Pyrococcus furiosus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | CHLORIDE ION × 9 IMIDAZOLE × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | AGOG_PYRFU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 10–250； UniProt 2–242 |
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| 条目编号 entry_id | 4pii |
| 沉积日期 deposition_date | 2014-05-08 |
| 结构标题 title | Crystal structure of hypothetical protein PF0907 from pyrococcus furiosus solved by sulfur SAD using Swiss light source data |
| 关键词 keywords | SULFUR SAD, SOUTHEAST COLLABORATORY FOR STRUCTURAL GENOMICS, STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION, SECSG; UNKNOWN FUNCTION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.60 Å |
| Rg（电子密度） | 17.35 Å |
| 总 Rg | 18.50 Å |
| 原子数 | 1918 |
| 残基数 | 239 |
| 排除体积 | 34760 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4piia_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.96 — DNA-glycosylase |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.96.1 — DNA-glycosylase |
| 家族 Family family | a.96.1.6 — AgoG-like |
| 结构域编号 domain_id | 4piiA01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1670 — Endonuclease Iii, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Helix-hairpin-Helix base-excision DNA repair enzymes (C-terminal) |
| 结构域编号 domain_id | 4piiA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 340 — Endonuclease III; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Hypothetical protein; domain 2 |