4iua

Crystal Structure of the NK2 Fragment (31-290) of the mouse Hepatocyte Growth Factor/Scatter Factor

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hepatocyte growth factor

Mus musculus

UniProt Q08048

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SULFATE ION × 2 与蛋白数一致
10 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 4 SULFATE ION × 4 与蛋白数一致
11 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 SULFATE ION × 4 与蛋白数一致
12 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 SULFATE ION × 2 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 SULFATE ION × 3 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 SULFATE ION × 1 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SULFATE ION × 3 与蛋白数一致
5 蛋白单体 单体 蛋白 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 与蛋白数一致
6 蛋白单体 单体 蛋白 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SULFATE ION × 3 与蛋白数一致
7 蛋白单体 单体 蛋白 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SULFATE ION × 2 与蛋白数一致
8 蛋白单体 单体 蛋白 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SULFATE ION × 1 与蛋白数一致
9 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 SULFATE ION × 5 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HGF_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–262; UniProt 31–290 作者链 B; PDB构建体 3–262; UniProt 31–290 作者链 C; PDB构建体 3–262; UniProt 31–290 作者链 D; PDB构建体 3–262; UniProt 31–290 作者链 E; PDB构建体 3–262; UniProt 31–290 作者链 F; PDB构建体 3–262; UniProt 31–290 作者链 G; PDB构建体 3–262; UniProt 31–290 作者链 H; PDB构建体 3–262; UniProt 31–290

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4iua
沉积日期 deposition_date2013-01-20
结构标题 titleCrystal Structure of the NK2 Fragment (31-290) of the mouse Hepatocyte Growth Factor/Scatter Factor
关键词 keywordsHGF/SF, HORMONE, KRINGLE domain, GROWTH FACTOR; HORMONE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4iua__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4iua__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4iua__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.67 Å
Rg(电子密度)20.05 Å
总 Rg20.87 Å
原子数2113
残基数254
排除体积36981 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4iua__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4iua__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 4iua__assembly_3__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 4iua__assembly_4__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 4iua__assembly_5__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 4iua__assembly_6__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
7 1 4iua__assembly_7__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
8 1 4iua__assembly_8__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
9 1 4iua__assembly_9__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
10 1 4iua__assembly_10__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
11 1 4iua__assembly_11__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
12 1 4iua__assembly_12__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

结构域编号 domain_idd4iuaa1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd4iuaa2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuaa3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuab1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd4iuab2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuab3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuac1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd4iuac2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuac3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuad1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd4iuad2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuad3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuae1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd4iuae2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuae3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuaf1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd4iuaf2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuaf3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuag1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd4iuag2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuag3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuah1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd4iuah2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd4iuah3
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id4iuaA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id4iuaA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaA03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id4iuaB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaB03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id4iuaC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaC03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id4iuaD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaD03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id4iuaE02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaE03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaF01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id4iuaF02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaF03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id4iuaG02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaG03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaH01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id4iuaH02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id4iuaH03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
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7. 引用文献 (1)