RNA (UUUUUU)
提交 2018-03-23
|
构建体不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 C
270–353(84 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M TRIS pH 8.5 and 2.25 M ammonium sulphate
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分辨率 2.01 Å
R-free 0.235
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6GC5
Molecular basis for AU-rich element recognition and dimerization by the HuR C-terminal RRM
提交 2018-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
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链 A
241–326(86 aa)
链 B
241–326(86 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;20 mM Tris (pH8), 100 mM NaCl, 10% (w/v) Glycerol, 1mM TCEP
precipitant: 2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris well
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.231
|
|
6GC5
Molecular basis for AU-rich element recognition and dimerization by the HuR C-terminal RRM
提交 2018-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
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链 C
241–326(86 aa)
链 D
241–326(86 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;20 mM Tris (pH8), 100 mM NaCl, 10% (w/v) Glycerol, 1mM TCEP
precipitant: 2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris well
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.231
|
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6GC5
Molecular basis for AU-rich element recognition and dimerization by the HuR C-terminal RRM
提交 2018-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白–RNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:dimeric
|
链 A
241–326(86 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;20 mM Tris (pH8), 100 mM NaCl, 10% (w/v) Glycerol, 1mM TCEP
precipitant: 2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris well
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.231
|
|
6GC5
Molecular basis for AU-rich element recognition and dimerization by the HuR C-terminal RRM
提交 2018-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 4
蛋白–RNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:dimeric
|
链 B
241–326(86 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;20 mM Tris (pH8), 100 mM NaCl, 10% (w/v) Glycerol, 1mM TCEP
precipitant: 2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris well
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.231
|
|
6GC5
Molecular basis for AU-rich element recognition and dimerization by the HuR C-terminal RRM
提交 2018-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 5
蛋白–RNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:dimeric
|
链 C
241–326(86 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;20 mM Tris (pH8), 100 mM NaCl, 10% (w/v) Glycerol, 1mM TCEP
precipitant: 2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris well
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.231
|
|
6GC5
Molecular basis for AU-rich element recognition and dimerization by the HuR C-terminal RRM
提交 2018-04-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白–RNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:dimeric
|
链 D
241–326(86 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;20 mM Tris (pH8), 100 mM NaCl, 10% (w/v) Glycerol, 1mM TCEP
precipitant: 2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris well
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.231
|
|
6GD1
Structure of HuR RRM3
提交 2018-04-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
243–326(84 aa)
链 B
243–326(84 aa)
|
未记录
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NA SODIUM ION × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;23% (w/v) PEG 2000 MME, 0.1 M potassium thiocyanate
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.244
|
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6GD2
Structure of HuR RRM3 in complex with RNA
提交 2018-04-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 A
243–326(84 aa)
链 B
243–326(84 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 10% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.245
|
|
6GD2
Structure of HuR RRM3 in complex with RNA
提交 2018-04-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
243–326(84 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 10% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.245
|
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6GD3
Structure of HuR RRM3 in complex with RNA (UAUUUA)
提交 2018-04-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
243–326(84 aa)
|
未记录
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NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M ammonium acetate, 0.01 M calcium chloride, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5 and 10 % (w/v) PEG 4000
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分辨率 1.35 Å
R-free 0.189
|
|
6GD3
Structure of HuR RRM3 in complex with RNA (UAUUUA)
提交 2018-04-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 B
243–326(84 aa)
链 C
243–326(84 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M ammonium acetate, 0.01 M calcium chloride, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5 and 10 % (w/v) PEG 4000
|
分辨率 1.35 Å
R-free 0.189
|
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9W2F
Cryo-EM structure of DDB1-CRBN in complex with dHuR-2 and HuR
提交 2025-07-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
15–99(85 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 1
A1EUN (3S)-3-[6-[1-[(4-methoxyphenyl)methyl]pyrazol-4-yl]-1-benzofuran-3-yl]piperidine-2,6-dione × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å
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