SAXSdb — 4k6v

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fiber protein

Human adenovirus 37

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 177–365 链 B； UniProt 177–365 链 C； UniProt 177–365	片段：fiber knob	ZN ZINC ION × 3 18D 3,5-dideoxy-5-(propanoylamino)-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 1P4 3,3',3''-[nitrilotris(methanediyl-1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)]tripropan-1-ol × 1 ACT ACETATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；25% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.185

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4K6V	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1UXA ADENOVIRUS AD37 FIBRE HEAD in complex with sialyl-lactose 提交 2004-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 172–365（194 aa）片段：HEAD DOMAIN, RESIDUES 172-365 链 B 172–365（194 aa）片段：HEAD DOMAIN, RESIDUES 172-365 链 C 172–365（194 aa）片段：HEAD DOMAIN, RESIDUES 172-365	突变：YES 突变：YES 突变：YES	ZN ZINC ION × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；RESERVOIR: 24 % PEG8000, 50 MM ZINC ACETATE, 100 MM HEPES, PROTEIN: 30 MM TRIS-HCL, PH 7.5, 150 MM NACL	分辨率 1.50 Å R-free 0.205
1UXE ADENOVIRUS AD37 FIBRE HEAD 提交 2004-02-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 172–365（194 aa）片段：HEAD DOMAIN RESIDUES 172-365 链 B 172–365（194 aa）片段：HEAD DOMAIN RESIDUES 172-365 链 C 172–365（194 aa）片段：HEAD DOMAIN RESIDUES 172-365	突变：YES 突变：YES 突变：YES	ZN ZINC ION × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；RESERVOIR: 24 % PEG8000, 50 MM ZINC ACETATE, 100 MM HEPES, PH 7.5 PROTEIN: 30 MM TRIS-HCL, PH 7.5, 150 MM NACL	分辨率 2.00 Å R-free 0.241
2J12 Ad37 fibre head in complex with CAR D1 提交 2006-08-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 177–365（189 aa）片段：FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.50 Å R-free 0.169
2WGT Structure of human adenovirus serotype 37 fibre head in complex with a sialic acid derivative, O-Methyl 5-N-propaonyl-3,5-dideoxy-D- glycero-a-D-galacto-2-nonulopyranosylonic acid 提交 2009-04-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 177–365（189 aa）片段：FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365 链 B 177–365（189 aa）片段：FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365 链 C 177–365（189 aa）片段：FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365	未记录	18D 3,5-dideoxy-5-(propanoylamino)-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 25-27 % POLYETHYLENE GLYCOL 8000, 50 MM ZINC ACETATE, AND 100 MM HEPES PH 7.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
2WGU Structure of human adenovirus serotype 37 fibre head in complex with a sialic acid derivative, O-Methyl 5-N- methoxycarbonyl -3,5-dideoxy- D-glycero-a-D-galacto-2-nonulopyranosylonic acid 提交 2009-04-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 177–365（189 aa）片段：FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365 链 B 177–365（189 aa）片段：FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365 链 C 177–365（189 aa）片段：FIBRE HEAD, RESIDUES 177-365	未记录	42D 3,5-dideoxy-5-[(methoxycarbonyl)amino]-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；25-27 % POLYETHYLENE GLYCOL 8000, 50 MM ZINC ACETATE, AND 100 MM HEPES PH7.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.223
3N0I Crystal Structure of Ad37 fiber knob in complex with GD1a oligosaccharide 提交 2010-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 B 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 C 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；293 K；26% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1M HEPES, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.65 Å R-free 0.187
3QND crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor 提交 2011-02-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 B 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 C 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365	未记录	ZN ZINC ION × 3 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；26% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1 M HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
3QND crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor 提交 2011-02-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 F 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 G 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365	未记录	ZN ZINC ION × 4 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；26% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1 M HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
3QND crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor 提交 2011-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 B 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 C 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 E 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 F 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 G 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365	未记录	ZN ZINC ION × 7 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；26% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1 M HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
4K6T Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0385 提交 2013-04-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 177–365（189 aa）片段：fiber knob 链 B 177–365（189 aa）片段：fiber knob 链 C 177–365（189 aa）片段：fiber knob	未记录	SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 ZN ZINC ION × 7 ACT ACETATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CL CHLORIDE ION × 1 1P0 2,2',2''-[nitrilotris(methanediyl-1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)]triethanol × 1 MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；24% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.200
4K6T Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0385 提交 2013-04-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 177–365（189 aa）片段：fiber knob 链 F 177–365（189 aa）片段：fiber knob 链 G 177–365（189 aa）片段：fiber knob	未记录	SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 ZN ZINC ION × 7 ACT ACETATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 3 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；24% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.200
4K6U Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0386 提交 2013-04-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 177–365（189 aa）片段：fiber knob 链 B 177–365（189 aa）片段：fiber knob 链 C 177–365（189 aa）片段：fiber knob	未记录	ZN ZINC ION × 3 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 1P4 3,3',3''-[nitrilotris(methanediyl-1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)]tripropan-1-ol × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；293 K；26% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.222
4K6W Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0408 提交 2013-04-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 177–365（189 aa）片段：fiber knob 链 B 177–365（189 aa）片段：fiber knob 链 C 177–365（189 aa）片段：fiber knob	未记录	18D 3,5-dideoxy-5-(propanoylamino)-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid × 3 1P0 2,2',2''-[nitrilotris(methanediyl-1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)]triethanol × 1 ACT ACETATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；293 K；28% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.167
4XQA CRYSTAL STRUCTURE OF AD37 FIBER KNOB IN COMPLEX WITH TRIVALENT SIALIC ACID INHIBITOR ME0462 提交 2015-01-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 B 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 C 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365	未记录	ACT ACETATE ION × 4 ZN ZINC ION × 3 423 (1-{2-[bis(2-{4-[({(6R)-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]-beta-L-threo-hex-2-ulopyranonosyl}oxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethyl)amino]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl (6R)-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]-beta-L-threo-hex-2-ulopyranosidonic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；26% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate	分辨率 1.41 Å R-free 0.172
4XQB CRYSTAL STRUCTURE OF AD37 FIBER KNOB IN COMPLEX WITH TRIVALENT SIALIC ACID INHIBITOR ME0461 提交 2015-01-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 B 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365 链 C 177–365（189 aa）片段：UNP residues 177-365	未记录	425 2-(1-{2-[bis(2-{4-[2-({(6R)-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]-beta-L-threo-hex-2-ulopyranonosyl}oxy)ethyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethyl)amino]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)ethyl (6R)-5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]-beta-L-threo-hex-2-ulopyranosidonic acid × 1 ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；28% PEG 8000, 0.1M HEPES, 0.05M zinc acetate	分辨率 1.60 Å R-free 0.178
9FAH Human adenovirus type 37 fiber knob in complex with 4-O,5-N-diacetylneuraminic acid 提交 2024-05-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–365（365 aa）链 B 1–365（365 aa）链 C 1–365（365 aa）	未记录	ANA methyl 4-O-acetyl-5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosidonic acid × 3 ZN ZINC ION × 5 ACT ACETATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；26% PEG 8000, 0.1 M HEPES pH 6.9, 0.05 M zinc acetate	分辨率 1.65 Å R-free 0.190

