4lnv

Crystal Structure of TEP1s

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Thioester-containing protein I

Anopheles gambiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致
3	蛋白单体	单体	蛋白 1	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9GYW4_ANOGA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1317； UniProt 22–1338 作者链 B； PDB构建体 1–1317； UniProt 22–1338 作者链 C； PDB构建体 1–1317； UniProt 22–1338

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4lnv
沉积日期 deposition_date	2013-07-12
结构标题 title	Crystal Structure of TEP1s
关键词 keywords	immune system, innate immunity, LRIM1 and APL1C; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4lnv__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4lnv__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4lnv__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	40.38 Å
Rg（电子密度）	39.76 Å
总 Rg	40.13 Å
原子数	9729
残基数	1276
排除体积	172900 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4lnv__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4lnv__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4lnv__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Thioester-containing protein I
分子量 formula_weight	150693.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	27034

LLVVGPKFIRANQEYTLVISNFNSQLSKVDLLLKLEGETDNGLSVLNVTKMVDVRRNMNRMINFNMPEELTAGNYKITIDGQRGFSFHKEAELVYLSKSISGLIQVDKPVFKPGDTVNFRVILLDTELKPPARVKSVYVTIRDPQRNVIRKWSTAKLYAGVFESDLQIVPTPMLGVWNISVEVEGEELVSKTFEVKEYVLSTFDVQVMPSVIPLEEHQAVNLTIEANYHFGKPVQGVAKVELYLDDDKLNQKKELTVYGKGQVELRFDNFAMDADQQDVRVKVSFIEQYTNRTVVKQSQITVYRYAYRVELIKESPQFRPGLPFKCALQFTHHDGTPAKGITGKVEVSDVGFETTTTSDNDGLIKLELQPSEGTEQLGINFNAVDGFFFYEDVNKVETVTDAYIKLELKSPIKRNKLMRFMVTCTERMTFFVYYVMSKGNIIDAGFMRPNKQTKYLLQLNATEKMIPKAKILIATVAGRTVVYDYADLDFQELRNNFDLSIDEQEIKPGRQIELSMSGRPGAYVGLAAYDKALLLFNKNHDLFWEDIGQVFDGFHAINENEFDIFHSLGLFARTLDDILFDSANEKTGRNALQSGKPIGKLVSYRTNFQESWLWKNVSIGRSGSRKLIEVVPDTTTSWYLTGFSIDPVYGLGIIKKPIQFTTVQPFYIVENLPYSIKRGEAVVLQFTLFNNLGAEYIADVTLYNVANQTEFVGRPDTDLSYTKSVSVPPKVGVPISFLIKARKLGEMAVRVKASIMLGHETDALEKVIRVMPESLAQPKMDTSFFCFDDYKNQTFPFNLDINKKADNGSKKIEFRLNPNLLTMVIKNLDNLLAVPTGCGEQNMVKFVPNILVLDYLYATGSKEQHLIDKATNLLRQGYQNQMRYRQTDGSFGVWEKSGSSVFLTAFVATSMQTASKYMNDIDAAMVEKALDWLASKQHSSGRFDETGKVWHKDMQGGLRNGVALTSYVLTALLENDIAKVKHAVVIQNGMNYLSNQLAFINNPYDLSIATYAMMLNGHTMKKEALDKLIDMSISDNNKKERYWGTTNQIETTAYALLSFVMAEKYLDGIPVMNWLVNQRYVTGSFPRTQDTFVGLKALTKLAEKISPSRNDYTVQLKYKKNTKYFNINSEQIDVQNFLEIPEDTKKLEINVGGIGFGLLEVIYQFDLNLVNFEHRFKLDLEKQNTGSDYELRLRVCANYIPELTDSQSNMALIEVTLPSGYVVDRNPISEQTTVNPIQNMEIRYGGTSVVLYYYKMGTERNCFTVTAYRRFKVALKRPAYVVVYDYYNTNLNAIKVYEVDKQNVCEICEEEDCPAECHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Anopheles gambiae
通用名 common_name	African malaria mosquito
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7165
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	15

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 23 domains

CATH v4.4 (23 domains)

结构域编号 domain_id	4lnvA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1930 — Macroglobulin (MG2) domain

结构域编号 domain_id	4lnvA03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1940 —

结构域编号 domain_id	4lnvA05
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1930 — Macroglobulin (MG2) domain

结构域编号 domain_id	4lnvA06
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	130 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4lnvA07
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	4lnvA08
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1540 —

结构域编号 domain_id	4lnvA09
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology	10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4lnvA10
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	690 — Alpha-macroglobulin, receptor-binding domain

结构域编号 domain_id	4lnvB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1930 — Macroglobulin (MG2) domain

结构域编号 domain_id	4lnvB03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1940 —

结构域编号 domain_id	4lnvB04
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	130 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4lnvB05
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	4lnvB06
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1540 —

结构域编号 domain_id	4lnvB07
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology	10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4lnvB08
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	690 — Alpha-macroglobulin, receptor-binding domain

结构域编号 domain_id	4lnvC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1930 — Macroglobulin (MG2) domain

结构域编号 domain_id	4lnvC03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1940 —

结构域编号 domain_id	4lnvC05
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1930 — Macroglobulin (MG2) domain

结构域编号 domain_id	4lnvC06
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	130 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4lnvC07
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	4lnvC08
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1540 —

结构域编号 domain_id	4lnvC09
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology	10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	4lnvC10
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	690 — Alpha-macroglobulin, receptor-binding domain

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晶胞边长 a length_a	196.472 Å
晶胞边长 b length_b	196.472 Å
晶胞边长 c length_c	225.267 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 43
空间群编号 int_tables_number	78
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.700 Å
最低分辨率 resolution_low	49.120 Å
R 因子 r_factor	0.2388
R_work r_work	0.2368
R_free r_free	0.2765

Crystal Structure of TEP1s

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Thioester-containing protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4lnv__assembly_3__model_1

4lnv__assembly_3__model_1 | I(q)

4lnv__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 23 domains

CATH v4.4 (23 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of TEP1s

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Thioester-containing protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4lnv__assembly_3__model_1

4lnv__assembly_3__model_1 | I(q)

4lnv__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 23 domains

CATH v4.4 (23 domains)

7. 引用文献 (1)