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4iqr

Multi-Domain Organization of the HNF4alpha Nuclear Receptor Complex on DNA

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hepatocyte nuclear factor 4-alpha

Homo sapiens

UniProt P41235

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 2 ;DNA (5'-D(*GP*GP*AP*AP*CP*TP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*AP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*TP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*AP*GP*TP*TP*C)-3') ; × 1 Nuclear receptor coactivator 2 × 2 （Q15596） MYRISTIC ACID × 2 ZINC ION × 4 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 2 ;DNA (5'-D(*GP*GP*AP*AP*CP*TP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*AP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*TP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*AP*GP*TP*TP*C)-3') ; × 1 Nuclear receptor coactivator 2 × 2 （Q15596） MYRISTIC ACID × 2 ZINC ION × 4 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
4b7w

共 1 个 assembly

异源或核酸复合物
1pzl 3cbb 3fs1 4iqr 4iqr 6cht 6cht 8c1l 9ibr

共 9 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HNF4A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 16–338； UniProt 55–377 作者链 B； PDB构建体 16–338； UniProt 55–377 作者链 E； PDB构建体 16–338； UniProt 55–377 作者链 F； PDB构建体 16–338； UniProt 55–377

Nuclear receptor coactivator 2

物种未注明

UniProt Q15596

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 2 Hepatocyte nuclear factor 4-alpha × 2 （P41235） ;DNA (5'-D(*GP*GP*AP*AP*CP*TP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*AP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*TP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*AP*GP*TP*TP*C)-3') ; × 1 MYRISTIC ACID × 2 ZINC ION × 4 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 4 DNA 2 Hepatocyte nuclear factor 4-alpha × 2 （P41235） ;DNA (5'-D(*GP*GP*AP*AP*CP*TP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*AP*AP*GP*GP*TP*CP*AP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*CP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*TP*TP*GP*AP*CP*CP*TP*AP*GP*TP*TP*C)-3') ; × 1 MYRISTIC ACID × 2 ZINC ION × 4 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
4wg0

共 1 个 assembly

异源或核酸复合物
1gwq 1gwr 1gwr 1m2z 1mv9 1mvc 1mzn 1mzn 1p93 1p93 1p93 1p93

共 334 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NCOA2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–13； UniProt 685–697 作者链 J； PDB构建体 1–13； UniProt 685–697 作者链 K； PDB构建体 1–13； UniProt 685–697 作者链 L； PDB构建体 1–13； UniProt 685–697

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4iqr
沉积日期 deposition_date2013-01-13
结构标题 titleMulti-Domain Organization of the HNF4alpha Nuclear Receptor Complex on DNA
关键词 keywordsTranscription Factor, Transcription-DNA complex; Transcription/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4iqr__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4iqr__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4iqr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）33.31 Å
Rg（电子密度）32.50 Å
总 Rg33.24 Å
原子数5878
残基数668
排除体积103030 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4iqr__assembly_1__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4iqr__assembly_2__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id4iqrA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Erythroid Transcription Factor GATA-1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Erythroid Transcription Factor GATA-1, subunit A
结构域编号 domain_id4iqrA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Retinoid X Receptor
结构域编号 domain_id4iqrB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Erythroid Transcription Factor GATA-1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Erythroid Transcription Factor GATA-1, subunit A
结构域编号 domain_id4iqrB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Retinoid X Receptor
结构域编号 domain_id4iqrE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Erythroid Transcription Factor GATA-1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Erythroid Transcription Factor GATA-1, subunit A
结构域编号 domain_id4iqrE02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Retinoid X Receptor
结构域编号 domain_id4iqrF01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Erythroid Transcription Factor GATA-1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Erythroid Transcription Factor GATA-1, subunit A
结构域编号 domain_id4iqrF02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology565 — Retinoid X Receptor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Retinoid X Receptor
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7. 引用文献 (1)