4kxf

Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 262.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NLR family CARD domain-containing protein 4

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
10	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–1024 链 F； UniProt 1–1024 链 H； UniProt 1–1024 链 L； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
11	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–1024 链 N； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
5	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
6	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
7	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
8	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
9	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–1024 链 P； UniProt 1–1024	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；1.65M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, 1% n-propyl formate., pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.20 Å R-free 0.266

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4KXF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3JBL Cryo-EM Structure of the Activated NAIP2/NLRC4 Inflammasome Reveals Nucleated Polymerization 提交 2015-09-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 B 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 C 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 D 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 E 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 F 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 G 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 H 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 I 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 J 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999 链 K 93–1024（932 aa）片段：UNP residues 93-1024, SEE REMARK 999	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 2 mM DTT；pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 Blot for one second before plunging；103 K；冷冻剂 ETHANE；Blotted for one second before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 4.70 Å R-free 0.383
5AJ2 Cryo electron tomography of the Naip5-Nlrc4 inflammasome 提交 2015-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–355（355 aa）片段：RESIDUES 1-355 链 B 356–580（225 aa）片段：RESIDUES 356-580 链 C 580–1024（445 aa）片段：RESIDUES 580-1024	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 100 MM NACL, 20 MM HEPES, 2MM BENZAMIDIN, 2MM DTT；pH 7.5；100 MM NACL, 20 MM HEPES, 2MM BENZAMIDIN, 2MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- LEICA EM GP, METHOD- 3 SECONDS BLOTTING,	分辨率 40.00 Å
6B5B Cryo-EM structure of the NAIP5-NLRC4-flagellin inflammasome 提交 2017-09-29	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–1024（1024 aa）链 C 1–1024（1024 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.20 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NLRC4_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024 作者链 D； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024 作者链 F； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024 作者链 H； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024 作者链 K； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024 作者链 L； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024 作者链 N； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024 作者链 P； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4kxf
沉积日期 deposition_date	2013-05-25
结构标题 title	Crystal structure of NLRC4 reveals its autoinhibition mechanism
关键词 keywords	Auto-inhibition, Muti-domain, Innate Immunity, Phosphorylation, ADP BINDING, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	74.79 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	74.62 Å
零角强度 I(0) i0	8855030000.00
分子量 molecular_weight	812180.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1022000 Å³
包络体积 envelope_volume	1554200 Å³
水化壳体积 shell_volume	175130 Å³
包络直径 envelope_diameter	270.2 Å
壳层 Rg shell_rg	72.63 Å
包络 Rg envelope_rg	72.53 Å
形状 Rg shape_rg	74.60 Å
总 Rg total_rg	74.67 Å
总原子数 total_atoms	57081
残基数 n_residues	7138
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	262.8 Å
Rg (实空间) rg_real	74.75 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.62 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.8550e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.1540e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	74.78 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	8855000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8593
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	87.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.302
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.342
角度范围 angular_range	— – 0.1050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	380000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	22
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.814; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.970; Smooth: 0.756

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NLR family CARD domain-containing protein 4
分子量 formula_weight	116966.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,B,D,F,H,L,N,P
原子数 atom_count	57081

MNFIRNNRRALIQRMGLTVTKQICDDLFALNVLNNQEANVIYCEPLEQEAARKIIHMTMQKGSAACNLFLKSLENWDYFVYQDLTGQNLSYQVTEEDLNVLAQNLKDLYNSPAFLNFYPLGEDIDIIFNLEKTFTEPIMWKKDHRHHRVEQLTLGSLLEALKSPCLIEGESGKGKSTLLQRIAMLWASGGCRALKGFRLVFFIHLRSARGGLFETLYDQLLNIPDFISKPTFKALLLKLHKEVLFLLDGYNEFHPQNCPEIEALIKENHRFKNMVIVTTTTECLRHIRHVGALTAEVGDMTEDSAKDLIEAVLVPDQVERLWAQIQESRCLRNLMKTPLFVVITCAIQMGRQEFQAHTQTMLFQTFYDLLIQKNSHRYRGGASGDFARSLDYCGDLALEGVFAHKFDFEPEHGSSMNEDVLVTIGLLCKYTAQRLKPTYKFFHKSFQEYTAGRRLSSLLTSKEPEEVSKGNSYLNKMVSISDITSLYGNLLLYTCGSSTEATRAVMRHLAMVYQHGSLQGLSVTKRPLWRQESIQSLRNTTEQDVLKAINVNSFVECGINLFSESMSKSDLSQEFEAFFQGKSLYINSENIPDYLFDFFEYLPNCASALDFVKLDFYERATESQDKAEENVPGVHTEGPSETYIPPRAVSLFFNWKQEFKTLEVTLRDINKLNKQDIKYLGKIFSSATNLRLHIKRCAAMAGRLSSVLRTCKNMHTLMVEASPLTTDDEQYITSVTGLQNLSIHRLHTQQLPGGLIDSLGNLKNLERLILDDIRMNEEDAKNLAEGLRSLKKMRLLHLTHLSDIGEGMDYIVKSLSEESCDLQEMKLVACCLTANSVKVLAQNLHNLIKLSILDISENYLEKDGNEALQELIGRLGVLGELTTLMLPWCWDVHTSLPKLLKQLEGTPGLAKLGLKNWRLRDEEIKSLGEFLEMNPLRDLQQLDLAGHCVSSDGWLYFMNVFENLKQLVFFDFSTEEFLPDAALVRKLSQVLSKLTLLQEVKLTGWEFDDYDISAIKGTFKLVTA

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id	4kxfB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4kxfB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1900 — c-terminal domain of poly(a) binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	4kxfB04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4kxfD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4kxfD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1900 — c-terminal domain of poly(a) binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	4kxfD04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4kxfF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4kxfF02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1900 — c-terminal domain of poly(a) binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	4kxfF04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4kxfH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4kxfH02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1900 — c-terminal domain of poly(a) binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	4kxfH04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4kxfK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4kxfK02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1900 — c-terminal domain of poly(a) binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	4kxfK04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4kxfL01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4kxfL02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1900 — c-terminal domain of poly(a) binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	4kxfL04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4kxfN01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4kxfN02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1900 — c-terminal domain of poly(a) binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	4kxfN04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4kxfP01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4kxfP02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1900 — c-terminal domain of poly(a) binding protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	4kxfP04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

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8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	334.052 Å
晶胞边长 b length_b	334.052 Å
晶胞边长 c length_c	177.567 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	64

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	39.326 Å
R 因子 r_factor	0.2280
R_work r_work	0.2260
R_free r_free	0.2656

fit	/app/data/saxs_computation/kx/4kxf/4kxf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/kx/4kxf/4kxf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/kx/4kxf/4kxf.dat