← 返回搜索
4hgq

Crystal structure of E56A mutant of 2-keto-3-deoxy-D-glycero-D-galactonononate-9-phosphate phosphohydrolase from Bacteroides thetaiotaomicron

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acylneuraminate cytidylyltransferase

Bacteroides thetaiotaomicron

UniProt Q8A712

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体
3e81 3e84 3e8m 4hgo 4hgq 4hgq 4hgr 4hgr

共 8 个 assembly

其他同源多聚体
3e81 3e84 3e8m

共 3 个 assembly

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8A712_BACTN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 B； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 C； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 D； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 E； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 F； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 G； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 H； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4hgq
沉积日期 deposition_date2012-10-08
结构标题 titleCrystal structure of E56A mutant of 2-keto-3-deoxy-D-glycero-D-galactonononate-9-phosphate phosphohydrolase from Bacteroides thetaiotaomicron
关键词 keywordsRossmann Fold, Phosphohydroylase, Transferase, Hydrolase; Transferase, Hydrolase
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4hgq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4hgq__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4hgq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）27.09 Å
Rg（电子密度）26.29 Å
总 Rg27.30 Å
原子数5164
残基数656
排除体积92909 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4hgq__assembly_1__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4hgq__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd4hgqa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4hgqb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4hgqc_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4hgqd_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4hgqe_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4hgqf_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4hgqg_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4hgqh_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.108 — HAD-like
超家族 Superfamily superfamilyc.108.1 — HAD-like
家族 Family familyc.108.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id4hgqA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id4hgqB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id4hgqC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id4hgqD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id4hgqE00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id4hgqF00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id4hgqG00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
结构域编号 domain_id4hgqH00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 — HAD superfamily/HAD-like
▶

7. 引用文献 (1)