Human immunodeficiency virus 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | ;(3R,3aS,3bR,6aS,7aS)-octahydrodifuro[2,3-b:3',2'-d]furan-3-yl [(1S,2R)-1-benzyl-2-hydroxy-3-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}propyl]carbamate ; × 2 IODIDE ION × 22 ACETATE ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | POL_HV1BR |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–99； UniProt 501–599 作者链 B； PDB构建体 1–99； UniProt 501–599 |
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| 条目编号 entry_id | 4j54 |
| 沉积日期 deposition_date | 2013-02-07 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of Multidrug Resistant HIV-1 Protease Clinical isolate PR20 with the potent antiviral inhibitor GRL-0519A |
| 关键词 keywords | ;multidrug resistant HIV-1 protease clinical isolate PR20, clinical inhibitor Amprenavir, potent antiviral inhibitor GRL-0519A, potent antiviral inhibitor GRL-02031, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex ;; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.66 Å |
| Rg（电子密度） | 17.51 Å |
| 总 Rg | 18.71 Å |
| 原子数 | 1593 |
| 残基数 | 198 |
| 排除体积 | 29253 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4j54a_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin) |
| 结构域编号 domain_id | d4j54b_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin) |
| 结构域编号 domain_id | 4j54A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |
| 结构域编号 domain_id | 4j54B00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |