4nmt

CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(TFA-K-1) (ANSRWPTS[Tfa-acyl-K]I)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 60.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 284–370	片段：UNP RESIDUES 284-370	iCAL36(TFA-K-1) peptide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；33% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.198
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 284–370	片段：UNP RESIDUES 284-370	iCAL36(TFA-K-1) peptide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；33% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.198

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4NMT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2DC2 Solution Structure of PDZ Domain 提交 2005-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 278–373（96 aa）片段：PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.1；303 K；压力 1 NMR样品组成 1.0mM 15N, 13C-labeled GOPC PDZ domain, 10mM phosphate buffer (pH 6.1), 4mM EDTA, 10% (v/v) D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LOB PDZ Domain of CAL (Cystic Fibrosis Transmembrane Regulator-Associated Ligand) 提交 2012-01-20	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–370（85 aa）片段：PDZ domain residues 286-370	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；310 K；离子强度（mmCIF原始值）1.0；压力 ambient NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4E34 Crystal structure of CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to iCAL36 (ANSRWPTSII) peptide 提交 2012-03-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：PDZ domain (UNP residues 284-370)	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；30% w/v PEG8000, 0.3 M potassium bromide, 0.1 M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.197
4E34 Crystal structure of CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to iCAL36 (ANSRWPTSII) peptide 提交 2012-03-09	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：PDZ domain (UNP residues 284-370)	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；30% w/v PEG8000, 0.3 M potassium bromide, 0.1 M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.197
4E35 Crystal structure of CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to iCAL36-L (ANSRWPTSIL) peptide 提交 2012-03-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：PDZ domain (UNP residues 284-370)	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；30% w/v PEG8000, 0.15 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.198
4E35 Crystal structure of CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to iCAL36-L (ANSRWPTSIL) peptide 提交 2012-03-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：PDZ domain (UNP residues 284-370)	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；30% w/v PEG8000, 0.15 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.198
4JOE CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide A-iCAL36 (ANSRAPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；31% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 0.05 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.14 Å R-free 0.195
4JOE CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide A-iCAL36 (ANSRAPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；31% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 0.05 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.14 Å R-free 0.195
4JOF CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide L-iCAL36 (ANSRLPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.95；291 K；36% (w/v) polyethylene glycol (PEG)8000, 0.2 M sodium chloride, 0.01 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris) hydrochloride (HCl), pH 7.95, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.20 Å R-free 0.201
4JOF CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide L-iCAL36 (ANSRLPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.95；291 K；36% (w/v) polyethylene glycol (PEG)8000, 0.2 M sodium chloride, 0.01 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris) hydrochloride (HCl), pH 7.95, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.20 Å R-free 0.201
4JOG CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide V-iCAL36 (ANSRVPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；40% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.47 Å R-free 0.195
4JOG CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide V-iCAL36 (ANSRVPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；40% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.47 Å R-free 0.195
4JOH CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide H-iCAL36 (ANSRHPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；35% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.47 Å R-free 0.204
4JOH CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide H-iCAL36 (ANSRHPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；35% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.47 Å R-free 0.204
4JOJ CFTR Associated Ligand (CAL) domain bound to peptide F-iCAL36 (ANSRFPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；34% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.20 Å R-free 0.188
4JOJ CFTR Associated Ligand (CAL) domain bound to peptide F-iCAL36 (ANSRFPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；34% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.20 Å R-free 0.188
4JOK CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide Y-iCAL36 (ANSRYPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；34% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.05 M sodium chloride, 0.1 M Tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.09 Å R-free 0.186
4JOK CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide Y-iCAL36 (ANSRYPTSII) 提交 2013-03-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；34% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.05 M sodium chloride, 0.1 M Tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.09 Å R-free 0.186
