4mak

Crystal structure of a putative ssRNA endonuclease Cas2, CRISPR adaptation protein from E.coli

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CRISPR-associated endoribonuclease Cas2

Escherichia coli

UniProt P45956

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAS2_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94 作者链 B; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4mak
沉积日期 deposition_date2013-08-16
结构标题 titleCrystal structure of a putative ssRNA endonuclease Cas2, CRISPR adaptation protein from E.coli
关键词 keywordsCAS2, CRISPR, MCSG, PSI-BIOLOGY, Structural Genomics, Midwest Center for Structural Genomics, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4mak__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4mak__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4mak__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)16.29 Å
Rg(电子密度)14.87 Å
总 Rg16.07 Å
原子数1172
残基数149
排除体积21051 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4mak__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd4maka_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.58 — CRISPR associated protein Cas2-like
家族 Family familyd.58.58.1 — CRISPR associated protein Cas2-like
结构域编号 domain_idd4makb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.58 — CRISPR associated protein Cas2-like
家族 Family familyd.58.58.1 — CRISPR associated protein Cas2-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id4makA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily240
结构域编号 domain_id4makB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily240

7. 引用文献 (1)