Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | 无其他共同聚合物 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | RAD53_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–347； UniProt 170–512 作者链 B； PDB构建体 5–347； UniProt 170–512 |
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| 条目编号 entry_id | 4pdp |
| 沉积日期 deposition_date | 2014-04-19 |
| 结构标题 title | Crystal structure of Rad53 kinase domain and SCD2 |
| 关键词 keywords | Ser/Thr kinase domain, N-lobe, C-lobe, activation segment exchange, TRANSFERASE; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 28.50 Å |
| Rg（电子密度） | 27.36 Å |
| 总 Rg | 28.00 Å |
| 原子数 | 3882 |
| 残基数 | 530 |
| 排除体积 | 69072 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4pdpA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 200 — Phosphorylase Kinase; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Phosphorylase Kinase; domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 4pdpA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 4pdpB01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 200 — Phosphorylase Kinase; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Phosphorylase Kinase; domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 4pdpB02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1 |