共 13 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q64823_9ADEN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–194； UniProt 177–365 作者链 B； PDB构建体 6–194； UniProt 177–365 作者链 C； PDB构建体 6–194； UniProt 177–365

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4k6v
沉积日期 deposition_date	2013-04-16
结构标题 title	Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0407
关键词 keywords	adenovirus, fiber knob, protein carbohydrate interaction, carbohydrate mimic, multivalent ligand, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	24.22 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	22.76 Å
零角强度 I(0) i0	62306200.00
分子量 molecular_weight	63057.0 kDa
排除体积 excluded_volume	79344 Å³
包络体积 envelope_volume	90182 Å³
水化壳体积 shell_volume	31508 Å³
包络直径 envelope_diameter	72.5 Å
壳层 Rg shell_rg	31.08 Å
包络 Rg envelope_rg	22.98 Å
形状 Rg shape_rg	22.72 Å
总 Rg total_rg	23.81 Å
总原子数 total_atoms	4437
残基数 n_residues	552
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	70.9 Å
Rg (实空间) rg_real	24.00 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.26 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.2310e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.6350e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	24.05 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	62310000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9087
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	32.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.028
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.542
角度范围 angular_range	— – 0.3300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	11780000.0000
实空间数据点数 n_real_points	65
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.950; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.970; Smooth: 0.989

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fiber protein
分子量 formula_weight	21716.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	5136

GAMGSWNPKYDTRTLWTTPDTSPNCTIAQDKDSKLTLVLTKCGSQILANVSLIVVAGKYHIINNKTNPKIKSFTIKLLFNKNGVLLDNSNLGKAYWNFRSGNSNVSTAYEKAIGFMPNLVAYPKPSNSKKYARDIVYGTIYLGGKPDQPAVIKTTFNQETGCEYSITFNFSWSKTYENVEFETTSFTFSYIAQE

来源 Source

来源生物 organism	Human adenovirus 37
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	52275
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	3,5-dideoxy-5-(propanoylamino)-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid
分子量 formula_weight	323.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	3,3',3''-[nitrilotris(methanediyl-1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)]tripropan-1-ol
分子量 formula_weight	434.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	621

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d4k6va_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.1 — Adenovirus fiber protein 'knob' domain

结构域编号 domain_id	d4k6vb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.1 — Adenovirus fiber protein 'knob' domain

结构域编号 domain_id	d4k6vc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.1 — Adenovirus fiber protein 'knob' domain

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	4k6vA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenovirus pIV-related, attachment domain

结构域编号 domain_id	4k6vB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenovirus pIV-related, attachment domain

结构域编号 domain_id	4k6vC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenovirus pIV-related, attachment domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	61.320 Å
晶胞边长 b length_b	69.680 Å
晶胞边长 c length_c	74.780 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	94.43 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.500 Å
最低分辨率 resolution_low	45.960 Å
R 因子 r_factor	0.1345
R_work r_work	0.1338
R_free r_free	0.1846

fit	/app/data/saxs_computation/k6/4k6v/4k6v.fit
pddf	/app/data/pr_computation/k6/4k6v/4k6v.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/k6/4k6v/4k6v.dat

Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0407