SAXSdb — 4ii4

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit A

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit C × 2 （P76079） benzoyl coenzyme A × 2 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAAA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–311； UniProt 2–309

1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit C

Escherichia coli

UniProt P76079

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit A × 2 （P76077） benzoyl coenzyme A × 2 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAAC_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 13–259； UniProt 2–248 作者链 C； PDB构建体 13–259； UniProt 2–248

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4ii4
沉积日期 deposition_date	2012-12-19
结构标题 title	The Phenylacetyl-CoA monooxygenase - mutant PaaA E49Q K68Q - PaaC wild type subcomplex with benzoyl-CoA
关键词 keywords	;protein-protein complex, Structural Genomics, Montreal-Kingston Bacterial Structural Genomics Initiative, BSGI, ferritin-like fold, bacterial multicomponent monooxygenase PaaABCE, OXIDOREDUCTASE ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4ii4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4ii4__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4ii4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	33.26 Å
Rg（电子密度）	32.41 Å
总 Rg	32.93 Å
原子数	8800
残基数	1104
排除体积	154550 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4ii4__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4ii4__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit A
分子量 formula_weight	35786.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.14.13.149
突变 mutation	E49Q, K68Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6266

MRSTQEERFEQRIAQETAIEPQDWMPDAYRKTLIRQIGQHAHSEIVGMLPQGNWITRAPTLRRKAILLAQVQDEAGHGLYLYSAAETLGCAREDIYQKMLDGRMKYSSIFNYPTLSWADIGVIGWLVDGAAIVNQVALCRTSYGPYARAMVKICKEESFHQRQGFEACMALAQGSEAQKQMLQDAINRFWWPALMMFGPNDDNSPNSARSLTWKIKRFTNDELRQRFVDNTVPQVEMLGMTVPDPDLHFDTESGHYRFGEIDWQEFNEVINGRGICNQERLDAKRKAWEEGTWVREAALAHAQKQHARKVA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	511145
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit C
分子量 formula_weight	29109.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.14.13.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C

MGSSHHHHHHGSNQLTAYTLRLGDNCLVLSQRLGEWCGHAPELEIDLALANIGLDLLGQARNFLSYAAELAGEGDEDTLAFTRDERQFSNLLLVEQPNGNFADTIARQYFIDAWHVALFTRLMESRDPQLAAISAKAIKEARYHLRFSRGWLERLGNGTDVSGQKMQQAINKLWRFTAELFDADEIDIALSEEGIAVDPRTLRAAWEAEVFAGINEATLNVPQEQAYRTGGKKGLHTEHLGPMLAEMQYLQRVLPGQQW

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	511145
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	benzoyl coenzyme A
分子量 formula_weight	871.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	25

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d4ii4b1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.25.1 — Ferritin-like
家族 Family family	a.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like

结构域编号 domain_id	d4ii4b2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4ii4c1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.25 — Ferritin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.25.1 — Ferritin-like
家族 Family family	a.25.1.2 — Ribonucleotide reductase-like

结构域编号 domain_id	d4ii4c2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	4ii4A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1260 — Ferritin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle

结构域编号 domain_id	4ii4B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1260 — Ferritin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle

结构域编号 domain_id	4ii4C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1260 — Ferritin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle

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晶胞边长 a length_a	77.595 Å
晶胞边长 b length_b	77.595 Å
晶胞边长 c length_c	304.692 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.799 Å
最低分辨率 resolution_low	26.638 Å
R 因子 r_factor	0.2213
R_work r_work	0.2184
R_free r_free	0.2755

The Phenylacetyl-CoA monooxygenase - mutant PaaA E49Q K68Q - PaaC wild type subcomplex with benzoyl-CoA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4ii4__assembly_1__model_1

4ii4__assembly_1__model_1 | I(q)

4ii4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

The Phenylacetyl-CoA monooxygenase - mutant PaaA E49Q K68Q - PaaC wild type subcomplex with benzoyl-CoA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

1,2-phenylacetyl-CoA epoxidase, subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4ii4__assembly_1__model_1

4ii4__assembly_1__model_1 | I(q)

4ii4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)