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4g8l

Active state of intact sensor domain of human RNase L with 2-5A bound

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

2-5A-dependent ribonuclease

Homo sapiens

UniProt Q05823

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 5'-O-MONOPHOSPHORYLADENYLYL(2'->5')ADENYLYL(2'->5')ADENOSINE × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 5'-O-MONOPHOSPHORYLADENYLYL(2'->5')ADENYLYL(2'->5')ADENOSINE × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 5'-O-MONOPHOSPHORYLADENYLYL(2'->5')ADENYLYL(2'->5')ADENOSINE × 1 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 5'-O-MONOPHOSPHORYLADENYLYL(2'->5')ADENYLYL(2'->5')ADENOSINE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1wdy 4g8k 4g8k 4g8l 4g8l 4g8l 4g8l

共 7 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
4oau 4oav

共 2 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RN5A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–337； UniProt 1–337 作者链 B； PDB构建体 1–337； UniProt 1–337 作者链 C； PDB构建体 1–337； UniProt 1–337 作者链 D； PDB构建体 1–337； UniProt 1–337

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4g8l
沉积日期 deposition_date2012-07-23
结构标题 titleActive state of intact sensor domain of human RNase L with 2-5A bound
关键词 keywordsAnkyrin-repeat domain, single-stranded RNA, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4g8l__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4g8l__assembly_3__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4g8l__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）25.63 Å
Rg（电子密度）25.52 Å
总 Rg26.09 Å
原子数2361
残基数300
排除体积41886 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4g8l__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4g8l__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 4g8l__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 4g8l__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id4g8lA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ankyrin repeat-containing domain
结构域编号 domain_id4g8lB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ankyrin repeat-containing domain
结构域编号 domain_id4g8lC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ankyrin repeat-containing domain
结构域编号 domain_id4g8lD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ankyrin repeat-containing domain
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7. 引用文献 (1)