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4nod

Distinct structural features of TFAM drive mitochondrial DNA packaging versus transcriptional activation

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription factor A, mitochondrial

Homo sapiens

UniProt Q00059

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 5'-D(*TP*TP*GP*GP*GP*GP*TP*AP*TP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*TP*GP*GP*(BRU)P*TP*GP*G)-3' × 1 5'-D(*CP*CP*AP*AP*CP*CP*AP*AP*GP*CP*CP*CP*CP*AP*TP*AP*CP*CP*CP*CP*AP*A)-3' × 1 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 5'-D(*TP*TP*GP*GP*GP*GP*TP*AP*TP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*TP*GP*GP*(BRU)P*TP*GP*G)-3' × 1 5'-D(*CP*CP*AP*AP*CP*CP*AP*AP*GP*CP*CP*CP*CP*AP*TP*AP*CP*CP*CP*CP*AP*A)-3' × 1 与全部聚合物一致
3 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 5'-D(*TP*TP*GP*GP*GP*GP*TP*AP*TP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*TP*GP*GP*(BRU)P*TP*GP*G)-3' × 1 5'-D(*CP*CP*AP*AP*CP*CP*AP*AP*GP*CP*CP*CP*CP*AP*TP*AP*CP*CP*CP*CP*AP*A)-3' × 1 与全部聚合物一致
4 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 5'-D(*TP*TP*GP*GP*GP*GP*TP*AP*TP*GP*GP*GP*GP*CP*TP*TP*GP*GP*(BRU)P*TP*GP*G)-3' × 1 5'-D(*CP*CP*AP*AP*CP*CP*AP*AP*GP*CP*CP*CP*CP*AP*TP*AP*CP*CP*CP*CP*AP*A)-3' × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
3fgh

共 1 个 assembly

同源二聚体
3fgh

共 1 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
3tmm 3tq6 3tq6 4nnu 4nnu 4nnu 4nod 4nod 4nod 4nod 6erp 6erp

共 29 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TFAM_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 36–230； UniProt 43–237 作者链 B； PDB构建体 36–230； UniProt 43–237 作者链 G； PDB构建体 36–230； UniProt 43–237 作者链 H； PDB构建体 36–230； UniProt 43–237

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4nod
沉积日期 deposition_date2013-11-19
结构标题 titleDistinct structural features of TFAM drive mitochondrial DNA packaging versus transcriptional activation
关键词 keywordsHMG, DNA bending, TFB2M, mtRNAP, BrU substitution to HSP1, T19, TRANSCRIPTION REGULATOR-DNA complex; TRANSCRIPTION REGULATOR/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4nod__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4nod__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4nod__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）24.28 Å
Rg（电子密度）24.77 Å
总 Rg25.15 Å
原子数2497
残基数233
排除体积41664 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4nod__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4nod__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 4nod__assembly_3__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 4nod__assembly_4__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id4nodA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology30 — DNA Binding (I), subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — High mobility group box domain
结构域编号 domain_id4nodA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology30 — DNA Binding (I), subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — High mobility group box domain
结构域编号 domain_id4nodB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology30 — DNA Binding (I), subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — High mobility group box domain
结构域编号 domain_id4nodB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology30 — DNA Binding (I), subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — High mobility group box domain
结构域编号 domain_id4nodG01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology30 — DNA Binding (I), subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — High mobility group box domain
结构域编号 domain_id4nodG02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology30 — DNA Binding (I), subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — High mobility group box domain
结构域编号 domain_id4nodH01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology30 — DNA Binding (I), subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — High mobility group box domain
结构域编号 domain_id4nodH02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology30 — DNA Binding (I), subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — High mobility group box domain
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7. 引用文献 (1)