Xenopus laevis
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 4-({(4S,5R)-4,5-bis(4-chlorophenyl)-2-[4-methoxy-2-(propan-2-yloxy)phenyl]-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-yl}carbonyl)piperazin-2-one × 1 SULFATE ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | MDM2_XENLA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–86； UniProt 21–105 |
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| 条目编号 entry_id | 4j3e |
| 沉积日期 deposition_date | 2013-02-05 |
| 结构标题 title | The 1.9A crystal structure of humanized Xenopus Mdm2 with nutlin-3a |
| 关键词 keywords | Mdm2, protein-protein interaction, imidazoline, ligase-antagonist complex, E3 ubiquitin ligase, p53, nucleus; LIGASE/ANTAGONIST |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 14.12 Å |
| Rg（电子密度） | 12.65 Å |
| 总 Rg | 14.08 Å |
| 原子数 | 743 |
| 残基数 | 86 |
| 排除体积 | 13396 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4j3ea_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.42 — SWIB/MDM2 domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.42.1 — SWIB/MDM2 domain |
| 家族 Family family | a.42.1.1 — SWIB/MDM2 domain |
| 结构域编号 domain_id | 4j3eA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 245 — MDM2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — SWIB/MDM2 domain |