4JOP CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ bound to HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide (TRRETQL) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：CAl PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；32% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.125 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4JOP CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ bound to HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide (TRRETQL) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：CAl PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；32% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.125 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4JOR CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to HPV18 E6 oncoprotein C-terminal peptide (RLQRRRETQV) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；29% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.075 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.34 Å R-free 0.181
4JOR CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to HPV18 E6 oncoprotein C-terminal peptide (RLQRRRETQV) 提交 2013-03-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：CAL PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；29% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.075 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.34 Å R-free 0.181
4K6Y CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36-Q (ANSRWQTSII) 提交 2013-04-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；35% (w/v) polyethylene glycol, 0.1 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.48 Å R-free 0.209
4K6Y CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36-Q (ANSRWQTSII) 提交 2013-04-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；35% (w/v) polyethylene glycol, 0.1 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.48 Å R-free 0.209
4K72 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36-VQD (ANSRVQDSII) 提交 2013-04-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；40% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 1000, 0.1 M sodium thiosulfate pentahydrate, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.227
4K72 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36-VQD (ANSRVQDSII) 提交 2013-04-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；40% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 1000, 0.1 M sodium thiosulfate pentahydrate, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.227
4K75 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36-QDTRL (ANSRWQDTRL) 提交 2013-04-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；40% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 1000, 0.09 M sodium thiosulfate pentahydrate, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.50 Å R-free 0.221
4K76 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36-TRL (ANSRWPTTRL) 提交 2013-04-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
4K76 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36-TRL (ANSRWPTTRL) 提交 2013-04-16	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
4K76 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36-TRL (ANSRWPTTRL) 提交 2013-04-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
4K76 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36-TRL (ANSRWPTTRL) 提交 2013-04-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å R-free 0.221
4K78 CFTR Associated Ligand (CAL) E317A PDZ domain bound to peptide iCAL36-QDTRL (ANSRWQDTRL) 提交 2013-04-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：PDZ domain	突变：E317A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；40% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.9 M sodium thiosulfate pentahydrate, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.221
4NMO CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(Ac-K-1)(ANSRWPTS[Ac-K]I) 提交 2013-11-15	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；27% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.203
4NMO CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(Ac-K-1)(ANSRWPTS[Ac-K]I) 提交 2013-11-15	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；27% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.203
4NMP CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(Ac-K-3) (ANSRWP[Ac-K]SII) 提交 2013-11-15	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；34% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 0.1 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.30 Å R-free 0.200
4NMP CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(Ac-K-3) (ANSRWP[Ac-K]SII) 提交 2013-11-15	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；34% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 0.1 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.30 Å R-free 0.200
4NMQ CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(Ac-K-4) (ANSRW[Ac-K]TSII) 提交 2013-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；40% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.199
4NMQ CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(Ac-K-4) (ANSRW[Ac-K]TSII) 提交 2013-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；40% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.199
4NMR CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(Ac-K-5) (ANSR[Ac-K]PTSII) 提交 2013-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；31% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris) pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100.0K	分辨率 1.55 Å R-free 0.219
4NMR CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(Ac-K-5) (ANSR[Ac-K]PTSII) 提交 2013-11-15	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；31% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris) pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100.0K	分辨率 1.55 Å R-free 0.219
4NMS CFTR Associated Ligand (CAL)PDZ domain bound to peptide iCAL36(FLB-K-1) (ANSRWPTS[4-fluorobenzoic-acyl-K]I) 提交 2013-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；33% (w/v) polyethylene glycol, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.70 Å R-free 0.207
4NMS CFTR Associated Ligand (CAL)PDZ domain bound to peptide iCAL36(FLB-K-1) (ANSRWPTS[4-fluorobenzoic-acyl-K]I) 提交 2013-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；33% (w/v) polyethylene glycol, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.70 Å R-free 0.207
4NMV CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(BRB-K-1) (ANSRWPTS[4-bromobenzoic-acyl-K]I) 提交 2013-11-15	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；31% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.1 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.202
