SAXSdb — 4mjv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neuraminidase

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 4	(2E,5S,9R,10S)-10-(acetylamino)-2-imino-4-oxo-9-(pentan-3-yloxy)-1-thia-3-azaspiro[4.5]dec-6-ene-7-carboxylic acid × 4 CALCIUM ION × 4 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NRAM_I63A3
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–390； UniProt 81–470

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4mjv
沉积日期 deposition_date	2013-09-04
结构标题 title	Influenza Neuraminidase in complex with a novel antiviral compound
关键词 keywords	Neuraminidase, Sialidase, Viral Protein, hydrolase-hydrolase inhibitor complex; hydrolase/hydrolase inhibitor
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4mjv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4mjv__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4mjv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	34.75 Å
Rg（电子密度）	33.83 Å
总 Rg	34.44 Å
原子数	12204
残基数	1560
排除体积	214980 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4mjv__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Neuraminidase
分子量 formula_weight	43182.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.18
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3212

TYMNNTEAICDVKGFAPFSKDNGIRIGSRGHIFVIREPFVSCSPIECRTFFLTQGSLLNDKHSNGTVKDRSPFRTLMSVEVGQSPNVYQARFEAVAWSATACHDGKKWMTVGVTGPDSKAVAVIHYGGVPTDVVNSWAGDILRTQESSCTCIQGDCYWVMTDGPANRQAQYRIYKANQGRIIGQADISFNGGHIEECSCYPNDGKVECVCRDNWTGTNRPVLVISPDLSYRVGYLCAGIPSDTPRGEDAQFTGSCTSPMGNQGYGVKGFGFRQGTDVWMGRTISRTSRSGFEILRIKNGWTQTSKEQIRKQVVVDNLNWSGYSGSFTLPVELSGKDCLVPCFWVEMIRGKPEEKTIWTSSSSIVMCGVDYEVADWSWHDGAILPFDIDKM

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	(2E,5S,9R,10S)-10-(acetylamino)-2-imino-4-oxo-9-(pentan-3-yloxy)-1-thia-3-azaspiro[4.5]dec-6-ene-7-carboxylic acid
分子量 formula_weight	369.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	161

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4mjva_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.68 — 6-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.68.1 — Sialidases
家族 Family family	b.68.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4mjvA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	120 — 6 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Neuraminidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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晶胞边长 a length_a	90.744 Å
晶胞边长 b length_b	90.744 Å
晶胞边长 c length_c	112.002 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	I 4
空间群编号 int_tables_number	79
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.650 Å
最低分辨率 resolution_low	25.663 Å
R 因子 r_factor	0.2085
R_work r_work	0.2000
R_free r_free	0.2850

Influenza Neuraminidase in complex with a novel antiviral compound

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neuraminidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4mjv__assembly_1__model_1

4mjv__assembly_1__model_1 | I(q)

4mjv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Influenza Neuraminidase in complex with a novel antiviral compound

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neuraminidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4mjv__assembly_1__model_1

4mjv__assembly_1__model_1 | I(q)

4mjv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)