SAXSdb — 4mvd

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Choline-phosphate cytidylyltransferase A

Rattus norvegicus

UniProt P19836

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 4	[2-CYTIDYLATE-O'-PHOSPHONYLOXYL]-ETHYL-TRIMETHYL-AMMONIUM × 4	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 4	[2-CYTIDYLATE-O'-PHOSPHONYLOXYL]-ETHYL-TRIMETHYL-AMMONIUM × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PCY1A_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 21–332； UniProt 1–312 作者链 B； PDB构建体 21–332； UniProt 1–312 作者链 C； PDB构建体 21–332； UniProt 1–312 作者链 D； PDB构建体 21–332； UniProt 1–312 作者链 E； PDB构建体 21–332； UniProt 1–312 作者链 F； PDB构建体 21–332； UniProt 1–312 作者链 G； PDB构建体 21–332； UniProt 1–312 作者链 H； PDB构建体 21–332； UniProt 1–312

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4mvd
沉积日期 deposition_date	2013-09-23
结构标题 title	Crystal Structure of a Mammalian Cytidylyltransferase
关键词 keywords	;Rossmann Fold, Amphipathic helix, Four-helix bundle, Lipid Membrane Binding, Cytidine 5'-diphosphocholine synthesis, Phosphatidylcholine homeostasis, Lipid Membrane Surface, Endoplasmic Reticulum, Nucleus, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4mvd__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4mvd__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4mvd__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	66.08 Å
Rg（电子密度）	68.22 Å
总 Rg	67.72 Å
原子数	5128
残基数	1010
排除体积	82493 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4mvd__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4mvd__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Choline-phosphate cytidylyltransferase A
分子量 formula_weight	38061.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.15
突变 mutation	Deletion (313-367)
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,A,D,C,F,E,H,G
原子数 atom_count	10261

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMDAQSSAKVNSRKRRKEVPGPNGATEEDGIPSKVQRCAVGLRQPAPFSDEIEVDFSKPYVRVTMEEACRGTPCERPVRVYADGIFDLFHSGHARALMQAKNLFPNTYLIVGVCSDELTHNFKGFTVMNENERYDAVQHCRYVDEVVRNAPWTLTPEFLAEHRIDFVAHDDIPYSSAGSDDVYKHIKEAGMFAPTQRTEGISTSDIITRIVRDYDVYARRNLQRGYTAKELNVSFINEKKYHLQERVDKVKKKVKDVEEKSKEFVQKVEEKSIDLIQKWEEKSREFIGSFLEMFGPEGALKHMLKEGKGRMLQ

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	[2-CYTIDYLATE-O'-PHOSPHONYLOXYL]-ETHYL-TRIMETHYL-AMMONIUM
分子量 formula_weight	488.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

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晶胞边长 a length_a	107.780 Å
晶胞边长 b length_b	107.780 Å
晶胞边长 c length_c	575.710 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	P 43
空间群编号 int_tables_number	78
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	8.000 Å
最低分辨率 resolution_low	107.800 Å
R 因子 r_factor	0.3802
R_work r_work	0.3788
R_free r_free	0.4066

Crystal Structure of a Mammalian Cytidylyltransferase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Choline-phosphate cytidylyltransferase A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4mvd__assembly_2__model_1

4mvd__assembly_2__model_1 | I(q)

4mvd__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of a Mammalian Cytidylyltransferase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Choline-phosphate cytidylyltransferase A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4mvd__assembly_2__model_1

4mvd__assembly_2__model_1 | I(q)

4mvd__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

7. 引用文献 (1)