4mjs

crystal structure of a PB1 complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein kinase C zeta type

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） water × 2	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） water × 2	与蛋白数一致
11	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） water × 2	与蛋白数一致
12	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sequestosome-1 × 1 （Q13501） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KPCZ_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 C； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 E； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 G； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 I； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 K； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 M； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 O； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 Q； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 S； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 U； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101 作者链 W； PDB构建体 5–91； UniProt 15–101

Sequestosome-1

Homo sapiens

UniProt Q13501

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） water × 2	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） water × 2	与蛋白数一致
11	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） water × 2	与蛋白数一致
12	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein kinase C zeta type × 1 （P09217） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SQSTM_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 D； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 F； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 H； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 J； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 L； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 N； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 P； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 R； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 T； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 V； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102 作者链 X； PDB构建体 5–104； UniProt 3–102

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4mjs
沉积日期 deposition_date	2013-09-04
结构标题 title	crystal structure of a PB1 complex
关键词 keywords	PB1 domain, PB1 heterodimer and protein interaction, TRANSFERASE-PROTEIN BINDING complex; TRANSFERASE/PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4mjs__assembly_5__model_1

Assembly 5 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4mjs__assembly_5__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4mjs__assembly_5__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.44 Å
Rg（电子密度）	17.25 Å
总 Rg	18.21 Å
原子数	1391
残基数	175
排除体积	24753 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4mjs__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4mjs__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4mjs__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`4mjs__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`4mjs__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`4mjs__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`4mjs__assembly_7__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`4mjs__assembly_8__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
9	1	`4mjs__assembly_9__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
10	1	`4mjs__assembly_10__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
11	1	`4mjs__assembly_11__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
12	1	`4mjs__assembly_12__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein kinase C zeta type
分子量 formula_weight	10287.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.13
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O,Q,S,U,W
原子数 atom_count	16823

GPHMRVRLKAHYGGDILITSVDPTTTFQDLCEEVRDMCGLHQQHPLTLKWVDSEGDPCTVSSQMELEEAFRLACQGRDEVLIIHVFPSIPE

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	brown rat,rat,rats
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Sequestosome-1
分子量 formula_weight	11542.2 kDa
突变 mutation	D69A,D71R
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P,R,T,V,X

GPHMSLTVKAYLLGKEDAAREIRRFSFCCSPEPEAEAEAAAGPGPCERLLSRVAALFPALRPGGFQAHYRAERGDLVAFSSDEELTMAMSYVKDDIFRIYIKEK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	397

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

结构域编号 domain_id	d4mjsa1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjsa2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjsc1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjsc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjse1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjse2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjsg1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjsg2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjsi1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjsi2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjsk1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjsk2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjsm1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjsm2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjso1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjso2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjsq1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjsq2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjss1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjss2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjsu1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjsu2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4mjsw1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.15.2 — CAD & PB1 domains
家族 Family family	d.15.2.2 — PB1 domain

结构域编号 domain_id	d4mjsw2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id	4mjsA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsM00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsN00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsO00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsQ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsR00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsS00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsT00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsU00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsV00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsW00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

结构域编号 domain_id	4mjsX00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

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晶胞边长 a length_a	85.715 Å
晶胞边长 b length_b	135.681 Å
晶胞边长 c length_c	259.559 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	39.534 Å
R 因子 r_factor	0.2402
R_work r_work	0.2378
R_free r_free	0.2871

crystal structure of a PB1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein kinase C zeta type

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Sequestosome-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4mjs__assembly_5__model_1

4mjs__assembly_5__model_1 | I(q)

4mjs__assembly_5__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (1)

crystal structure of a PB1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein kinase C zeta type

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Sequestosome-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4mjs__assembly_5__model_1

4mjs__assembly_5__model_1 | I(q)

4mjs__assembly_5__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (1)