Escherichia coli
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | (2E)-3-[2-(dihydroxyboranyl)-1-benzothiophen-3-yl]prop-2-enoic acid × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | (2E)-3-[2-(dihydroxyboranyl)-1-benzothiophen-3-yl]prop-2-enoic acid × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q9L5C8_ECOLX |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–263； UniProt 29–291 作者链 B； PDB构建体 1–263； UniProt 29–291 |
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| 条目编号 entry_id | 4len |
| 沉积日期 deposition_date | 2013-06-26 |
| 结构标题 title | CTX-M-9 in complex with the broad spectrum inhibitor 3-(2- carboxyvinyl)benzo(b)thiophene-2-boronic acid |
| 关键词 keywords | ;Binding Sites, structure base drug design, Drug Discovery, Molecular, Enzyme Inhibitors, beta lactamases, boronic acids, broad spectrum, bacterial resistance, double perturbation cycle analysis, thermodynamics, structure activity relationship, hydrolase-hydrolase inhibitor complex ;; hydrolase/hydrolase inhibitor |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.53 Å |
| Rg（电子密度） | 17.47 Å |
| 总 Rg | 18.38 Å |
| 原子数 | 1964 |
| 残基数 | 261 |
| 排除体积 | 34784 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4lena_ |
| 类 Class class | e — Multi-domain proteins (alpha and beta) |
| 折叠类型 Fold fold | e.3 — beta-lactamase/transpeptidase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | e.3.1 — beta-lactamase/transpeptidase-like |
| 家族 Family family | e.3.1.1 — beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase |
| 结构域编号 domain_id | d4lenb_ |
| 类 Class class | e — Multi-domain proteins (alpha and beta) |
| 折叠类型 Fold fold | e.3 — beta-lactamase/transpeptidase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | e.3.1 — beta-lactamase/transpeptidase-like |
| 家族 Family family | e.3.1.1 — beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase |
| 结构域编号 domain_id | 4lenA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 710 — Beta-lactamase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DD-peptidase/beta-lactamase superfamily |
| 结构域编号 domain_id | 4lenB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 710 — Beta-lactamase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DD-peptidase/beta-lactamase superfamily |