4NMV CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(BRB-K-1) (ANSRWPTS[4-bromobenzoic-acyl-K]I) 提交 2013-11-15	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：UNP RESIDUES 284-370	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；31% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.1 M sodium chloride, 0.1 M tris(hydroxymethyl)aminomethane (Tris), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.40 Å R-free 0.202
4Q6H CFTR Associated Ligand (CAL) bound to last 6 residues of CFTR (decameric peptide: iCAL36VQDTRL) 提交 2014-04-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）	未记录	SO3 SULFITE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；37% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 1000, 0.07 M sodium thiosulfate pentahydrate, 0.1 M Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.222
4Q6S CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ bound to biotinylated peptide BT-L-iCAL36 提交 2014-04-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：unp residues 284-370	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.95；291 K；16% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.01 M Tris HCl pH 7.95, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.45 Å R-free 0.195
4Q6S CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ bound to biotinylated peptide BT-L-iCAL36 提交 2014-04-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：unp residues 284-370	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.95；291 K；16% (w/v) polyethylene glycol (PEG), 0.15 M sodium chloride, 0.01 M Tris HCl pH 7.95, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.45 Å R-free 0.195
5IC3 CAL PDZ domain with peptide and inhibitor 提交 2016-02-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：UNP residues 284-370	未记录	PQR 4-[methyl(nitroso)amino]benzene-1,2-diol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；35% PEG3350, 100mM NaCl, 100mM Tris pH7.4	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
5IC3 CAL PDZ domain with peptide and inhibitor 提交 2016-02-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：UNP residues 284-370	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；35% PEG3350, 100mM NaCl, 100mM Tris pH7.4	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
5K4F CAL PDZ mutant C319A with a peptide 提交 2016-05-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）片段：UNP residues 284-370	突变：C319A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；31% PEG3350, 125mM NaCl, 0.1M Tris7.5	分辨率 1.36 Å R-free 0.183
5K4F CAL PDZ mutant C319A with a peptide 提交 2016-05-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）片段：UNP residues 284-370	突变：C319A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；31% PEG3350, 125mM NaCl, 0.1M Tris7.5	分辨率 1.36 Å R-free 0.183
6OV7 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide kCAL01 提交 2019-05-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；6 mg/mL CAL PDZ, 1 mM kCAL01 peptide, 25% (w/v) PEG 8000, 5% PEG 400, 150 mM NaCl, and 100 mM Tris pH 8.5	分辨率 1.71 Å R-free 0.214
6OV7 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide kCAL01 提交 2019-05-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；6 mg/mL CAL PDZ, 1 mM kCAL01 peptide, 25% (w/v) PEG 8000, 5% PEG 400, 150 mM NaCl, and 100 mM Tris pH 8.5	分辨率 1.71 Å R-free 0.214
6V84 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptidomimetic LyCALAc 提交 2019-12-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；5.5 mg/mL CAL PDZ, 1 mM LyCALAc peptide, 35% (w/v) PEG 8000, 150 mM NaCl, 100 mM Tris pH 7.5	分辨率 1.64 Å R-free 0.213
6V84 CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptidomimetic LyCALAc 提交 2019-12-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；5.5 mg/mL CAL PDZ, 1 mM LyCALAc peptide, 35% (w/v) PEG 8000, 150 mM NaCl, 100 mM Tris pH 7.5	分辨率 1.64 Å R-free 0.213
6XNJ Crystal structure of the PDZ domain of human GOPC in complex with a peptide of E. coli O157:H7 str. Sakai effector NleG8 提交 2020-07-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 272–362（91 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.5 M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1 M Hepes pH 7.5, 2 mM peptide	分辨率 1.85 Å R-free 0.195
7JZO CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptidomimetic LyCALTPP 提交 2020-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 QTU 3-(thiophen-2-yl)propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；5.36 mg/mL CAL PDZ, 1 mM LyCALTPP, 31% (w/v) PEG 8000, 150 mM NaCl, 100 mM Tris pH 7.4	分辨率 1.61 Å R-free 0.205
7JZO CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptidomimetic LyCALTPP 提交 2020-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）	未记录	QTU 3-(thiophen-2-yl)propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；5.36 mg/mL CAL PDZ, 1 mM LyCALTPP, 31% (w/v) PEG 8000, 150 mM NaCl, 100 mM Tris pH 7.4	分辨率 1.61 Å R-free 0.205
7JZP CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptidomimetic LyCALBF 提交 2020-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）	未记录	BZ2 1-benzofuran-2-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；5.36 mg/mL CAL PDZ, 1 mM LyCALBF, 31% (w/v) PEG 8000, 200 mM NaCl, 100 mM Tris pH 7.4	分辨率 1.95 Å R-free 0.217
7JZP CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptidomimetic LyCALBF 提交 2020-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）	未记录	BZ2 1-benzofuran-2-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；5.36 mg/mL CAL PDZ, 1 mM LyCALBF, 31% (w/v) PEG 8000, 200 mM NaCl, 100 mM Tris pH 7.4	分辨率 1.95 Å R-free 0.217
7JZQ CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptidomimetic LyCALPMB 提交 2020-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）	未记录	VU1 4-[(piperidin-1-yl)methyl]benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；5.36 mg/mL CAL PDZ, 1 mM LyCALTPP, 31% (w/v) PEG 8000, 150 mM NaCl, 100 mM Tris pH 7.4	分辨率 1.35 Å R-free 0.185
7JZR CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptidomimetic LyCALAEB 提交 2020-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 284–370（87 aa）	未记录	VU4 4-(2-aminoethyl)benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；5.5 mg/mL CAL PDZ, 1 mM LyCALAEB, 30% (w/v) PEG 8000, 100 mM NaCl, 100 mM Tris pH 8.5	分辨率 1.54 Å R-free 0.208
7JZR CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptidomimetic LyCALAEB 提交 2020-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 284–370（87 aa）	未记录	VU4 4-(2-aminoethyl)benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；5.5 mg/mL CAL PDZ, 1 mM LyCALAEB, 30% (w/v) PEG 8000, 100 mM NaCl, 100 mM Tris pH 8.5	分辨率 1.54 Å R-free 0.208

