Xenopus laevis
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ;[(4S,5R)-2-(4-tert-butyl-2-ethoxyphenyl)-4,5-bis(4-chlorophenyl)-4,5-dimethyl-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-yl]{4-[3-(methylsulfonyl)propyl]piperazin-1-yl}methanone ; × 1 SULFATE ION × 2 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | MDM2_XENLA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–85； UniProt 21–105 |
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| 条目编号 entry_id | 4ipf |
| 沉积日期 deposition_date | 2013-01-09 |
| 结构标题 title | The 1.7A crystal structure of humanized Xenopus MDM2 with RO5045337 |
| 关键词 keywords | MDM2, P53, PROTEIN-PROTEIN INTERACTION, IMIDAZOLINE, E3 UBIQUITIN LIGASE, NUCLEUS, LIGASE-ANTAGONIST complex; LIGASE/ANTAGONIST |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 14.06 Å |
| Rg（电子密度） | 12.56 Å |
| 总 Rg | 14.00 Å |
| 原子数 | 749 |
| 残基数 | 85 |
| 排除体积 | 13536 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4ipfa_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.42 — SWIB/MDM2 domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.42.1 — SWIB/MDM2 domain |
| 家族 Family family | a.42.1.1 — SWIB/MDM2 domain |
| 结构域编号 domain_id | 4ipfA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 245 — MDM2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — SWIB/MDM2 domain |