4m3b

Rapid and efficient design of new inhibitors of Mycobacterium tuberculosis transcriptional repressor EthR using fragment growing, merging and linking approaches

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HTH-type transcriptional regulator EthR

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P96222

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 4-(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)-N-(3,3,3-trifluoropropyl)benzamide × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ETHR_MYCTU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–216; UniProt 1–216

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4m3b
沉积日期 deposition_date2013-08-06
结构标题 titleRapid and efficient design of new inhibitors of Mycobacterium tuberculosis transcriptional repressor EthR using fragment growing, merging and linking approaches
关键词 keywords;helix-turn-helix DNA binding protein, TETR-family, transcriptional regulatory repressor, inhibitor, TRANSCRIPTION REPRESSOR-INHIBITOR complex ;; TRANSCRIPTION REPRESSOR/INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4m3b__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4m3b__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4m3b__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)23.24 Å
Rg(电子密度)22.35 Å
总 Rg23.19 Å
原子数2932
残基数370
排除体积52136 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4m3b__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd4m3ba1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamilya.4.1 — Homeodomain-like
家族 Family familya.4.1.9 — Tetracyclin repressor-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_idd4m3ba2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.121 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilya.121.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain
家族 Family familya.121.1.1 — Tetracyclin repressor-like, C-terminal domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id4m3bA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
结构域编号 domain_id4m3bA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology357 — Tetracycline Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Tetracycline Repressor, domain 2
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7. 引用文献 (1)