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	GOPC_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–87； UniProt 284–370 作者链 B； PDB构建体 1–87； UniProt 284–370

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4nmt
沉积日期 deposition_date	2013-11-15
结构标题 title	CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(TFA-K-1) (ANSRWPTS[Tfa-acyl-K]I)
关键词 keywords	CAL, PIST, GOPC, FIG, CFTR, PDZ, PDZ-peptide, protein transport-inhibitor complex; protein transport/inhibitor
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.33 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	17.36 Å
零角强度 I(0) i0	8169920.00
分子量 molecular_weight	21066.0 kDa
排除体积 excluded_volume	26441 Å³
包络体积 envelope_volume	30333 Å³
水化壳体积 shell_volume	15177 Å³
包络直径 envelope_diameter	59.7 Å
壳层 Rg shell_rg	22.58 Å
包络 Rg envelope_rg	17.48 Å
形状 Rg shape_rg	17.37 Å
总 Rg total_rg	18.18 Å
总原子数 total_atoms	1483
残基数 n_residues	189
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	60.0 Å
Rg (实空间) rg_real	18.29 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.32 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.1700e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0900e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	18.30 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	8170000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8132
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	20.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.283
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.412
角度范围 angular_range	— – 0.4350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1437000.0000
实空间数据点数 n_real_points	75
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.856; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein
分子量 formula_weight	9353.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	1762

GPIRKVLLLKEDHEGLGISITGGKEHGVPILISEIHPGQPADRCGGLHVGDAILAVNGVNLRDTKHKEAVTILSQQRGEIEFEVVYV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	iCAL36(TFA-K-1) peptide
分子量 formula_weight	1256.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

ANSRWPTSKI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	225

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d4nmta_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.36 — PDZ domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.36.1 — PDZ domain-like
家族 Family family	b.36.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4nmtb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.36 — PDZ domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.36.1 — PDZ domain-like
家族 Family family	b.36.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	4nmtA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	42 — Pdz3 Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — PDZ domain

结构域编号 domain_id	4nmtB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	42 — Pdz3 Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — PDZ domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	35.986 Å
晶胞边长 b length_b	47.944 Å
晶胞边长 c length_c	97.454 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.400 Å
最低分辨率 resolution_low	19.500 Å
R 因子 r_factor	0.1811
R_work r_work	0.1802
R_free r_free	0.1980

fit	/app/data/saxs_computation/nm/4nmt/4nmt.fit
pddf	/app/data/pr_computation/nm/4nmt/4nmt.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/nm/4nmt/4nmt.dat

CFTR Associated Ligand (CAL) PDZ domain bound to peptide iCAL36(TFA-K-1) (ANSRWPTS[Tfa-acyl-K]I)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)