4kfz

Crystal structure of LMO2 and anti-LMO2 VH complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

LMO-2

Homo sapiens

UniProt P25791

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Anti-LMO2 VH × 1 ZINC ION × 4 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Anti-LMO2 VH × 1 ZINC ION × 4 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 Anti-LMO2 VH × 6 ZINC ION × 24 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 Anti-LMO2 VH × 6 ZINC ION × 24 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RBTN2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–150; UniProt 9–158 作者链 B; PDB构建体 1–150; UniProt 9–158

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4kfz
沉积日期 deposition_date2013-04-28
结构标题 titleCrystal structure of LMO2 and anti-LMO2 VH complex
关键词 keywordsONCOPROTEIN, T-CELL LEUKEMIA, PROTO-ONCOGENE, TRANSCRIPTION, DEVELOPMENTAL PROTEIN, LIM domain, transcription factor, nucleus; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4kfz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4kfz__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4kfz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.96 Å
Rg(电子密度)22.71 Å
总 Rg23.25 Å
原子数2169
残基数273
排除体积38401 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4kfz__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4kfz__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 4kfz__assembly_3__model_1 dodecameric (12) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 4kfz__assembly_4__model_1 dodecameric (12) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd4kfzc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)
结构域编号 domain_idd4kfzd_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family familyb.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id4kfzA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cysteine Rich Protein
结构域编号 domain_id4kfzA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cysteine Rich Protein
结构域编号 domain_id4kfzB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cysteine Rich Protein
结构域编号 domain_id4kfzB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology110 — Cysteine Rich Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cysteine Rich Protein
结构域编号 domain_id4kfzC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id4kfzD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
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7. 引用文献 (1)