4i7d

Siah1 bound to synthetic peptide (ACE)KLRPVAMVRP(PRK)VR

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1

Homo sapiens

UniProt Q8IUQ4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Protein phyllopod × 1 (Q27934) ZINC ION × 2 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Protein phyllopod × 1 (Q27934) ZINC ION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SIAH1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–196; UniProt 90–282 作者链 C; PDB构建体 4–196; UniProt 90–282

Protein phyllopod

物种未注明

UniProt Q27934

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1 × 1 (Q8IUQ4) ZINC ION × 2 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1 × 1 (Q8IUQ4) ZINC ION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PHYL_DROME
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 2–14; UniProt 113–125 作者链 D; PDB构建体 2–14; UniProt 113–125

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4i7d
沉积日期 deposition_date2012-11-30
结构标题 titleSiah1 bound to synthetic peptide (ACE)KLRPVAMVRP(PRK)VR
关键词 keywordsSina, beta sandwich, zinc finger, ubiquitin ligase, covalent inhibitor, LIGASE-LIGASE INHIBITOR complex; LIGASE/LIGASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4i7d__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4i7d__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4i7d__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.66 Å
Rg(电子密度)18.90 Å
总 Rg19.71 Å
原子数1591
残基数199
排除体积28454 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4i7d__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4i7d__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id4i7dA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)
结构域编号 domain_id4i7dA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology210 — Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A
结构域编号 domain_id4i7dC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)
结构域编号 domain_id4i7dC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology210 — Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A
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7. 引用文献 (1)