4lsx

Plant steroid receptor ectodomain bound to brassinolide and SERK1 co-receptor ectodomain

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1

Arabidopsis thaliana

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 3	Somatic embryogenesis receptor kinase 1 × 1 （Q94AG2） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-4)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 Brassinolide × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 4	Somatic embryogenesis receptor kinase 1 × 1 （Q94AG2） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Brassinolide × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BRI1_ARATH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–765； UniProt 29–788 作者链 B； PDB构建体 6–765； UniProt 29–788

Somatic embryogenesis receptor kinase 1

Arabidopsis thaliana

UniProt Q94AG2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 3	Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1 × 1 （O22476） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-4)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 Brassinolide × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 4	Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1 × 1 （O22476） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Brassinolide × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SERK1_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 5–194； UniProt 24–213 作者链 D； PDB构建体 5–194； UniProt 24–213

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4lsx
沉积日期 deposition_date	2013-07-23
结构标题 title	Plant steroid receptor ectodomain bound to brassinolide and SERK1 co-receptor ectodomain
关键词 keywords	;LRR-domain, membrane signaling complex receptor co-receptor complex, brassinosteroid binding, N-glycosylation, STEROID BINDING PROTEIN-PROTEIN BINDING complex ;; STEROID BINDING PROTEIN/PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4lsx__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4lsx__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4lsx__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.96 Å
Rg（电子密度）	31.98 Å
总 Rg	32.66 Å
原子数	6840
残基数	895
排除体积	121700 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4lsx__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4lsx__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1
分子量 formula_weight	83726.6 kDa
突变 mutation	G643E
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	13920

GSSMGSQSLYREIHQLISFKDVLPDKNLLPDWSSNKNPCTFDGVTCRDDKVTSIDLSSKPLNVGFSAVSSSLLSLTGLESLFLSNSHINGSVSGFKCSASLTSLDLSRNSLSGPVTTLTSLGSCSGLKFLNVSSNTLDFPGKVSGGLKLNSLEVLDLSANSISGANVVGWVLSDGCGELKHLAISGNKISGDVDVSRCVNLEFLDVSSNNFSTGIPFLGDCSALQHLDISGNKLSGDFSRAISTCTELKLLNISSNQFVGPIPPLPLKSLQYLSLAENKFTGEIPDFLSGACDTLTGLDLSGNHFYGAVPPFFGSCSLLESLALSSNNFSGELPMDTLLKMRGLKVLDLSFNEFSGELPESLTNLSASLLTLDLSSNNFSGPILPNLCQNPKNTLQELYLQNNGFTGKIPPTLSNCSELVSLHLSFNYLSGTIPSSLGSLSKLRDLKLWLNMLEGEIPQELMYVKTLETLILDFNDLTGEIPSGLSNCTNLNWISLSNNRLTGEIPKWIGRLENLAILKLSNNSFSGNIPAELGDCRSLIWLDLNTNLFNGTIPAAMFKQSGKIAANFIAGKRYVYIKNDGMKKECHGAGNLLEFQGIRSEQLNRLSTRNPCNITSRVYEGHTSPTFDNNGSMMFLDMSYNMLSGYIPKEIGSMPYLFILNLGHNDISGSIPDEVGDLRGLNILDLSSNKLDGRIPQAMSALTMLTEIDLSNNNLSGPIPEMGQFETFPPAKFLNNPGLCGYPLPRCDPSNADGYAHHQRSHGRRLENLYFQGA

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	mouse-ear cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Somatic embryogenesis receptor kinase 1
分子量 formula_weight	21864.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

GSSMASANLEGDALHTLRVTLVDPNNVLQSWDPTLVNPCTWFHVTCNNENSVIRVDLGNAELSGHLVPELGVLKNLQYLELYSNNITGPIPSNLGNLTNLVSLDLYLNSFSGPIPESLGKLSKLRFLRLNNNSLTGSIPMSLTNITTLQVLDLSNNRLSGSVPDNGSFSLFTPISFANNLDLCGPVTSHPCPGSLENLYFQGA

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	mouse-ear cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	748.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-4)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	910.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	Brassinolide
分子量 formula_weight	480.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	4lsxA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4lsxA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	310 —

结构域编号 domain_id	4lsxB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4lsxB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	310 —

结构域编号 domain_id	4lsxC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	4lsxD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

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晶胞边长 a length_a	69.896 Å
晶胞边长 b length_b	69.896 Å
晶胞边长 c length_c	873.547 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 65
空间群编号 int_tables_number	170
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.302 Å
最低分辨率 resolution_low	48.530 Å
R 因子 r_factor	0.2484
R_work r_work	0.2463
R_free r_free	0.2848

Plant steroid receptor ectodomain bound to brassinolide and SERK1 co-receptor ectodomain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Somatic embryogenesis receptor kinase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4lsx__assembly_2__model_1

4lsx__assembly_2__model_1 | I(q)

4lsx__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

Plant steroid receptor ectodomain bound to brassinolide and SERK1 co-receptor ectodomain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Somatic embryogenesis receptor kinase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4lsx__assembly_2__model_1

4lsx__assembly_2__model_1 | I(q)

4lsx__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)