Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Protein SNA3 × 1 （P14359） Ubiquitin × 1 （P0CG48） | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Protein SNA3 × 1 （P14359） Ubiquitin × 1 （P0CG48） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | RSP5_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–432； UniProt 383–809 作者链 B； PDB构建体 6–432； UniProt 383–809 |
物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | E3 ubiquitin-protein ligase RSP5 × 1 （P39940） Ubiquitin × 1 （P0CG48） | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | E3 ubiquitin-protein ligase RSP5 × 1 （P39940） Ubiquitin × 1 （P0CG48） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SNA3_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–24； UniProt 104–127 作者链 D； PDB构建体 1–24； UniProt 104–127 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | E3 ubiquitin-protein ligase RSP5 × 1 （P39940） Protein SNA3 × 1 （P14359） | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | E3 ubiquitin-protein ligase RSP5 × 1 （P39940） Protein SNA3 × 1 （P14359） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | UBC_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 E； PDB构建体 9–83； UniProt 1–75 作者链 F； PDB构建体 9–83； UniProt 1–75 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 4lcd |
| 沉积日期 deposition_date | 2013-06-21 |
| 结构标题 title | Structure of an Rsp5xUbxSna3 complex: Mechanism of ubiquitin ligation and lysine prioritization by a HECT E3 |
| 关键词 keywords | Ligase, E3, Rsp5, NEDD4, Ubiquitin, HECT, Sna3, thioester, maleimide, crosslink, Ligase-protein binding complex; Ligase/protein binding |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.68 Å |
| Rg（电子密度） | 26.68 Å |
| 总 Rg | 27.39 Å |
| 原子数 | 4005 |
| 残基数 | 501 |
| 排除体积 | 70848 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4lcdA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 1750 — Hect, E3 ligase catalytic domain fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Hect, E3 ligase catalytic domains |
| 结构域编号 domain_id | 4lcdA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 2160 — Hect, E3 ligase catalytic domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Hect, E3 ligase catalytic domain |
| 结构域编号 domain_id | 4lcdA03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 2410 — Hect, E3 ligase catalytic fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Hect, E3 ligase catalytic domain |
| 结构域编号 domain_id | 4lcdB01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 1750 — Hect, E3 ligase catalytic domain fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Hect, E3 ligase catalytic domains |
| 结构域编号 domain_id | 4lcdB02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 2160 — Hect, E3 ligase catalytic domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Hect, E3 ligase catalytic domain |
| 结构域编号 domain_id | 4lcdB03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 2410 — Hect, E3 ligase catalytic fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Hect, E3 ligase catalytic domain |
| 结构域编号 domain_id | 4lcdE00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Ubiquitin-like (UB roll) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 4lcdF00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Ubiquitin-like (UB roll) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 |